[發明專利]檢測攜帶風險染色體的胚胎的引物組合物、產品及方法

有效

• 申請號: 202110461984.3
• 申請日: 2021-04-27
• 公開（公告）號: CN113005195B
• 公開（公告）日: 2021-12-14
• 發明（設計）人: 楊蕾蕾;費嘉;張麗娜;喬國枝
• 申請（專利權）人: 北京嘉寶仁和醫療科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 北京金智普華知識產權代理有限公司 11401
• 代理人: 巴曉艷

本發明提供了一種檢測攜帶風險染色體的胚胎的引物組合物、產品及方法，所述引物組合物包括致病基因NF1CDS區域及致病基因NF1上下游2M內的SNP位點的引物，本發明能夠在檢測SNP位點的同時檢測胚胎中的致病位點，通過家系與胚胎中致病位點的連鎖關系構建單體型從而進行胚胎植入前單基因遺傳學檢測，所述試劑盒對男方、女方和胚胎進行單體型分析和致病位點直接測序檢測，測序得到攜帶致病位點的胚胎所對應的單體型為風險染色體，則另外一條為正常染色體，擴大了胚胎植入前單基因遺傳學檢測的應用范圍，可以應用于由于新發突變或者其他原因無法獲得完整家系的情況。

【技術領域】

本發明涉及胚胎移植檢測技術領域，尤其涉及一種檢測攜帶風險染色體的胚胎的引物組合物、產品及方法。

【背景技術】

單基因病是由一個或一對等位基因突變引起的疾病，其遺傳方式及再發風險符合孟德爾規律。大部分單基因病目前沒有有效的治療方法。胚胎植入前單基因遺傳學檢測(Preimplantation Genetic Testing for Monogenic，PGT-M)通過對胚胎進行遺傳學檢測，選擇正常胚胎移植從而避免因選擇性流產給孕婦及家庭帶來的傷害。

直接對胚胎致病位點進行檢測，有可能因等位基因脫扣(Allele drop-out,ADO)而導致誤診。采用單核苷酸多態性(single-nucleotide polymorphism，SNP)連鎖分析結合變異位點檢測，可避免胚胎囊胚細胞單細胞擴增過程中的ADO。SNP是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性，是人類可遺傳變異中最常見的一種。位于一條染色體特定區域的一組相互關聯，并傾向于以整體遺傳給后代的單核苷酸多態性的組合，被稱作單體型(haplotype)。利用SNP位點構建家系單體型，通過連鎖關系可以將致病基因所在的染色體與正常染色體區分開來，從而判斷胚胎是否攜帶致病基因，可以避免胚胎直接檢測中因等位基因脫扣而導致的誤診，提高異常胚胎的檢出率，改善妊娠結局。

現有技術利用SNP連鎖分析的方法進行胚胎植入前單基因遺傳學檢測需要完整的家系樣本(例如男方、女方、先證者；或者男方、男方父母、女方、女方父母；或者男方、女方、其他家系成員等)通過連鎖分析進行單體型構建、區分風險染色體，從而對胚胎進行單體型分析，選擇不攜帶風險染色體的胚胎。不足之處是，當受檢者沒有完整家系時，無法通過連鎖關系區分風險染色體。Ⅰ型神經纖維瘤是一種常染色體顯性遺傳病，其中約半數患者由于NF1基因的新發變異導致(GeneReviews，Last Revision:June 6,2019)，患病個體的后代有50％的風險遺傳變異的NF1等位基因，新發變異家系無法通過家系連鎖關系區分風險染色體。

因此，有必要研究一種檢測攜帶風險染色體的胚胎的引物組合物、產品及方法來應對現有技術的不足，以解決或減輕上述一個或多個問題。

【發明內容】

有鑒于此，本發明提供了一種檢測攜帶風險染色體的胚胎的引物組合物、產品及方法，能夠在檢測SNP位點的同時檢測胚胎中的致病位點，通過家系與胚胎中致病位點的連鎖關系構建單體型從而進行胚胎植入前單基因遺傳學檢測，所述試劑盒對男方、女方和胚胎進行單體型分析和致病位點直接測序檢測，測序得到攜帶致病位點的胚胎所對應的單體型為風險染色體，則另外一條為正常染色體，擴大了胚胎植入前單基因遺傳學檢測的應用范圍，可以應用于由于新發突變或者其他原因無法獲得完整家系的情況。

一方面，本發明提供一種檢測攜帶風險染色體的胚胎的引物組合物，所述引物組合物包括致病基因NF1 CDS區域及致病基因NF1上下游2M內的SNP位點的引物。

如上所述的方面和任一可能的實現方式，進一步提供一種實現方式，所述致病基因NF1為人類致病基因NF1。

如上所述的方面和任一可能的實現方式，進一步提供一種實現方式，所述致病基因NF1 CDS及內含子區域的序列為SEQID NO：143-338。