[發明專利]一種皮膚衰老蛋白標志物—1433T蛋白及其無創性提取方法在審
| 申請號: | 202110461243.5 | 申請日: | 2021-04-27 |
| 公開(公告)號: | CN113651878A | 公開(公告)日: | 2021-11-16 |
| 發明(設計)人: | 楊森;張學軍;張博 | 申請(專利權)人: | 楊森 |
| 主分類號: | C07K14/47 | 分類號: | C07K14/47;C12P21/06;G01N33/68 |
| 代理公司: | 北京圖億天下專利代理有限公司 11974 | 代理人: | 耿巖 |
| 地址: | 230022 安徽省合肥市蜀*** | 國省代碼: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 皮膚 衰老 蛋白 標志 1433 及其 無創性 提取 方法 | ||
1.一種無創提取皮膚中1433T蛋白的方法,該方法包括以下步驟:
(1)受試者表皮皮膚樣本取樣:將3M醫用膠貼貼于前臂曲側部位,1分鐘后,輕輕揭下3M膠貼片,得到膠帶狀皮膚樣品;
(2)干燥的肽段樣品的獲得:1)將膠帶狀皮膚樣品切成小塊,沉積在玻璃板上在轉移到離心管;
2)添加不含SDS的適量裂解緩沖液樣品,加入2mM EDTA,1XCocktail,然后放在冰5分鐘,然后,添加10mM DTT,將樣品浸泡過夜;
3)在離心力25,000g,4℃下離心15分鐘,回收上清液并用10mM處理DTT在56℃的水浴中放置1小時;
4)然后用55mM IAM處理,在室溫黑暗中孵育45分鐘,并在25,000g,4℃下離心15分鐘,得到最終的蛋白質溶液上清液;蛋白質濃度使用Bradford方法進行測量,提取的蛋白質通過12%的SDS-PAGE進行質控;每份樣品取100μg蛋白質,加入胰蛋白酶并于37℃下水解4小時;隨后再次以相同的比例添加胰蛋白酶在37℃下酶解8小時;水解產物使用Strata X色譜柱對多肽進行脫鹽并在真空下干燥,即得到干燥的肽段樣品。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于:表皮皮膚樣本中1433T蛋白基于質譜的相對含量的測定方法,包括如下步驟:(1)受試者表皮皮膚樣本取樣:將3M醫用膠貼貼于前臂曲側部位,1分鐘后,輕輕揭下3M膠貼片,得到膠帶狀皮膚樣品;
(2)干燥的肽段樣品的獲得:1)將膠帶狀皮膚樣品切成小塊,沉積在玻璃板上在轉移到離心管;
2)添加不含SDS的適量裂解緩沖液樣品,加入2mM EDTA,1XCocktail,然后放在冰5分鐘,然后,添加10mM DTT,將樣品浸泡過夜;
3)在離心力25,000g,4℃下離心15分鐘,回收上清液并用10mM處理DTT在56℃的水浴中放置1小時;
4)然后用55mM IAM處理,在室溫黑暗中孵育45分鐘,并在25,000g,4℃下離心15分鐘,得到最終的蛋白質溶液上清液;蛋白質濃度使用Bradford方法進行測量,提取的蛋白質通過12%的SDS-PAGE進行質控;每份樣品取100μg蛋白質,加入胰蛋白酶并于37℃下水解4小時;隨后再次以相同的比例添加胰蛋白酶在37℃下酶解8小時;水解產物使用Strata X色譜柱對多肽進行脫鹽并在真空下干燥,即得到干燥的肽段樣品;
(3)檢測
將干燥的肽段樣品用流動相A(2%ACN,0.1%FA)復溶,20,000g離心10分鐘后,取上清進樣;通過U1433T蛋白LC進行分離;樣品首先進入trap柱富集并除鹽,隨后與自裝C18柱串聯,以500nl/min流速通過如下有效梯度進行:
分離:0-5min,5%流動相B(98%ACN,0.1%FA);5-160min,流動相B從5%線性升至35%;160-170min,流動相B從35%升至80%;170-175min,80%流動相B;176-180min,5%流動相B;納升液相分離末端直接連接質譜儀;
DDA質譜檢測
經過液相分離的肽段通過nanoESI源離子化后進口到串聯質譜儀Q-Exactive HF模式檢測;主要參數設置:離子源電壓設置為1.6kV;一級質譜掃描范圍350~1500m/z;分辨率設置為60,000;二級質譜起始m/z固定為100;分辨率15,000。二級碎裂的母離子篩選條件為:電荷2+到7+,峰強度超過10,000的強度排在前20的母離子;離子碎裂模式為HCD,碎片離子在Orbitrap中進行檢測;動態排除時間設定為30s;AGC設置為:一級3E6,二級1E5;
DIA質譜檢測
經過液相分離的肽段通過nanoESI源離子化后進口到串聯質譜儀Q-Exactive HF模式檢測;主要參數設置:離子源電壓設置為1.6kV;一級質譜掃描范圍350~1500m/z;分辨率設置為120,000;將350-1500Da均分為40個窗口進行碎裂及信號采集;離子碎裂模式為HCD,碎片離子在Orbitrap中進行檢測;動態排除時間設定為30s;AGC設置為:一級3E6,二級1E5。
3.根據權利要求2所述的1433T蛋白測定方法,其特征在于:用于檢測1433T蛋白含量的物質為質譜鑒定試劑、抗體或其抗原結合片段;所述用于檢測1433T蛋白含量的物質為軌道阱高分辨率質譜儀。
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