[發(fā)明專利]用于第三代基因測序數據的讀寫方法及分布式文件系統(tǒng)在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110578909.5 | 申請日: | 2021-05-26 |
| 公開(公告)號: | CN113192558A | 公開(公告)日: | 2021-07-30 |
| 發(fā)明(設計)人: | 寧建峰;寧建強;戈素梅;李寧寧;劉政委 | 申請(專利權)人: | 北京自由貓科技有限公司;北京樂訊科技有限公司 |
| 主分類號: | G16B20/30 | 分類號: | G16B20/30;G06F16/27 |
| 代理公司: | 北京信諾創(chuàng)成知識產權代理有限公司 11728 | 代理人: | 任萬玲;楊仁波 |
| 地址: | 102200 北京市昌平區(qū)回*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 第三代 基因 序數 讀寫 方法 分布式 文件系統(tǒng) | ||
1.一種用于第三代基因測序數據的讀寫方法,其特征在于,包括如下步驟:
將硬盤存儲空間劃分為多個數據存儲池;
接收到數據寫入請求后,依序將寫入數據存儲至所述數據存儲池中,其中一個數據存儲池被寫滿后切換至下一個數據存儲池。
2.根據權利要求1所述的用于第三代基因測序數據的讀寫方法,其特征在于,還包括如下步驟:
接收到數據讀取請求后,若被請求數據所在的數據存儲池為寫滿狀態(tài),則直接讀取所述被請求數據。
3.根據權利要求1所述的用于第三代基因測序數據的讀寫方法,其特征在于,還包括如下步驟:
接收到數據修復請求后,確定更新后的硬盤存儲空間;
將寫入的修復數據存儲至所述更新后的硬盤存儲空間中。
4.根據權利要求1-3任一項所述的用于第三代基因測序數據的讀寫方法,其特征在于,還包括如下步驟:
檢測到系統(tǒng)掛載信號后,掃描硬盤存儲空間中的數據檢索信息,所述數據檢索信息包括數據存儲目錄項和數據索引節(jié)點;將所述數據檢索信息緩存至系統(tǒng)內存中;
接收到隨機數據讀取請求后,根據所述系統(tǒng)內存中的所述數據檢索信息確定被請求數據所在的目標目錄和目標索引節(jié)點。
5.根據權利要求4所述的用于第三代基因測序數據的讀寫方法,其特征在于,還包括如下步驟:
設定流量窗口;
接收到數據寫入請求或數據讀取請求后,根據所述流量窗口對數據寫入流量或數據讀取流量進行調整。
6.根據權利要求5所述的用于第三代基因測序數據的讀寫方法,其特征在于,根據所述流量窗口對數據寫入流量或數據讀取流量進行調整的步驟包括:
獲取所述數據寫入請求或所述數據讀取請求的延遲時長;
若所述延遲時長小于預期時長,則按照設定比例增大所述流量窗口;若所述延遲時長大于所述預期時長,則按照設定比例縮小所述流量窗口。
7.一種用于第三代基因測序數據的存儲服務器,其特征在于,包括:
至少一塊硬盤;
數據管理模塊,用于將所述硬盤的硬盤存儲空間劃分為多個數據存儲池;接收到數據寫入請求后,依序將寫入數據存儲至所述數據存儲池中,其中一個數據存儲池被寫滿后切換至下一個數據存儲池。
8.根據權利要求7所述的用于第三代基因測序數據的存儲服務器,其特征在于:
所述數據管理模塊,還用于接收到數據讀取請求后,若被請求數據所在的數據存儲池為寫滿狀態(tài),則直接讀取所述被請求數據;和/或,
接收到數據修復請求后,確定更新后的硬盤存儲空間;將寫入的修復數據存儲至所述更新后的硬盤存儲空間中;和/或,
檢測到系統(tǒng)掛載信號后,掃描硬盤存儲空間中的數據檢索信息,所述數據檢索信息包括數據存儲目錄項和數據索引節(jié)點;將所述數據檢索信息緩存至系統(tǒng)內存中;
接收到隨機數據讀取請求后,根據所述系統(tǒng)內存中的所述數據檢索信息確定被請求數據所在的目標目錄和目標索引節(jié)點。
9.根據權利要求8所述的用于第三代基因測序數據的存儲服務器,其特征在于,還包括:
Qos管理模塊,用于設定流量窗口;接收到數據寫入請求或數據讀取請求后,根據所述流量窗口對數據寫入流量或數據讀取流量進行調整;以及:
獲取所述數據寫入請求或所述數據讀取請求的延遲時長;若所述延遲時長小于預期時長,則按照設定比例增大所述流量窗口;若所述延遲時長大于所述預期時長,則按照設定比例縮小所述流量窗口。
10.一種分布式文件系統(tǒng),其特征在于,包括多臺如權利要求7-9任一項所述的用于第三代基因測序數據的存儲服務器,還包括:
全局數據分布管理器,用于對多臺存儲服務器中的所有硬盤存儲空間進行寫入操作和讀取操作的區(qū)分化處理。
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