[發明專利]一種基于web快速檢測轉座子及其耐藥基因的系統

在審

• 申請號: 202110486575.9
• 申請日: 2021-04-30
• 公開（公告）號: CN113192561A
• 公開（公告）日: 2021-07-30
• 發明（設計）人: 周凱;朱懷球;劉洋;江小青;侯家恒
• 申請（專利權）人: 深圳市人民醫院;北京大學
• 主分類號: G16B30/10
• 分類號: G16B30/10;G16B35/20;G16B45/00;G16B50/00
• 代理公司: 北京潤澤恒知識產權代理有限公司 11319
• 代理人: 茍冬梅

1.一種基于web快速檢測轉座子及其耐藥基因的系統，其特征在于，所述系統包括：

轉座子序列數據庫模塊，用于存儲轉座子序列及其對應的轉座子序列信息；

轉座子序列數據查詢模塊，用于根據用戶輸入的細菌基因組序列，查詢所述細菌基因組序列對應的轉座子序列信息。

2.根據權利要求1所述的系統，其特征在于，所述轉座子序列數據查詢系統還包括：

轉座子序列數據庫構建模塊，用于收集所述轉座子序列及其對應的轉座子序列信息，構建所述轉座子序列數據庫。

3.根據權利要求2所述的系統，其特征在于，所述轉座子序列數據庫構建模塊包括：

第一轉座子序列數據收集子模塊，用于從文獻數據庫中收集轉座子序列及其對應的轉座子序列信息；

第二轉座子序列數據收集子模塊，用于從現有數據庫中收集轉座子序列及其對應的轉座子序列信息；

轉座子序列數據處理子模塊，用于對收集到的轉座子序列進行篩選，并剔除冗余的轉座子序列；

轉座子序列信息處理子模塊，用于將收集到的所述轉座子序列信息按照預設條目對應存儲，所述預設條目包括：登記號、參考來源、詳細描述、耐藥類型、轉座子家族的分組信息；

轉座子序列數據庫更新子模塊，用于定期更新所述轉座子序列數據庫。

4.根據權利要求3所述的系統，其特征在于，所述轉座子序列數據查詢模塊包括：

轉座子序列簡介子模塊，用于展示轉座子序列的介紹信息；

轉座子序列數據在線查詢子模塊，用于接收用戶輸入的細菌基因組序列，根據所述細菌基因組序列，在所述轉座子序列數據庫中進行查詢，得到查詢結果；

查詢方法簡介子模塊，用于向用戶展示所述轉座子序列數據庫的查詢方法；

意見問題子模塊，用于收集用戶對所述轉座子序列數據庫的反饋信息；

轉座子序列數據查詢系統更新子模塊，用于根據所述反饋信息，更新所述轉座子序列數據查詢系統。

5.根據權利要求4所述的系統，其特征在于，所述轉座子序列數據在線查詢子模塊包括：

轉座子序列比對子模塊，用于將用戶輸入的所述細菌基因組序列與所述轉座子序列數據庫中的各個轉座子序列進行比對，得到初步的比對結果；

結果排序與篩選子模塊，用于對所述初步的比對結果進行排序和篩選，得到最終的比對結果；

耐藥基因檢索子模塊，用于根據所述最終的比對結果，在預先建立好的耐藥基因數據庫中檢索到所述最終比對結果對應的耐藥信息。

6.根據權利要求5所述的系統，其特征在于，所述轉座子序列數據查詢模塊還包括：

結果展示子模塊，用于將所述最終的比對結果以及所述最終比對結果對應的耐藥基因信息以表格形式進行展示，得到轉座子注釋結果表格；

結果下載子模塊，用于供用戶將所述轉座子注釋結果表格下載至本地。

7.根據權利要求1所述的系統，其特征在于，所述轉座子序列查詢系統還包括：

耐藥基因數據庫建立模塊，用于收集目前已發現的耐藥基因序列，將所述耐藥基因序列進行保存，生成所述耐藥基因數據庫。