[發(fā)明專利]一種基于深度學習的鱗狀食道癌放化療效果預測方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110521381.8 | 申請日: | 2021-05-13 |
| 公開(公告)號: | CN113362927A | 公開(公告)日: | 2021-09-07 |
| 發(fā)明(設計)人: | 傅劍華;胡藝懷;羅孔嘉 | 申請(專利權)人: | 中山大學腫瘤防治中心(中山大學附屬腫瘤醫(yī)院;中山大學腫瘤研究所) |
| 主分類號: | G16H20/40 | 分類號: | G16H20/40;G06T7/00;G06K9/34;G06K9/62;G06N3/04 |
| 代理公司: | 廣州藍晟專利代理事務所(普通合伙) 44452 | 代理人: | 欒洋洋 |
| 地址: | 510060 *** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 深度 學習 食道癌 化療 效果 預測 方法 | ||
1.一種基于深度學習的鱗狀食道癌放化療效果預測方法,其特征在于,包括:
步驟一:從圖像存檔和通信系統(tǒng)中提取預處理后的CT增強圖像,分割出感興趣的瘤內和瘤周區(qū)域;
步驟二:將分割后感興趣的瘤內和瘤周區(qū)域圖像進行高斯濾波、小波濾波和拉普拉斯濾波處理,并提取處理后的圖像特征;
步驟三:使用提出的圖像特征訓練深度學習神經(jīng)網(wǎng)絡模型;
步驟四:放射組學特征和病理生理特征分析;
步驟五:統(tǒng)計分析。
2.如權力要求1所述的基于深度學習的鱗狀食道癌放化療效果預測方法,其特征在于,所述步驟一中使用ITK-SNAP圖像分割軟件進行圖像分割。
3.如權力要求1所述的基于深度學習的鱗狀食道癌放化療效果預測方法,其特征在于,所述步驟二為了去除潛在的冗余特征,降低數(shù)據(jù)維數(shù),在訓練集中進行了特征選擇,特征選擇包括步驟:
S21:采用皮爾森相關系數(shù)對相關特征進行分組,保留最具預測性的特征;
S22:將每組的相關特征擬合到?jīng)Q策樹模型中,并根據(jù)其對預測切除的原發(fā)腫瘤和淋巴結內沒有存活的殘余腫瘤細胞的反應狀態(tài)的貢獻程度進行排序,最重要的特征被選為這一組的代表,并被保留;
S23:采用遞歸特征添加算法的包裝方法來尋找最可預測的特征;
S24:根據(jù)特征的相關重要性進行排序,并使用相應的分類器在遞歸過程中添加有貢獻的特征。
4.如權力要求1所述的基于深度學習的鱗狀食道癌放化療效果預測方法,其特征在于,步驟三中的分類器包括但不限于線性回歸、線性核支持向量機、徑向基核支持向量機、k近鄰、樸素貝葉斯、決策樹、隨機森林和極端梯度增強。
5.如權力要求1所述的基于深度學習的鱗狀食道癌放化療效果預測方法,其特征在于,步驟四中包括步驟:計算表達水平和放射組學得分之間的斯皮爾曼等級相關系數(shù),包括步驟:
S41:將多個基因按系數(shù)和輸入進行排序,使用基因集富集分析重排序工具進行基因集富集分析;
S42:對分子特征庫中的基因本體生物過程基因集合進行測試;
S43:利用Cytoscape上的富集圖對富集分析結果進行驗證,構建Q值小于0.05的富集基因集富集圖譜;
S44:使用Auto Annotate工具進行聚類,然后手動修改和標記。
6.如權力要求1所述的基于深度學習的鱗狀食道癌放化療效果預測方法,其特征在于,步驟五包括步驟:
S51:分類變量采用χ2或Fisher精確檢驗,數(shù)值變量采用Kruskal-Wallis檢驗;
S52:放射組學模型的性能通過AUC進行量化,差異P值通過Delong檢驗計算;
S53:用約登指數(shù)確定準確性、敏感性和特異性的截止點;
S54:通過標定曲線和判定曲線來檢驗標定性能和臨床應用價值;
S55:采用單變量分析方法檢測臨床參數(shù)與切除的原發(fā)腫瘤和淋巴結內沒有存活的殘余腫瘤細胞的相關性,采用分層分析方法評價臨床參數(shù)對放化療療效的影響。
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