[發(fā)明專利]一種基于超像素分割與圖卷積的數(shù)字病理圖像分類方法及系統(tǒng)在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110585365.5 | 申請日: | 2021-05-27 |
| 公開(公告)號: | CN113313164A | 公開(公告)日: | 2021-08-27 |
| 發(fā)明(設計)人: | 王奕;張敬誼;丁偕;張伯強;崔浩陽;黃宗浩;李淵;張暉;朱敏俊;厲勵;張逸魯;高宇;戴梅;黃麒瑋;蔡云飛;曹斌;石強;王正源;王駿杰;于鏌铘;崔敏杰 | 申請(專利權)人: | 復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院 |
| 主分類號: | G06K9/62 | 分類號: | G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08;G06T7/00;G06T7/11;G16H30/20 |
| 代理公司: | 上海容慧專利代理事務所(普通合伙) 31287 | 代理人: | 于曉菁 |
| 地址: | 200032 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 像素 分割 圖卷 數(shù)字 病理 圖像 分類 方法 系統(tǒng) | ||
本發(fā)明涉及一種基于超像素分割與圖卷積的數(shù)字病理圖像分類方法及系統(tǒng),所述方法包括以下步驟:S1:使用簡單線性迭代聚類算法SLIC對數(shù)字病理圖像進行超像素分割,獲得超像素的分割區(qū)域;S2:將每個超像素區(qū)域作為圖結構中的節(jié)點,以超像素區(qū)域是否共邊作為節(jié)點之間分配邊的依據(jù),構建基于數(shù)字病理圖像的圖結構;S3:將構建的所述圖結構的數(shù)據(jù)按照預設的比例隨機分為訓練集、驗證集和測試集,通過訓練、驗證和測試圖卷積神經網絡,獲得最佳的預測模型;S4:基于所述預測模型,對所述數(shù)字病理圖像進行分類。本發(fā)明利用圖卷積神經網絡實現(xiàn)對數(shù)字病理圖像的分類預測,提高了病理圖像分類的準確率。
技術領域
本發(fā)明計算機輔助診斷技術領域,尤其涉及一種基于超像素分割與圖卷積的數(shù)字病理圖像分類方法及系統(tǒng)。
背景技術
規(guī)范統(tǒng)一的病理報告為臨床醫(yī)生提供了充足的信息,但是對于病理指標的形態(tài)學評估給病理醫(yī)生增加了工作量。由于病理活檢技術的成熟和規(guī)范,病理活檢樣本診斷數(shù)量不斷攀升,診斷結果會受到疲勞、主觀經驗等因素的影響。近年來,數(shù)字病理掃描技術和人工智能(AI)的快速發(fā)展給病理形態(tài)學診斷提供了巨大潛能。具體而言是利用深度卷積神經網絡(CNN)提取病理圖像中的高維特征,實現(xiàn)對病理圖像的預測分類。
然而病理醫(yī)生的診斷主要是根據(jù)病理圖像中異常細胞的形態(tài)、結構以及空間分布等因素給出最終的病理分析結果。而傳統(tǒng)的CNN是處理具有像素值的結構化二維陣列圖像,這種結構化的二維陣列形式的數(shù)據(jù)難以表達組織病理學中細胞之間以及腺體之間的關系和組織學特征,也忽略了微觀細胞之間的空間關系,會丟失一些提高模型性能的關鍵特征信息。
由于數(shù)字病理圖像具有極高的分辨率和復雜而豐富的組織學特征,因此如何有效的構建數(shù)字病理圖的圖結構,從而利用圖卷積網絡提高數(shù)字病理圖像的分類準確率是目前主要的挑戰(zhàn)。
發(fā)明內容
本發(fā)明的主要目的在于克服現(xiàn)有技術的缺點與不足,提供一種基于超像素分割與圖卷積的數(shù)字病理圖像分類方法及系統(tǒng),該方法將超像素分割和圖結構相結合,以構建基于數(shù)字病理圖像的圖結構,從而利用圖卷積神經網絡實現(xiàn)對數(shù)字病理圖像的分類預測,提高了病理圖像分類的準確率。
根據(jù)本發(fā)明的一個方面,本發(fā)明提供了一種基于超像素分割與圖卷積的數(shù)字病理圖像分類方法,所述方法包括以下步驟:
S1:使用簡單線性迭代聚類算法SLIC對數(shù)字病理圖像進行超像素分割,獲得超像素的分割區(qū)域;
S2:將每個超像素區(qū)域作為圖結構中的節(jié)點,以超像素區(qū)域是否共邊作為節(jié)點之間分配邊的依據(jù),構建基于數(shù)字病理圖像的圖結構;
S3:將構建的所述圖結構的數(shù)據(jù)按照預設的比例隨機分為訓練集、驗證集和測試集,通過訓練、驗證和測試圖卷積神經網絡,獲得最佳的預測模型;
S4:基于所述預測模型,對所述數(shù)字病理圖像進行分類。
優(yōu)選地,所述步驟S1包括:
S11:初始化種子點,即初始化聚類中心,設定需要分割的超像素數(shù)量;
S12:在種子點n×n鄰域內根據(jù)像素點梯度值重新選擇種子點,以避免種子點落在梯度較大的邊緣上;
S13:在每個種子點周圍的鄰域內為每個像素點分配類標簽,確定像素點所屬的聚類中心;
S14:進行距離度量,對于每個檢索到的像素點分別計算它到該種子點之間的距離。
優(yōu)選地,所述步驟S2包括:
S21:利用SLIC算法對數(shù)字病理圖像進行超像素分割,獲得超像素分割區(qū)域;
S22:將每個超像素分割區(qū)域作為圖結構中的節(jié)點,節(jié)點數(shù)量為n;
S23:利用CNN網絡對每個分割區(qū)域進行低維度編碼,作為每個節(jié)點的特征信息,節(jié)點的特征維度為d;
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