[發(fā)明專利]一種用于遲緩愛德華氏菌檢測(cè)的基因芯片探針組

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202110709487.0
• 申請(qǐng)日: 2021-06-25
• 公開（公告）號(hào): CN113249506B
• 公開（公告）日: 2022-11-08
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 侯進(jìn)慧;李同祥;黃天姿
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 徐州工程學(xué)院
• 主分類號(hào): C12Q1/689
• 分類號(hào): C12Q1/689;C12Q1/6837;C12Q1/10;C12N15/11;C12R1/01
• 代理公司: 北京東方盛凡知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11562
• 代理人: 賈耀淇

1.一種用于遲緩愛德華氏菌檢測(cè)的基因芯片探針組，其特征在于，包括捕獲探針ET-CP、檢測(cè)探針ET-DP、滾環(huán)探針ET-RCP，其中所述檢測(cè)探針ET-DP是由ET-DPA，ET-DPB和ET-DPC按照5’-3’方向依次連接而成；

所述捕獲探針ET-CP和所述檢測(cè)探針ET-DP序列包括如下任意一組所示的序列：

(1)ET-CP1：5’-NH2-TTTTTTTGCGTCGATCTGATTAGCCA-3’；

ET-DP1：5’-CCTGCTGGGAGTTTCTGGATGTCAGAACACACGGGATACAGGA-3’，其中，ET-DP1A：CCTGCTGGGAGTTTCTG與遲緩愛德華氏菌基因組DNA互補(bǔ)；ET-DP1B：GATGTC；ET-DP1C：AGAACACACGGGATACAGGA，且與所述滾環(huán)探針ET-RCP的5’端和3’端序列互補(bǔ)，同時(shí)是所述滾環(huán)探針ET-RCP的引物和連接區(qū)域；

(2)ET-CP2:5’-NH2-TTTTTTTCCTTAATCACGTCGAG-3’；

ET-DP2：5’-CTCCCCTTTATCCAGC-ACTTAC-AGAACACACGGGATACAGGA-3’，其中，ET-DP2A：CTCCCCTTTATCCAGC與遲緩愛德華氏菌基因組DNA互補(bǔ)；ET-DP2B：ACTTAC；ET-DP2C：AGAACACACGGGATACAGGA，且與所述滾環(huán)探針ET-RCP的5’端和3’端序列互補(bǔ)，同時(shí)是所述滾環(huán)探針ET-RCP的引物和連接區(qū)域；

(3)ET-CP3：5’-NH2-TTTTTTTCATGGTCTTCTGGATCTGCA-3’；

ET-DP3：5’-GCTGCGCCTGGGTGACGA-GATGTC-AGAACACACGGGATACAGGA-3’；其中，ET-DP3A：GCTGCGCCTGGGTGACGA與遲緩愛德華氏菌基因組DNA互補(bǔ)；ET-DP3B：GATGTC；ET-DP3C：AGAACACACGGGATACAGGA，且與所述滾環(huán)探針ET-RCP的5’端和3’端序列互補(bǔ)，同時(shí)是所述滾環(huán)探針ET-RCP的引物和連接區(qū)域；

(4)ET-CP4：5’-NH2-GCGTCGATCTGATTAGCCA-3’；

ET-DP4：5’-CAGACGTTATAGGACTG-ACTTAC-AGAACACACGGGATACAGGA-3’；其中，ET-DP4A：CAGACGTTATAGGACTG與遲緩愛德華氏菌基因組DNA互補(bǔ)；ET-DP4B：ACTTAC；ET-DP4C：AGAACACACGGGATACAGGA，且與所述滾環(huán)探針ET-RCP的5’端和3’端序列互補(bǔ)，同時(shí)是所述滾環(huán)探針ET-RCP的引物和連接區(qū)域；

所述滾環(huán)探針ET-RCP：5’-CGTGTGTTCTATTCTACTGTATTCTGTATGTCTCCGTCTGCCTGTCACCTGTGTATCTTTGTCCCGTCAGTCCTGTATCC-3’，其中所述滾環(huán)探針ET-RCP 5’和3’序列與所述ET-DP1C、ET-DP2C、ET-DP3C和ET-DP4C序列互補(bǔ)；

所述ET-CP1、ET-CP2、ET-CP3、ET-CP4序列與遲緩愛德華氏菌基因組DNA互補(bǔ)；所述ET-DP1A、ET-DP2A、ET-DP3A、ET-DP4A序列與遲緩愛德華氏菌基因組DNA互補(bǔ)；ET-CP系列探針中的ET-CP1、ET-CP2、ET-CP3、ET-CP4序列，與ET-DP系列探針中的ET-DP1A、ET-DP2A、ET-DP3A、ET-DP4A序列在遲緩愛德華氏菌基因組DNA存在時(shí)，相應(yīng)的在T4 DNA連接酶作用下連接。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因芯片探針組，其特征在于，所述基因芯片探針組還包括陰性對(duì)照探針ET-NC和陽(yáng)性對(duì)照探針ET-PC，ET-NC和ET-PC序列不含有與遲緩愛德華氏菌基因組DNA序列互補(bǔ)的序列。