[發明專利]生物標志物在預測肝癌預后中的應用

在審

• 申請號: 202110725182.9
• 申請日: 2021-06-29
• 公開（公告）號: CN113450917A
• 公開（公告）日: 2021-09-28
• 發明（設計）人: 楊承剛;宋宏濤;董東
• 申請（專利權）人: 北京泱深生物信息技術有限公司
• 主分類號: G16H50/30
• 分類號: G16H50/30;G16H50/50
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發明涉及生物標志物在預測肝癌預后中的應用。所述的生物標志物包括DUSP5、KIAA0907、METTL5。本發明提供了檢測所述生物標志物表達水平的試劑在制備預測肝癌預后的產品中的應用。本發明還提供了一種預測肝癌預后的裝置。

技術領域

本發明屬于生物醫藥領域，具體涉及生物標志物在預測肝癌預后中的應用。

背景技術

預后是指根據經驗預測的疾病發展情況。預后主要涉及到三個方面，將發生什么結果、發生不良結果的可能性以及時間點。研究和評級預后的目的，在于便于了解疾病對人類危害性的大小、探索影響預后的因素、研究改善預后的具體措施。預后分析是臨床非常實用、對臨床很有指導作用的臨床研究。

肝臟是維持機體內環境穩定和機體健康的最重要的器官之一，脂肪肝、肝炎、肝硬化和肝癌是肝內最常見的四大嚴重疾病，也是危害人類健康的重要原因之一。事實上，每年大約有一百萬人死于肝硬化和肝癌。特別需要指出的是，作為肝臟最常見的原發惡性腫瘤一肝癌因為發病率較高、發現困難、治療方法少等原因已經在導致人類死亡的各種疾病中位居前列。目前，肝癌在全球范圍內腫瘤致死率方面位列第五位，而在一些非洲和亞洲國家，肝癌在腫瘤性死因中已經位居首位。

經過幾十年的努力，肝癌研究已取得很大進展，上世紀以“小肝癌的早治”及“肝癌的縮小后二期切除”為標志，分別為肝癌術后生存率的提高貢獻了10個百分點，但由于肝癌病程進展速度快，有極高的復發率，致使肝癌總體療效仍然不佳，肝癌人群總體5年生存率仍只有5％左右。近年，雖然在肝癌基礎與臨床研究方面取得了一些進展，但還未能明確闡明肝癌復發的機制，也未能找到有效的干預措施。肝癌高復發成為影響其療效改善的瓶頸。

生物標志物是一種能客觀測量并評價正常生物過程、病理過程或對藥物干預反應的指示物，也是生物體受到損害時的重要預警指標，涉及細胞分子結構和功能的變化，生化代謝過程的變化，生理活動的異常表現，個體、群體或整個生態系統的異常變化等。生物標志物的研究不僅是生物化學基礎研究的重要內容，同時在新藥開發、醫學診斷、臨床研究方面具有重要的價值，有助于幫助研究人員提出更有效的診療手段，尤其在腫瘤、心血管疾病、糖尿病、神經性失調等慢性疾病與復雜疾病的防控上具有重要的價值。因此，尋找與肝癌預后復發相關的生物標志物，可以為進一步降低臨床肝癌復發率和病死率提供新的方法。

發明內容

本發明提供了一種肝癌預后模型的構建方法，所述構建方法包括：

獲取多個肝癌患者和多個參考人的轉錄譜表達數據；

基于所述多個肺癌患者和所述多個參考人的轉錄譜表達數據，篩選候選基因；以及

基于所述候選基因，構建風險評分模型；

其中，所述肺癌預后模型包括所述風險評分模型。

進一步，基于所述候選基因，構建風險評分模型，包括：

獲取訓練數據集；

在所述訓練數據集中，基于所述候選基因，通過單因素Cox回歸分析，確定與生存期相關的基因；以及

通過LASSO Cox回歸分析對所述與生存期相關的基因進行篩選，以確定用于構建所述風險評分模型的基因以及所述風險評分模型，其中，用于構建所述風險評分模型的基因包括DUSP5、KIAA0907、METTL5。

進一步，所述風險評分模型表示為：風險評分＝0.11709285*DUSP5基因表達水平+0.28319282*KIAA0907基因表達水平+0.42388281*METTL5基因表達水平。

進一步，基于所述候選基因，構建所述風險評分模型，還包括：基于所述訓練數據集，評估所述風險評分模型的預測性能。

進一步，基于所述訓練數據集，評估所述風險評分模型的預測性能，包括：