[發明專利]一種蘿卜抗根腫病的分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202110503552.4
• 申請日: 2021-05-09
• 公開（公告）號: CN113234846B
• 公開（公告）日: 2022-02-01
• 發明（設計）人: 嚴承歡;邱正明;黃燕;崔磊;鄧曉輝;矯振彪;張振興;劉志雄;袁偉玲;朱鳳娟
• 申請（專利權）人: 湖北省農業科學院經濟作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 武漢藍寶石專利代理事務所(特殊普通合伙) 42242
• 代理人: 嚴超

1.一種用于鑒定蘿卜抗根腫病基因型或用于鑒定蘿卜抗根腫病品種的插入/缺失片段，其特征在于，所述插入/缺失片段包括HB166片段和HB169片段，所述HB166片段的序列如SEQ ID NO:1所示，所述HB169片段的序列如SEQ ID NO:2所示。

2.一種用于鑒定蘿卜抗根腫病基因型或用于鑒定蘿卜抗根腫病品種的分子標記引物，其特征在于，所述引物能夠擴增出權利要求1中所述的插入/缺失片段。

3.根據權利要求2所述的用于鑒定蘿卜抗根腫病基因型或用于鑒定蘿卜抗根腫病品種的分子標記引物，其特征在于，引物為HB166片段正向引物：GAGGCAGTGAACATCCACCA、反向引物：GGCTGTTGATGAGAGGGAGG，和HB169片段正向引物：ATAAAGCCCACATGCCGAGT、反向引物TGTGCAACGGGTGGTGTAAT。

4.權利要求1所述的用于鑒定蘿卜抗根腫病基因型或用于鑒定蘿卜抗根腫病品種的插入/缺失片段的篩選方法，其特征在于，包括以下步驟：將多個抗感根腫病蘿卜重測序數據與蘿卜參考基因組比對，采用GATK4.0分析抗感材料間的變異，選擇抗病材料和感病材料之間具有＞70bp差異的位點設計引物，根據鑒定的準確性篩選所設計的引物，最終獲得權利要求1所述的兩個高質量的標記。

5.一種鑒定蘿卜抗根腫病基因型或抗根腫病品種的方法，其特征在于，包括以下步驟：

（1）提取待測蘿卜樣本中的總DNA；

（2）以待測蘿卜的總DNA為模板，利用權利要求3所述的分子標記引物進行擴增并電泳檢測；

（3）基因型或品種的判定，判定的原則是：采用HB166引物擴增的反應體系中出現了466bpd大小帶型和/或HB169引物擴增的反應體系中出現了363bp大小帶型的為抗根腫病基因型。

6.一種用于鑒定蘿卜抗根腫病基因型或抗根腫病品種的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包括權利要求2所述的分子標記引物。

7.權利要求1所述的插入/缺失片段或權利要求2~3所述的分子標記引物或權利要求6所述的試劑盒在蘿卜抗根腫病基因型的鑒定和抗根腫病品種鑒定中的應用。