[發明專利]一種基于三維MRI圖像的多平面乳腺腫瘤分割方法在審
| 申請號: | 202110489066.1 | 申請日: | 2021-04-30 |
| 公開(公告)號: | CN113192036A | 公開(公告)日: | 2021-07-30 |
| 發明(設計)人: | 王波;范紅賓;童守迪;袁鵬;王狄 | 申請(專利權)人: | 哈爾濱理工大學 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/11;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 150080 黑龍江省哈*** | 國省代碼: | 黑龍江;23 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 三維 mri 圖像 平面 乳腺 腫瘤 分割 方法 | ||
1.基于三維MRI圖像的多平面乳腺腫瘤分割方法,包括以下步驟:
A,分別從三個投影面(橫切面、矢狀面和冠狀面)的方向對3D-MRI圖像切片成若干個2D圖像,并進行預處理;
B,將每組2D圖像送入其對應所屬投影面的深度網絡模型進行分割;
C,將每個投影面分割得到的2D切片堆疊成一個三維體,對3個不同的三維體采用合適的組合規則融合在一起,作為最終3D分割結果。
2.根據權利要求1所述的基于三維MRI圖像的多平面乳腺腫瘤分割方法,其特征在于,所述的步驟A中將3D-MRI圖像分別從橫切面、矢狀面和冠狀面三個方向進行切片,根據腫瘤標簽把原圖中含有腫瘤信息的切面輸出為2D圖像;并對得到的2D切片進行歸一化、二值化預處理。
3.根據權利要求1所述的基于三維MRI圖像的多平面乳腺腫瘤分割方法,其特征在于,所述的步驟B中2D圖像分割包括以下內容:
A,從每個投影面中分割圖像的內部模型是2D U-net,對分別對來自橫切面、矢狀面和冠狀面的2D切片進行分割;
B,對訓練集圖像做旋轉、鏡像等數據增強處理,訓練網絡,調整網絡參數,選擇的優化器是自適應矩估計優化器(Adam),損失函數使用Dice函數和二進制交叉熵損失(BCELoss)混合函數,通過不斷減少loss來優化網絡模型。Loss定義為:
其中,G表示訓練數據的真實標簽值,P表示當前模型的預測值,NP為P中的像素數。
C,利用測試集在2D U-net模型進行測試,保留最佳分割模型。
4.根據權利要求1所述的基于三維MRI圖像的多平面乳腺腫瘤分割方法,其特征在于,所述的步驟C中對三個三維體通過組合規則融合成一個3D分割結果,包括以下內容:
A,每個投影面的分割模型都提供一個由2D切片堆疊在一起的三維體;
B,對來自不同投影面的3個三維體,采用合適的組合規則融合成一個3D體積的分割結果;
C,有多種組合規則,例如:
Q1.“與”:一個體素的類別是由相同體素位置的3個分類器的輸出做邏輯“與”操作,即3個相同位置體素全為腫瘤組織時,輸出為腫瘤組織;
Q2.“或”:一個體素的類別是由相同體素位置的3個分類器的輸出做邏輯“或”操作,即3個相同位置體素中有一個為腫瘤組織時,輸出為腫瘤組織;
Q3.“多數票策略”:一個體素的類別是由相同體素位置的3個分類器的輸出做投票操作,即3個相同位置體素中有兩個及兩個以上為腫瘤組織時,輸出為腫瘤組織。
5.根據權利要求3所述的2D圖像分割的深度網絡模型是改進2D U-net,在主干的編碼器和解碼器之間加入注意力模塊,增強重要的特征(如腫瘤組織特征),抑制不重要的特征,從而提高網絡的表征能力。
6.根據權利要求5所述的注意力模塊,采用空間注意力模塊,中間特征圖(F)作為模塊的輸入,分別進行平均池化和最大池化,再進行7*7的卷積,并接著使用sigmod激活函數生成空間注意特征圖,最后與輸入特征圖做乘法得到輸出特征圖。空間注意模塊的輸出特征圖Fs∈RH×W×C計算如下:
Fs=F×σ(f7×7([MaxPool(F);AvgPool(F)]))
其中,f表示輸入特征圖,Fs表示輸出特征圖,f7×7表示內核大小為7的卷積運算,σ表示Sigmoid函數。
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