[發(fā)明專(zhuān)利]基于遷移學(xué)習(xí)的無(wú)標(biāo)記高內(nèi)涵視頻流式細(xì)胞儀及方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202110592184.5 | 申請(qǐng)日: | 2021-05-28 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN113155713B | 公開(kāi)(公告)日: | 2023-05-05 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 蘇絢濤;劉超;王卓;賈俊昆 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 山東大學(xué) |
| 主分類(lèi)號(hào): | G01N15/14 | 分類(lèi)號(hào): | G01N15/14;G06V20/69;G06N3/0464;G06N3/096;G06V10/82;G06V10/764;G06V10/34 |
| 代理公司: | 濟(jì)南圣達(dá)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 37221 | 代理人: | 祖之強(qiáng) |
| 地址: | 250101 山東*** | 國(guó)省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 基于 遷移 學(xué)習(xí) 標(biāo)記 內(nèi)涵 視頻 細(xì)胞 方法 | ||
1.一種基于遷移學(xué)習(xí)的無(wú)標(biāo)記高內(nèi)涵視頻流式細(xì)胞儀,其特征在于:
包括:光學(xué)激發(fā)模塊、鞘流控制模塊、數(shù)據(jù)采集模塊和數(shù)據(jù)處理模塊;
光學(xué)激發(fā)模塊至少包括沿光路依次設(shè)置的激光器、用于光強(qiáng)控制的中性密度片、用于準(zhǔn)直和開(kāi)關(guān)光路的激光光闌、用于調(diào)整方向的反射鏡和用于整形的激發(fā)物鏡,激光經(jīng)過(guò)激發(fā)物鏡后得到壓縮的激發(fā)光束;
光學(xué)激發(fā)模塊發(fā)出的激發(fā)光束傳輸?shù)角柿骺刂颇K鞘流室中,通過(guò)數(shù)據(jù)采集模塊進(jìn)行視頻圖像采集,并將采集到的圖像數(shù)據(jù)傳輸?shù)綌?shù)據(jù)處理模塊進(jìn)行細(xì)胞檢測(cè);
其中,鞘流控制模塊能夠?qū)颖疽旱目臻g流動(dòng)進(jìn)行限制,使樣本形成流動(dòng)的無(wú)標(biāo)記單細(xì)胞序列,同時(shí)光學(xué)激發(fā)模塊產(chǎn)生的激發(fā)光束經(jīng)過(guò)物鏡的整形后耦合進(jìn)入樣本流動(dòng)通道,使樣本液和激發(fā)光束僅在預(yù)設(shè)區(qū)域內(nèi)重合;
鞘流控制模塊用于驅(qū)動(dòng)細(xì)胞溶液形成單細(xì)胞通路,包括鞘流室、樣本液注射泵和鞘液注射泵,樣本液從鞘流室中間通道流入,鞘液從鞘流室周?chē)ǖ懒魅耄仪室核俣却笥跇颖疽核俣龋?/p>
鞘液進(jìn)入鞘流室前會(huì)經(jīng)過(guò)一個(gè)緩沖室,使液流穩(wěn)定并將其流動(dòng)方向進(jìn)行預(yù)分散,保證鞘流在兩個(gè)正交方向上同時(shí)對(duì)樣本液進(jìn)行壓縮控制;
數(shù)據(jù)采集模塊設(shè)置觸發(fā)器,觸發(fā)器的焦點(diǎn)略提前于高速CMOS相機(jī);
激光光束通過(guò)中性密度片調(diào)整光強(qiáng)和反射鏡調(diào)整方向后進(jìn)入激發(fā)物鏡;經(jīng)過(guò)4倍的激發(fā)物鏡整形后耦合進(jìn)鞘流室;同時(shí),注射泵驅(qū)動(dòng)樣本液和鞘液流入鞘流室形成鞘流,樣本液被限制在與激發(fā)光束相近的區(qū)域內(nèi)流動(dòng);采集物鏡聚焦在樣本液和激發(fā)光束重合的部分;
數(shù)據(jù)處理模塊對(duì)獲取的圖像數(shù)據(jù)進(jìn)行自動(dòng)化的預(yù)處理,并實(shí)現(xiàn)數(shù)字細(xì)胞過(guò)濾,然后采用基于遷移學(xué)習(xí)的CNN算法作為特征提取器,自動(dòng)從圖樣中提取特征,再利用SVM算法進(jìn)行細(xì)胞分類(lèi),其中:
預(yù)處理,包括:
對(duì)視頻數(shù)據(jù)逐幀拆分圖像數(shù)據(jù),然后從拆分的幀圖像中定位需要識(shí)別的圖樣位置并自動(dòng)截取保存,對(duì)得到的圖像數(shù)據(jù)進(jìn)行過(guò)濾處理;
每張圖像數(shù)據(jù)經(jīng)形態(tài)學(xué)算法與粒度分析算法處理獲得圖像形態(tài)學(xué)粒度特征值,判斷特征值是否符合標(biāo)準(zhǔn),若符合則保留該圖像,否則將圖像剔除;
利用一個(gè)訓(xùn)練好的機(jī)器學(xué)習(xí)模型對(duì)保留的圖像進(jìn)行進(jìn)一步的數(shù)字細(xì)胞過(guò)濾。
2.如權(quán)利要求1所述的基于遷移學(xué)習(xí)的無(wú)標(biāo)記高內(nèi)涵視頻流式細(xì)胞儀,其特征在于:
鞘流控制模塊還包括廢液池,用于收集流過(guò)觀測(cè)區(qū)域后的樣本和鞘液。
3.如權(quán)利要求1所述的基于遷移學(xué)習(xí)的無(wú)標(biāo)記高內(nèi)涵視頻流式細(xì)胞儀,其特征在于:
數(shù)據(jù)采集模塊包括采集光路和數(shù)據(jù)通路,采集光路至少包括采集物鏡、高速CMOS相機(jī)和觸發(fā)器,采集物鏡的視場(chǎng)位于樣本液和激發(fā)光束重合的部分,觸發(fā)器位置較采集物鏡位置靠前,用于控制相機(jī)的存儲(chǔ)時(shí)間;
數(shù)據(jù)通路將高速CMOS相機(jī)獲取到的高質(zhì)量視頻數(shù)據(jù)傳輸并存儲(chǔ)并傳輸?shù)綌?shù)據(jù)處理模塊。
4.如權(quán)利要求3所述的基于遷移學(xué)習(xí)的無(wú)標(biāo)記高內(nèi)涵視頻流式細(xì)胞儀,其特征在于:
對(duì)圖像的形態(tài)與粒度特征進(jìn)行門(mén)限判別,若在均值為中心的預(yù)設(shè)比例的區(qū)間內(nèi)則保留圖像,否則作為雜質(zhì)進(jìn)行剔除。
5.一種基于遷移學(xué)習(xí)的無(wú)標(biāo)記高內(nèi)涵視頻流式細(xì)胞檢測(cè)方法,其特征在于:利用權(quán)利要求1-4任一項(xiàng)所述的基于遷移學(xué)習(xí)的無(wú)標(biāo)記高內(nèi)涵視頻流式細(xì)胞儀,包括以下步驟:
分別將三種培養(yǎng)的細(xì)胞進(jìn)行處理,形成單細(xì)胞懸液,配制成濃度一定的待測(cè)樣本溶液并置于樣本注射器中,選擇PBS溶液作為鞘液并置于鞘液注射器中;
設(shè)置注射泵參數(shù)并啟動(dòng)注射泵,使鞘流能正常形成,樣本液為30μL/h,鞘液為800μL/h;
啟動(dòng)光源和CMOS相機(jī),觀測(cè)鞘流形成情況及成像效果,并調(diào)節(jié)位移平臺(tái)使系統(tǒng)工作在去焦模式下;
啟動(dòng)觸發(fā)器,采集記錄二維光散射的視頻數(shù)據(jù);
采集結(jié)束后,更換樣本液和鞘液,使用酒精溶液和超純水依次沖洗系統(tǒng);
使用預(yù)設(shè)分類(lèi)算法自動(dòng)處理視頻結(jié)果,提取需要的細(xì)胞圖樣,并使用自動(dòng)分類(lèi)算法進(jìn)行分析。
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