[發明專利]一種應用于二代感染宏基因組檢測的臨床樣本處理方法有效
| 申請號： | 202110682406.2 | 申請日： | 2021-06-19 |
| 公開（公告）號： | CN113322304B | 公開（公告）日： | 2022-06-07 |
| 發明（設計）人： | 陳陽;卜范峰;丁然;姜瑞凡;張付康;任用;李詩濛 | 申請（專利權）人： | 江蘇先聲醫學診斷有限公司;江蘇先聲診斷技術有限公司;南京先聲診斷技術有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6806 | 分類號： | C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12Q1/04;C40B50/06 |
| 代理公司： | 暫無信息 | 代理人： | 暫無信息 |
| 地址： | 210042 江蘇省南京*** | 國省代碼： | 江蘇;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 應用于 二代 感染 宏基 檢測 臨床 樣本 處理 方法 | ||
【權利要求書】：
1.一種應用于二代感染宏基因組檢測的臨床樣本的處理方法，其特征在于，包括如下步驟：
1）樣品預處理步驟：
取感染樣本離心處理，保留部分上清及沉淀；
對于非粘稠類感染樣本，取1-2mL樣本，12,000-14,000g離心3-5min，吸去上清，并留部分上清及沉淀在離心管中備用；
對于粘稠類感染樣本，取100-200μL樣本加入解稠劑或PBS，渦旋震蕩，40-42℃、300-400rpm震蕩孵育10-15 min，然后12,000-14,000 g離心3-5min，吸去上清，并留部分上清及沉淀在離心管中備用；
2）樣品溶菌破壁步驟：
預處理后樣本加入溶菌酶，所述溶菌酶在反應體系中的終濃度大于1mg/mL，35-37℃溫育10-15min；
溫育后樣本加入MP Lysing Matri E管中，GB裂解液裂解；MP破壁儀上5-6m/s震蕩60-120s，1-2次；再將 MP Lysing Matri E管12,000-14,000g 低溫離心3-8min，儲存備用；
所述感染樣本為肺泡灌洗液或痰液。
2.一種二代感染宏基因組建庫方法，其特征在于，包括權利要求1所述的處理方法，以及進一步包括核酸提取和文庫構建步驟。
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