[發明專利]藥物分子結構預測方法、裝置、設備及存儲介質

有效

• 申請號: 202110716346.1
• 申請日: 2021-06-25
• 公開（公告）號: CN113436689B
• 公開（公告）日: 2022-04-29
• 發明（設計）人: 洪振厚;王健宗;瞿曉陽
• 申請（專利權）人: 平安科技（深圳）有限公司
• 主分類號: G16C20/50
• 分類號: G16C20/50;G06F16/36;G06F16/35
• 代理公司: 深圳市精英專利事務所 44242
• 代理人: 李翔宇

1.一種藥物分子結構預測方法，其特征在于，包括：

從預設的藥物數據庫中獲取樣本藥物的分子結構信息，其中，所述分子結構信息包括所述樣本藥物的官能團；

根據所述樣本藥物的分子結構信息構建藥物結構知識圖譜，其中，所述藥物結構知識圖譜的節點為所述樣本藥物的官能團；

接收用戶輸入的藥物設計要素，其中，所述藥物設計要素包括功能官能團以及官能團的數量范圍；

根據所述藥物設計要素在所述藥物結構知識圖譜中獲取節點序列，其中，所述節點序列包含所述功能官能團，所述節點序列包含的官能團的數量在所述官能團的數量范圍內；

獲取所述節點序列的節點向量，并將所述節點向量輸入到預訓練的文本分類模型中以得到所述節點序列的標簽，所述標簽用于指示所述節點序列對應的藥物分子結構的穩定性；

若所述節點序列的標簽為預設的目標標簽，向用戶輸出所述節點序列對應的藥物分子結構。

2.根據權利要求1所述的藥物分子結構預測方法，其特征在于，所述根據所述樣本藥物的分子結構信息構建藥物結構知識圖譜，包括：

將所述樣本藥物的官能團作為所述藥物結構知識圖譜的節點添加到所述藥物結構知識圖譜的節點集合中；

逐一判斷所述樣本藥物的任意兩個官能團之間是否存在化學鍵；

若所述樣本藥物的兩個官能團之間存在化學鍵，則在該兩個官能團之間建立邊，并將該兩個官能團的邊添加到所述藥物結構知識圖譜的邊集合中。

3.根據權利要求2所述的藥物分子結構預測方法，其特征在于，所述根據所述藥物設計要素在所述藥物結構知識圖譜中獲取節點序列，包括：

在所述藥物結構知識圖譜中，從所述功能官能團出發，沿著所述功能官能團與其它節點之間的邊進行隨機游走，得到節點序列；其中，隨機游走的次數在所述官能團的數量范圍內。

4.根據權利要求2所述的藥物分子結構預測方法，其特征在于，所述根據所述藥物設計要素在所述藥物結構知識圖譜中獲取節點序列，包括：

在所述藥物結構知識圖譜中，從所述功能官能團出發，沿著所述功能官能團與其它節點之間的邊進行游走，得到節點序列；其中，游走的次數在所述官能團的數量范圍內，在游走過程中，返回到原來節點的概率為預設的返回概率參數，不返回到原來節點的概率為預設的離開概率參數。

5.根據權利要求3或4任一項所述的藥物分子結構預測方法，其特征在于，所述獲取所述節點序列的節點向量，包括：

對所述節點序列進行分詞處理以得到分詞集合；

對所述分詞集合的詞語進行詞向量訓練以得到所述分詞集合的詞語的詞向量；

將所述分詞集合的詞語的詞向量輸入到預設的RNN模型中進行編碼，以輸出所述節點序列的節點向量。

6.根據權利要求1所述的藥物分子結構預測方法，其特征在于，所述方法還包括：

若所述節點序列的標簽不是預設的目標標簽，返回所述根據所述藥物設計要素在所述藥物結構知識圖譜中獲取節點序列的步驟，直到所述節點序列的標簽為預設的目標標簽為止。

7.根據權利要求1所述的藥物分子結構預測方法，其特征在于，所述根據所述樣本藥物的分子結構信息構建藥物結構知識圖譜之前，所述方法還包括：

對所述樣本藥物的分子結構信息進行數據清洗處理，以得到所述樣本藥物數據清洗后的分子結構信息。