[發明專利]神經影像標記物形態學融合分類指數的構建方法及應用有效
| 申請號: | 202110494544.8 | 申請日: | 2021-05-07 |
| 公開(公告)號: | CN113222001B | 公開(公告)日: | 2022-06-28 |
| 發明(設計)人: | 秦文;于春水;謝穎瀅;張士杰;丁皓 | 申請(專利權)人: | 天津醫科大學 |
| 主分類號: | G06V10/764 | 分類號: | G06V10/764;G06V10/80;G06K9/62;G06N20/00;G16H20/70;G16H30/20;G16H50/20 |
| 代理公司: | 天津翰林知識產權代理事務所(普通合伙) 12210 | 代理人: | 付長杰 |
| 地址: | 300070 *** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 神經 影像 標記 形態學 融合 分類 指數 構建 方法 應用 | ||
1.一種神經影像標記物形態學融合分類指數的構建方法,該構建方法包括以下內容:
獲取M個中心的結構MRI數據,提取腦結構像特征數據,M為大于1的整數;
以各中心數據進行獨自訓練,分別建立各中心的分類模型,獲得M個中心的分類模型,形成模型庫;
對于任意一個樣本,在所有中心的分類模型,計算出該樣本在每個模型每個特征的分類權重值,即SHAP矩陣,SHAP矩陣的維度為特征數×模型數,特征數為所提取的腦結構像特征數據的個數B;然后以每個模型訓練時使用的樣本量為權重,按照公式(1)計算獲得單一的形態學融合分類指數MICI值;
其中,Si代表分類模型i訓練時使用的樣本量,B代表特征總數,ai代表了特征a在分類模型i中的SHAP值,i=1~M。
2.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述分類模型以XGBoost分類器構建,在訓練的過程中,使用網格搜索來優化分類器的參數;
在Python環境下,使用XGBoost下的XGBClassifier進行訓練,并且在訓練的過程中,使用網格搜索來優化分類器的參數,具體的參數選擇范圍如下:梯度計算次數范圍:100-1001,步長100;決策樹的最大深度范圍:1-10;可用的樣本數比例范圍為:0.5-1;節點分裂所需的最小損失函數下降值范圍:0-5,步長為0.2;權重的L1正則化項依次取值為:[5,2,1,0.1,0.01,0.001,0];權重的L2正則化項依次取值為:[5,2,1,0.1,0.01,0.001,0];學習率依次取值如下:[0.01,0.02,0.05,0.1,0.15,0.2]。
3.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,腦結構MRI數據包括但不限于T1加權成像、T2加權成像、FLAIR成像、彌散加權成像、彌散張量成像、磁敏感加權圖像等結構成像數據;腦結構形態學影像特征包括但不限于皮層厚度、皮層體積、皮層表面積、皮層迂曲度、皮層下核團體積、纖維束體積及彌散定量和腦組織組學特征。
4.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,對于一個新加入的中心,不需要提供原始MRI數據,只需要在自己中心按照既定的方法訓練出分類模型,然后把該分類模型橫向擴展到模型庫中,樣本只需要按照公式(1)重新計算MICI值即可。
5.根據權利要求1所述的構建方法,其特征在于,所述腦結構像特征數據包括皮層厚度、皮層體積、皮層表面積、皮層下體積及7個全腦指標在內的484個腦結構像特征,其中7個全腦指標為全腦總體積、全腦皮層灰質體積、全腦皮層下灰質體積、全腦白質體積、全腦白質表面積及全腦平均皮層厚度;
對腦結構像特征數據進行數據預處理:數據預處理包括協變量回歸及歸一化過程,具體是:
①協變量回歸,協變量的回歸使用matlab軟件的regress函數進行,其中納入的被回歸變量包括年齡、性別、年齡的平方及全腦體積;
②歸一化:歸一化采用的方法為高斯歸一化,從而使樣本服從正態分布;
得到了預處理后的每個中心的標準化特征矩陣,并進一步納入后續分析中。
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