[發明專利]一種鑒定小麥葉片絨毛基因的分子標記、引物組和應用

有效

• 申請號: 202110607480.8
• 申請日: 2021-06-01
• 公開（公告）號: CN113278724B
• 公開（公告）日: 2023-06-16
• 發明（設計）人: 劉澤厚;王琴;萬洪深;楊凡;李俊;楊武云;楊寧
• 申請（專利權）人: 四川省農業科學院作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;A01H1/04
• 代理公司: 成都金英專利代理事務所(普通合伙) 51218
• 代理人: 袁英

1.一種鑒定小麥葉片絨毛基因的分子標記，其特征在于：該基因定位在地方品種白毛麥的7BS染色體上，命名為QLP.saas-7BS；所述QLP.saas-7BS定位區間為AX-86175290和AX-86172908之間的0.48Mb區間內，所述AX-86175290的物理位置為61106266-61106336b，所述AX-86172908的物理位置為60629908-60629979b；利用QLP.saas-7BS位點側翼SNP?探針AX-86175290和AX-86172908開發兩對KASP特異連鎖標記，所述連鎖標記為KASP-AX-86175290的KASP標記和KASP-AX-86172908的KASP標記；所述標記KASP-AX-86175290和KASP-AX-86172908?的引物組核苷酸序列分別為，

KASP-AX-86172908引物組序列如下：

FAM：GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTGCACAACCAGTCAGCAGAAA，

HEX：GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGCACAACCAGTCAGCAGAAG，

COM：TCGGGATATTGAATTCTTGAGCTAC；

KASP-AX-86175290引物組序列如下：

FAM：GAAGGTGACCAAGTTCATGCT?TGCAGTGAAGTTATTAACACC，

HEX：GAAGGTCGGAGTCAACGGATT?TGCAGTGAAGTTATTAACACT，

COM：ATATGCAGTACAGATCTTTCACAG。

2.根據權利要求1所述的鑒定小麥葉片絨毛基因的分子標記，其特征在于：所述QLP.saas-7BS兩翼的SNP探針分別為AX-86175290和AX-86172908，所述KASP-AX-86172908和KASP-AX-86175290是分別根據AX-86175290和AX-86172908的探針序列進行設計，AX-86175290和AX-86172908的探針序列分別為，

AX-86172908:?GGCTAGTGCTGTAAATGCACAACCAGTCAGCAGAA[A/G]CGTAAATGGTGTAGCTCAAGAATTCAATATCCCGA；

AX-86175290:

TCTAAATGGGAGACCTGCAGTGAAGTTATTAACAC[C/T]AACTGGAAGGACTGTGAAAGATCTGTACTGCATAT。

3.用于鑒定權利要求2所述分子標記的引物組，其特征在于，檢測基因QLP.saas-7BS的KASP功能標記引物有兩組，分別如下：

第一組，KASP-AX-86172908引物序列如下：

FAM:?GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTGCACAACCAGTCAGCAGAAA，

HEX：GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGCACAACCAGTCAGCAGAAG，

COM：TCGGGATATTGAATTCTTGAGCTAC；

第二組，KASP-AX-86175290引物序列如下：

FAM:?GAAGGTGACCAAGTTCATGCT?TGCAGTGAAGTTATTAACACC，

HEX：GAAGGTCGGAGTCAACGGATT?TGCAGTGAAGTTATTAACACT，

COM：ATATGCAGTACAGATCTTTCACAG。

4.根據權利要求3所述的引物組，其特征在于，根據QLP.saas-7BS兩翼探針的SNP位置在5’端設計了競爭性的FAM和HEX正向引物，在3’端設計了通用引物，引物序列在5’端分別添加不同的熒光探針標記基團，FAM的熒光探針序列為GAAGGTGACCAAGTTCATGCT，HEX的熒光探針序列為GAAGGTCGGAGTCAACGGATT。