[發明專利]一種用于鑒定香菇同一菌株不同單核體交配型B的InDel分子標記及方法

有效

• 申請號: 202110638053.6
• 申請日: 2021-06-08
• 公開（公告）號: CN113215302B
• 公開（公告）日: 2022-12-30
• 發明（設計）人: 于海龍;沈秀芬;章爐軍;張美彥;尚曉冬;宋春艷;譚琦;李巧珍;劉建雨;張丹
• 申請（專利權）人: 上海市農業科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 上海諾衣知識產權代理事務所(普通合伙) 31298
• 代理人: 李凱利

本發明公開一種用于鑒定香菇同一菌株不同單核體交配型B的InDel分子標記及方法，所述InDel分子標記的堿基序列選自：SEQ ID NO.1；鑒定香菇同一菌株不同單核體交配型B的方法包括以下步驟：S1、獲取香菇的DNA；S2、PCR擴增香菇的DNA；S3、PCR產物進行瓊脂糖凝膠電泳；S4、根據電泳條帶的數量和長度判斷香菇的交配型；本發明提供的InDel位點和引物為香菇B交配型鑒定提供了一種新方法。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，具體是一種用于鑒定香菇同一菌株不同單核體交配型B的InDel分子標記、引物組合物、試劑盒及方法。

背景技術

香菇作為最重要的栽培食用菌，對其交配型多態性的研究一直受到遺傳育種學者的高度重視。香菇屬于四級性異宗結合食用菌，A位點上的交配型基因控制鎖狀細胞的形成、雙核的配對、雙核的同步分裂、鎖狀細胞與頂端細胞間隔膜的形成。B位點上的交配型基因控制核的遷移、細胞隔膜的融解、鎖狀細胞與次頂端細胞的融合。現有報道，中國香菇自然群體中據測算存在121種A特異型和151種B特異型，可以產生18000多種交配型。

交配型和交配型相關基因的研究是揭示真菌有性生殖機制的關鍵。交配型基因位點的解析有利于了解異宗配合真菌的性親和系統作用機制，也是食用菌遺傳育種、菌種改良的基礎。早期研究認為不同的MAT基因來源于染色體上同一DNA保守區，這些區域發生定向或非定向突變，導致不同交配方式的產生，因此同宗配合和異宗配合為共同起源。近年來，在基因組測序的基礎上，擔子菌中對香菇、草菇、靈芝、金針菇等交配型位點的研究不斷取得進展，交配型位點被發現和鑒定以來，科學家進行了大量的研究，明確了其中一些基礎性的問題，如MAT基因與交配型控制、MAT基因的信號通路及上下游基因等。因此，進一步圍繞交配型基因開展有性生殖機制的深入研究，在不同的真菌中分析交配型基因的結構、功能和親緣關系，對擔子菌生長發育和遺傳進化的研究仍具有重要的意義。

此外，交配型基因能夠控制食用菌雜交和有性繁殖過程，全面和深入了解交配型系統的分子遺傳學結構并開發有效鑒定交配型的分子標記，將有助于我們解決食用菌產業發展中的育種相關科學問題。香菇目前最常用的新品種選育手段是雜交育種，而單核體是香菇雜交育種和進行遺傳學研究的重要中間材料。單核體的鑒定通常采用顯微鏡檢確認是否存在鎖狀聯合來判斷，而鑒定單核體的交配型則需要進行大量的配對和顯微鏡檢工作，且工作量隨著單核群體數量的增加而增加，多輪交配通常需耗時2個月左右，并且容易發生人為因素誤檢。

綜上所述，目前還缺少一種用于鑒定香菇同一菌株不同單核體交配型B快速、準確、高效鑒定的技術手段。

發明內容

本發明提供一種用于鑒定香菇同一菌株不同單核體交配型B快速、準確、高效鑒定的InDel分子標記、引物組合物、試劑盒及方法。

為達此目的，本發明提供如下的技術方案：

本發明的第一個方面，提供了一種用于鑒定香菇同一菌株不同單核體交配型B的InDel分子標記，所述InDel分子標記的堿基序列選自：SEQ ID NO.1。

SEQ ID NO.1：GCCACTGATA。

優選的，所述香菇包括申香10號、申香12號、香雜26、菌興8號、931、L26、平泉18、慶元9015、金地香菇、7402、廣香、慶科20、申香16、9319、9608、森源10號、華香8號、王Japan、贛香1號、Cr62、壽香1號、939、3161、0285、0338、3242、4705。

本發明的第二個方面，提供了一種用于鑒定香菇同一菌株不同單核體交配型B的引物組合物，所述引物組合物包括：

擴增SEQ ID NO.1的引物：

SEQ ID NO.2：5’-GCCTTGATGTGGAATTGAGG-3’