[發(fā)明專利]一種與中國花鱸抗逆性相關(guān)的SNP位點及其應用

有效

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• 申請日: 2021-05-09
• 公開（公告）號: CN113265470B
• 公開（公告）日: 2022-03-15
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 朱俊杰;陸國富;葉金云
• 申請（專利權(quán)）人: 湖州師范學院
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京識然知識產(chǎn)權(quán)代理事務所(普通合伙) 11975
• 代理人: 曾慶國

本發(fā)明提供一種與中國花鱸抗逆性相關(guān)的SNP位點，所述的位點位于序列為SEQ ID NO：1的核苷酸片段的第264位，其堿基為G或C；編碼蛋白由Lys替換為Asn。本發(fā)明提供的SNP位點用于選育具有更好抗逆性的中國花鱸個體。本發(fā)明通過分析不同抗病性能的中國花鱸的基因，發(fā)現(xiàn)中國花鱸的CD4?1基因上存在與抗逆性相關(guān)的SNP位點，基因型為264CC的純合型個體具有更好的免疫性能。因此，生產(chǎn)中可選擇該基因型個體作為親本進行遺傳育種。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于魚類遺傳育種技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種與中國花鱸抗逆性相關(guān)的SNP位點及其應用。

背景技術(shù)

花鱸(Lateolabrax maculatus)，屬于鱸形目，鮨科，花鱸屬，分布于我國、日本和朝鮮半島近海及河口地帶，海水中繁殖，各類型水域均可生長，花鱸是我國重要的海產(chǎn)經(jīng)濟魚類，在海水、半咸水、淡水或河口地區(qū)均可存活與生長。

我國花鱸養(yǎng)殖區(qū)域較廣，主要集中在廣東、山東、福建、浙江、廣西等省區(qū)的沿海地區(qū)。而且內(nèi)陸?zhàn)B殖水域?qū)|苗種需求也在增加。但目前我國花鱸產(chǎn)業(yè)正面臨著空前挑戰(zhàn)，主要表現(xiàn)在種質(zhì)退化，缺乏優(yōu)良花鱸品種，北方地區(qū)仍然以撈取野生魚苗作為苗種，導致野生花鱸資源遭到破壞，人工培育苗種成活率極低；沒有進行定向選育，尚未建立科學育種技術(shù)，長期近親繁殖導致生長和抗病性能下降。因此，選育出抗逆能力強、肌肉品質(zhì)好的花鱸優(yōu)良品種就成為鱸魚養(yǎng)殖中面臨的關(guān)鍵問題之一。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種與中國花鱸抗逆性相關(guān)的SNP位點，并用于選育具有更好疾病抗逆性的中國花鱸親本，從而為花鱸的健康養(yǎng)殖提供有效的遺傳育種分子標記。

本發(fā)明所提供的與中國花鱸抗逆性相關(guān)的SNP位點，所述的位點位于序列為SEQID NO：1的核苷酸片段的第264位，其堿基為G或C；編碼蛋白由Lys(K)替換為Asn(N)；

本發(fā)明提供的SNP位點用于選育具有更好抗逆性的中國花鱸個體。

所述的抗逆性，是指免疫性能；

本發(fā)明另一個方面提供一種篩選具有更好抗逆性的中國花鱸個體的方法，是通過檢測上述的SNP位點來實現(xiàn)的；

所述的方法，是通過PCR擴增測序的方法來檢測待篩選的中國花鱸個體，其中基因型為264CC的純合型個體具有更好的免疫性能；

所述的PCR擴增引物的序列信息如下：

上游引物:5′-acagttacccttaagcctccagtgggta-3′(SEQ ID NO：2)，

下游引物:5′-ggagaggtccacaacagtaacaga-3′(SEQ ID NO:3)。

本發(fā)明通過分析不同抗病性能的中國花鱸的基因，發(fā)現(xiàn)中國花鱸的 CD4-1基因上存在與抗逆性相關(guān)的SNP位點，基因型為264CC的純合型個體具有更好的免疫性能。因此，生產(chǎn)中可選擇該基因型個體作為親本進行遺傳育種。

具體實施方式

單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是指基因組DNA 上由單個核苷酸突變所引起的DNA序列多態(tài)性，通過確定SNP及基因型分型進行選種。

本發(fā)明通過分析不同抗病性能的中國花鱸的基因，發(fā)現(xiàn)中國花鱸的 CD4-1基因上存在與抗逆性相關(guān)的SNP位點，基因型為264CC的純合型個體具有更好的免疫性能。

下面通過實施例對本發(fā)明做進一步說明。

實施例1：篩選SNP位點

1、花鱸魚總RNA的提取：

按照Trizol方法從花鱸魚的肝臟中提取總RNA。