[發明專利]一種診斷草酸鈣結石的腸道菌群標志物及其應用

在審

• 申請號: 202110648192.7
• 申請日: 2021-06-10
• 公開（公告）號: CN113584190A
• 公開（公告）日: 2021-11-02
• 發明（設計）人: 徐華;張宇聰;陶芝偉;劉浩然
• 申請（專利權）人: 廣西醫科大學
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11;C12N1/20;C12R1/01
• 代理公司: 廣州科粵專利商標代理有限公司 44001
• 代理人: 劉明星;朱聰聰

本發明公開了一種診斷草酸鈣結石的腸道菌群標志物及其應用。檢測Burkholderiapseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443豐度的試劑在制備診斷草酸鈣結石的試劑中的應用。本發明首次發現了Burkholderia pseudomallei和Bacteroides sp.CAG:443與草酸鈣結石相關，其豐度在草酸鈣結石患者和健康人群中呈現顯著性差異，ROC曲線分析其作為檢測變量具有較高的特異性和敏感性，因此，可以將Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443作為檢測標志物應用于草酸鈣結石患者的診斷。以Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443作為檢測標志物，完全無創，準確性高。

技術領域：

本發明屬于生物醫藥領域，具體涉及一種診斷草酸鈣結石的腸道菌群標志物及其應用。

背景技術：

泌尿系結石是泌尿外科的常見疾病，在住院患者中居首位(《中國泌尿外科和男科疾病診斷治療指南》(2019版))。影響結石形成的因素有很多，包括年齡、性別、種族、遺傳、環境、飲食習慣和職業等，重視結石形成的因素能夠減少結石的形成和復發。其中，與結石成分有關的代謝異常越來越受到人們的關注。流行病學的調查結果顯示，80％以上的結石都是草酸鈣結石。

作為一種多病因所引起的疾病，草酸鈣結石的發病機制尚不明確。目前發現微生物可能在腎結石的發病機制和預防中起到重要作用，因此腸道菌群與腎臟疾病的關系是近年來研究的一項熱點。研究腸道菌群與草酸鈣結石形成的關系，對于揭示草酸鈣結石的發病機制以及防治草酸鈣結石具有重要的意義。

發明內容

本發明的第一個目的是提供一種診斷草酸鈣結石的腸道菌群標志物。

本發明通過收集草酸鈣結石患者和健康人的樣本，進行全基因組測序以及使用生物信息學進行測序數據的統計，首次發現了Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443在草酸鈣結石患者和健康人中呈現顯著性差異，說明Burkholderia pseudomallei或Bacteroides sp.CAG:443可作為草酸鈣結石的預測因子。

因此，本發明提供了一種診斷草酸鈣結石的腸道菌群標志物，其為Burkholderiapseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443。

本發明的第二個目的是提供Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroidessp.CAG:443在作為診斷草酸鈣結石的標志物中的應用。

本發明的第三個目的是檢測Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroidessp.CAG:443豐度的試劑在制備診斷草酸鈣結石的試劑中的應用。

優選，是檢測腸道菌群中Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroidessp.CAG:443豐度的試劑在制備診斷草酸鈣結石的試劑中的應用。

優選，所述的檢測Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443豐度的試劑可以是能檢測Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443豐度的特異性的引物、探針或反義寡核苷酸。

優選，所述的檢測腸道菌群是以糞便為樣本。

優選，所述的試劑還包括提取微生物基因組DNA的試劑。