[發明專利]一種用于構建蘿卜分子身份證的SV分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202110503496.4
• 申請日: 2021-05-09
• 公開（公告）號: CN113186332B
• 公開（公告）日: 2022-02-15
• 發明（設計）人: 嚴承歡;邱正明;崔磊;矯振彪;張振興;朱鳳娟;黃燕;鄧曉輝;劉志雄;袁偉玲
• 申請（專利權）人: 湖北省農業科學院經濟作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 武漢藍寶石專利代理事務所(特殊普通合伙) 42242
• 代理人: 嚴超

本發明涉及基因工程技術領域，具體涉及一種用于構建蘿卜分子身份證的SV分子標記引物及其應用。本發明采用大片段的結構變異開發了多個分子標記，采用普通瓊脂糖凝膠即可完成檢測，安全無毒，操作簡便，在蘿卜的每個染色體上均至少含有一個分子標記，每個位點有3種可能性(AA，Aa和aa)，總計3⁹＝19683種基因型，以此構建具有代表性的蘿卜分子身份證。本發明開發的基于SV分子標記的蘿卜分子身份證，能夠實現不同蘿卜品種純度和親緣關系鑒定，對蘿卜分子育種和種子生產具有重要應用價值。

技術領域

本發明涉及基因工程技術領域，具體涉及一種用于構建蘿卜分子身份證的SV分子標記及其應用。

背景技術

蘿卜(Raphanus sativus L.)屬于十字花科蘿卜屬蔬菜，其幼苗、肉質根和葉片均可食用，種子可入藥。我國是蘿卜生產大國，常年的蘿卜種植面積約120萬公傾，總產量約4000萬噸。蘿卜產業在保障農民收入、維持夏秋季蔬菜供應方面起著重要作用，栽培蘿卜形態多樣，可以分為亞洲大蘿卜(R.sativus var.hortensis)、歐洲櫻桃蘿卜(R.sativusvar.sativus)、黑蘿卜(R.sativus var.niger)、油用蘿卜(R.sativus var.chinensis)以及鼠尾蘿卜(R.sativus var.caudatus)。

在生產上，蘿卜品種繁多，對不同品種進行親緣關系鑒定是進行種子生產與銷售的前提。因此，開發能夠鑒別不同蘿卜品種材料的分子標記，構建蘿卜的分子標記身份證，對鑒定蘿卜品種純度和親緣關系具有重要意義。

分子標記主要有限制性內切酶片段長度多態性(Restriction Fragment LengthPolymorphism，RFLP)、隨機擴增多態性DNA標記(Random Amplified Polymorphic DNA，RAPD)、擴增片段長度多態性(Amplified Fragment Length Polymorphism，AFLP)、簡單重復序列標記(Simple Sequence Repeats，SSR)、插入缺失標記(insertion-deletion，InDel)和單核苷酸多態性分子標記(single nucleotide polymorphism，SNP)等。其中RFLP、RAPD、SSR和AFLP分子標記數目較少且檢測難度大，SNP分子標記開發成本和檢測成本高昂，InDel分子標記具有標記數目多、準確性高、檢測安全無毒等特點，是分子育種中的理想標記，但是難以通過普通瓊脂糖凝膠進行區分。

發明內容