[發明專利]一種長非編碼RNA及其在診斷及治療肝癌中的應用

在審

• 申請號: 202110596072.7
• 申請日: 2021-05-29
• 公開（公告）號: CN113481297A
• 公開（公告）日: 2021-10-08
• 發明（設計）人: 涂康生;許秋然;黃東勝;胡曉歌;曾幟
• 申請（專利權）人: 杭州醫學院;浙江省人民醫院;西安交通大學醫學院第一附屬醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/113;A61K45/00;A61P35/00
• 代理公司: 杭州興知捷專利代理事務所(特殊普通合伙) 33338
• 代理人: 周文停

本發明公開了一種長非編碼RNA及其在診斷及治療肝癌中的應用，所述長非編碼RNA為長非編碼RNA lncRNA MAPKAPK5?AS1，基因ID為ENSG00000234608，定位于12q24.12，長非編碼RNA lncRNA MAPKAPK5?AS1的核苷酸序列如Seq IDNO.1所示。本發明首次發現lncRNA MAPKAPK5?AS1可作為肝癌診斷生物標志物和藥物治療靶點，并提供了MAPKAPK5?AS1/PLAGL2/HIF?1α環路可作為肝癌的診斷和治療靶點。lncRNA MAPKAPK5?AS1在肝癌組織中顯著上調，MAPKAPK5?AS1抑制可抑制HCC細胞的增殖，遷移和EMT，并誘導細胞凋亡。

技術領域：

本發明涉及基因工程領域，具體講是一種長非編碼RNA及其在診斷及治療肝癌中的應用。

背景技術：

肝細胞癌(HCC)是消化系統常見的惡性腫瘤，其發病率和死亡率分別居世界第六和第四。盡管在臨床和實驗上癌癥治療方面已取得了很大的進步，但由于手術后腫瘤的復發率和轉移率高，HCC患者的總體預后較差。我國是肝癌的高發地區，并且我國肝癌患者多有乙肝感染背景，常合并肝功能不全、肝硬化等，使得手術切除率低且復發率高。盡管眾多的基因與信號通路被發現、證實與肝癌的發生發展及調控有關，但目前肝癌的發病機制仍不完全清楚。肝癌的早期診斷和及時正確的治療能夠直接影響肝癌患者的預后，因此尋找新的肝癌高靈敏度、高特異度的早期診斷分子與治療靶點對于提高肝癌的早期診斷率，具有重要意義。

長鏈非編碼RNA(lncRNA)是長度超過200nt，且缺乏開放閱讀框的RNA，其特征是序列保守性和表達水平較低。lncRNA在表觀遺傳，轉錄和轉錄后水平上調節多種生物學功能，或直接調節蛋白質活性。近年來，有研究表明lncRNA與肝癌的發生發展密切相關，主要通過調控肝癌細胞的生長周期，腫瘤浸潤轉移，抑制凋亡，激活原癌基因，使抑癌基因失活，誘導細胞耐藥等。lncRNA具有較高的組織特異性和較高的穩定性，而在肝癌組織中存在眾多異常表達的lncRNA，尋找早期肝癌的lncRNA分子標志物，進一步了解lncRNA在肝癌中的生物學意義對于肝癌的早期診斷和治療具有重要意義。

發明內容：

本發明所要解決的技術問題是，提供一種用于診斷HCC預后情況或作為治療HCC藥物靶點的長非編碼RNA，為HCC病人精準治療的實現奠定了基礎。

本發明的技術解決方案是，提供一種用于診斷肝癌預后情況或作為治療肝癌藥物靶點的長非編碼RNA，所述長非編碼RNA為長非編碼RNA lncRNA MAPKAPK5-AS1，基因ID為ENSG00000234608，定位于12q24.12，又名為C12orf47，長非編碼RNA lncRNA MAPKAPK5-AS1的核苷酸序列如Seq ID NO.1所示。

作為優選，還提供所述的長非編碼RNA在作為篩選判斷肝癌預后情況的診斷試劑中的應用。

作為優選，還提供所述的長非編碼RNA在作為篩選治療肝癌的藥物中的應用。

本發明還提供一種長非編碼RNA的標記物在制備判斷肝癌治療預后診斷產品中的應用，所述的標記物包括但不限于：

(1)結合長非編碼RNA lncRNA MAPKAPK5-AS1的引物或熒光標記的結合長非編碼RNA lncRNA MAPKAPK5-AS1的引物；

(2)結合長非編碼RNA lncRNA MAPKAPK5-AS1的小分子化合物或生物大分子。

具體的，所述引物或熒光標記的引物的核苷酸序列如Seq ID NO.2和Seq ID NO.3所示。

作為優選技術方案，lncRNA MAPKAPK5-AS1通過利用PLAGL2/HIF-1α環路調控肝癌細胞的增殖和遷移。

本發明還公開一種用于判斷肝癌治療預后情況的試劑或試劑盒，所述試劑或試劑盒包含上述的標記物。