[發明專利]一種水稻品種鑒定方法及系統

有效

• 申請號: 202110581528.2
• 申請日: 2021-05-27
• 公開（公告）號: CN113049661B
• 公開（公告）日: 2021-08-10
• 發明（設計）人: 許東林;肖婉鈺;張晶;任海龍;蒲文亮;戴修純;周賢玉;孫藝嘉
• 申請（專利權）人: 廣州市農業科學研究院
• 主分類號: G01N27/447
• 分類號: G01N27/447;C12Q1/6895;C12Q1/6858
• 代理公司: 北京超凡宏宇專利代理事務所(特殊普通合伙) 11463
• 代理人: 王煥

1.一種水稻品種鑒定方法，其特征在于，所述方法包括：

毛細管電泳儀通過預設定數量的毛細管對目標擴增產物進行電泳，以獲取電泳解析結果；

其中，至少一條毛細管中包含兩種或兩種以上的目標擴增產物，所述目標擴增產物為水稻標準SSR對應的擴增產物，毛細管中任意兩條帶有同種顏色熒光基因的目標擴增產物片段長度差異大于或等于第一閾值；

所述毛細管電泳儀依據所述電泳解析結果，獲取水稻品種的鑒定結果；

在毛細管電泳儀通過預設定數量的毛細管對目標擴增產物進行電泳，以獲取電泳解析結果之前，所述方法還包括：

擴增單元通過對應的目標引物對所述水稻標準SSR進行擴增，以獲取所述目標擴增產物；

分組單元按照目標分組方案對所有的目標擴增產物進行分組，將每一組目標擴增產物集合分別添加至對應的毛細管，其中，目標擴增產物集合包括至少一種目標擴增產物，所述分組方案包括每一種目標擴增產物與目標擴增產物集合的對應關系；

在分組單元按照目標分組方案對所有的目標擴增產物進行分組，將每一組目標擴增產物集合分別添加至對應的毛細管之前，所述方法還包括：

將所述目標擴增產物的總數量、每一種所述目標擴增產物對應的片段長度以及所攜帶熒光基因的顏色輸入分組模型；

所述分組模型運行遺傳學算法，以獲取所述目標分組方案；

所述分組模型運行遺傳學算法，以獲取所述分組方案的步驟，包括：

所述分組模型依據預設定的目標組數，生成第一數量的預分組方案，其中，每一種所述預分組方案均包含第二數量的目標擴增產物集合，所述第二數量與目標組數相等；

所述分組模型判斷每一種預分組方案是否滿足適應性條件，其中，所述適應性條件為每一組目標擴增產物集合中任意兩條帶有同種顏色熒光基因的目標擴增產物片段長度差異大于或等于所述第一閾值；

若是，則將滿足適應性條件的預分組方案作為所述目標分組方案；

若否，則將原有的目標組數加一，作為新的目標組數，重復依據預設定的目標組數，生成第一數量的預分組方案，直至獲得滿足適應性條件的預分組方案。

2.如權利要求1所述的水稻品種鑒定方法，其特征在于，所述目標引物為與所述水稻標準SSR對應的核苷酸序列。

3.如權利要求1所述的水稻品種鑒定方法，其特征在于，所述第一閾值為2堿基對。

4.一種水稻品種鑒定系統，其特征在于，所述系統包括毛細管電泳儀，所述毛細管電泳儀包括預設定數量的毛細管；

所述毛細管電泳儀用于通過預設定數量的毛細管對目標擴增產物進行電泳，以獲取電泳解析結果；

其中，至少一條毛細管中包含兩種或兩種以上的目標擴增產物，所述目標擴增產物為水稻標準SSR對應的擴增產物，毛細管中任意兩條帶有同種顏色熒光基因的目標擴增產物片段長度差異大于或等于第一閾值；

所述毛細管電泳儀還用于依據所述電泳解析結果，獲取水稻品種的鑒定結果；

所述系統還包括：擴增單元和分組單元；

所述擴增單元用于通過對應的目標引物對所述水稻標準SSR進行擴增，以獲取所述目標擴增產物；

所述分組單元用于按照目標分組方案對所有的目標擴增產物進行分組，將每一組目標擴增產物集合分別添加至對應的毛細管，其中，目標擴增產物集合包括至少一種目標擴增產物，所述分組方案包括每一種目標擴增產物與目標擴增產物集合的對應關系；

所述系統還包括：分組模型；

當所述目標擴增產物的總數量、每一種所述目標擴增產物對應的片段長度以及所攜帶熒光基因的顏色輸入分組模型時，所述分組模型用于運行遺傳學算法，以獲取所述目標分組方案；

所述分組模型運還用于依據預設定的目標組數，生成第一數量的預分組方案，其中，每一種所述預分組方案均包含第二數量的目標擴增產物集合，所述第二數量與目標組數相等；

所述分組模型還用于判斷每一種預分組方案是否滿足適應性條件，其中，所述適應性條件為每一組目標擴增產物集合中任意兩條帶有同種顏色熒光基因的目標擴增產物片段長度差異大于或等于所述第一閾值；

若是，則所述分組模型還用于將滿足適應性條件的預分組方案作為所述目標分組方案；

若否，則所述分組模型還用于將原有的目標組數加一，作為新的目標組數，重復依據預設定的目標組數，生成第一數量的預分組方案，直至獲得滿足適應性條件的預分組方案。