[發(fā)明專利]一種基于標簽校正的元學習細胞核分割系統(tǒng)及方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110651067.1 | 申請日: | 2021-06-10 |
| 公開(公告)號: | CN113450363B | 公開(公告)日: | 2023-05-02 |
| 發(fā)明(設計)人: | 李辰;時江波;高澤宇;鮑鑫睿 | 申請(專利權)人: | 西安交通大學 |
| 主分類號: | G06T7/10 | 分類號: | G06T7/10 |
| 代理公司: | 西安通大專利代理有限責任公司 61200 | 代理人: | 閔岳峰 |
| 地址: | 710049 *** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 標簽 校正 學習 細胞核 分割 系統(tǒng) 方法 | ||
1.一種基于標簽校正的元學習細胞核分割方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟一:
對于一張原始的病理圖片以及其相應部分噪聲標注,利用該部分噪聲標注數(shù)據(jù)訓練一個分割網(wǎng)絡,該分割網(wǎng)絡對原始的病理圖片進行初步預測,根據(jù)初始預測掩膜將所有的連通域提取出,之后,進行像素級掩膜校正;
步驟二:
對于步驟一提取的每個連通域噪聲標注和相應原圖,采用基于標簽校正的元學習思想,以全卷積形式設計一個標簽校正網(wǎng)絡,在總樣本數(shù)百分之五標注的輔助下,通過該標簽校正網(wǎng)絡完成對噪聲標簽的校正,監(jiān)督分割網(wǎng)絡的訓練;用D={x,y}m表示少量干凈數(shù)據(jù)樣本,D′={x,y′}M表示含有噪聲標注的數(shù)據(jù)樣本;其中,M,m表示噪聲和干凈樣本的數(shù)量,y′表示噪聲樣本標簽,分割網(wǎng)絡參數(shù)化為帶有參數(shù)W的函數(shù),y=fW(x),標簽校正網(wǎng)絡形式化為帶有參數(shù)θ的函數(shù),yc=gθ(h(x),y′);其中,h(x)表示分割網(wǎng)絡輸出的特征圖,yc表示標簽校正網(wǎng)絡校正后的標簽;將分割網(wǎng)絡和標簽校正網(wǎng)絡的訓練當做一個雙向優(yōu)化的過程;當標簽校正網(wǎng)絡參數(shù)θ固定的時候,通過最小化(1)式的目標函數(shù)得到最優(yōu)的W參數(shù);
通過含有總樣本數(shù)百分之五干凈樣本的元數(shù)據(jù)集和確定的分割網(wǎng)絡最優(yōu)參數(shù)最優(yōu)化(2)式目標函數(shù)得到最優(yōu)的θ值;
在實際的訓練過程中,采用雙向優(yōu)化的方法,交替更新W和θ的值;
為了獲得最優(yōu)的分割網(wǎng)絡和標簽校正網(wǎng)絡參數(shù),采用迭代的方式,在一次循環(huán)過程中,交替更新W和θ的值;
一次循環(huán)優(yōu)化算法過程,包括以下步驟:
1)初始化分割網(wǎng)絡參數(shù)W(0)和標簽校正網(wǎng)絡參數(shù)θ(0);
2)在第t次迭代的過程中,分割網(wǎng)絡的參數(shù)被暫時按照公式(3)進行更新,通過一次梯度更新最小化目標函數(shù)公式(1),其中,t時刻損失的計算公式如(4)所示;
3)通過最小化目標函數(shù)(2)更新標簽校正網(wǎng)絡參數(shù)θ,更新過程如公式(5),其中,t+1時刻的損失計算公式如(6)所示;
4)最終,通過最小化分割網(wǎng)絡目標函數(shù)(1)完成對分割網(wǎng)絡參數(shù)W的更新;其中,t+1時刻的損失計算公式如(8)所示;
步驟三:
步驟二獲得每個連通域噪聲標簽的校正掩膜之后,對所有的校正掩膜用帶有標識符的分水嶺算法,分割開重疊細胞核的標注,最終對于每個細胞核都能獲得分割邊界。
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