[發(fā)明專利]檢測(cè)染色體小片段異常單倍型的引物組合物、產(chǎn)品及方法

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202110460592.5
• 申請(qǐng)日: 2021-04-27
• 公開（公告）號(hào): CN113005194A
• 公開（公告）日: 2021-06-22
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 邢麗賢;費(fèi)嘉;張麗娜;喬國(guó)枝
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 北京嘉寶仁和醫(yī)療科技有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/6883
• 分類號(hào): C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 北京金智普華知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11401
• 代理人: 巴曉艷

本發(fā)明提供了一種檢測(cè)染色體小片段異常單倍型的引物組合物、產(chǎn)品及方法，所述引物組合物包括特異擴(kuò)增Xq22.2染色體小片段異常區(qū)域及特異擴(kuò)增Xq22.2上下游2M內(nèi)的SNP位點(diǎn)的引物，本發(fā)明可用于分析親本來源的染色體小片段異常，根據(jù)男方、女方及子代或男方、女方、攜帶異常片段一方的父母，根據(jù)家系關(guān)系及單體型分析原理確定染色體異常片段的風(fēng)險(xiǎn)染色體，進(jìn)而通過分析胚胎單體型判讀胚胎的染色體小片段異常的遺傳情況，本發(fā)明擴(kuò)大了胚胎植入前單基因遺傳學(xué)檢測(cè)可應(yīng)用的范圍，經(jīng)過實(shí)驗(yàn)證明效果可靠。

【技術(shù)領(lǐng)域】

本發(fā)明涉及胚胎移植檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種檢測(cè)染色體小片段異常單倍型的引物組合物、產(chǎn)品及方法。

【背景技術(shù)】

人類已知的染色體疾病有200多種。大多數(shù)染色體疾病由染色體數(shù)目異常引起，以唐氏綜合征最為普遍。另有一部分染色體疾病因缺失或重復(fù)一段染色體片段(染色體拷貝數(shù)變異，copy number variations，CNVs)而引起，統(tǒng)稱為染色體微缺失/微重復(fù)綜合征。染色體微缺失/微重復(fù)主要指小于5Mb大小的染色體片段異常，染色體拷貝數(shù)變異在臨床癥狀診斷不明和識(shí)別胎兒染色體疾病方面具有重要作用。染色體疾病臨床表型多樣，表現(xiàn)為多發(fā)性先天畸形、肢體殘疾、發(fā)育遲緩、智力障礙、癲癇癥、自閉癥和學(xué)習(xí)障礙等(J Mol Diagn2014,16:519e526；http://dx.doi.org/10.1016/j.jmoldx.2014.05.002)。

染色體微缺失/微重復(fù)部分起因于上代生殖細(xì)胞和受精卵的遺傳物質(zhì)突變。杜絕遺傳病患兒的出生仍是目前最有效的手段，以往通過產(chǎn)前診斷在妊娠16-20周進(jìn)行選擇性流產(chǎn)，阻止患兒的出生。植入前遺傳學(xué)診斷(preimplantation genetic diagnosis,PGD)是輔助生殖技術(shù)和分子生物學(xué)技術(shù)相結(jié)合而發(fā)展起來的一門新的診斷技術(shù)，通過胚胎活檢技術(shù)獲得5-10個(gè)囊胚期細(xì)胞進(jìn)行遺傳學(xué)診斷分析(《胚胎植入前遺傳學(xué)診斷/篩查專家共識(shí)》,中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志2018,35(2):151-155)，選擇正常、無缺陷的健康胚胎植入子宮繼續(xù)妊娠，達(dá)到優(yōu)生的目的，可以避免傳統(tǒng)的產(chǎn)前診斷技術(shù)引起的出血、感染等并發(fā)癥以及流產(chǎn)和引產(chǎn)給孕婦造成的身心痛苦，并避免由此引起的倫理上的爭(zhēng)議。

目前檢測(cè)胚胎植入前檢測(cè)染色體拷貝數(shù)的方法主要有熒光原位雜交(fluorescence in situ hybridization，F(xiàn)ISH)、微陣列比較基因組雜交(arraycomparative genomic hybridization,aCGH)、單核苷酸多態(tài)性微陣列技術(shù)(SNP array)和高通量測(cè)序技術(shù)(Next-Generation Sequencing，NGS)。采用FISH進(jìn)行染色體拷貝數(shù)分析,需提前驗(yàn)證患者夫婦外周血中期染色體的核型,同時(shí)在間期核上檢測(cè)分析探針的熒光強(qiáng)度及特異性。微陣列技術(shù)技術(shù)難度高、缺少專業(yè)知識(shí)和高成本。目前PGT-A和PGT-SR技術(shù)檢測(cè)胚胎染色體拷貝數(shù)異常的分辨率約為4-10Mb,不能滿足檢測(cè)胚胎染色體微缺失/微重復(fù)的需要。

因此，有必要研究一種檢測(cè)染色體小片段異常單倍型的引物組合物、產(chǎn)品及方法來應(yīng)對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的不足，以解決或減輕上述一個(gè)或多個(gè)問題。

【發(fā)明內(nèi)容】

有鑒于此，本發(fā)明提供了一種檢測(cè)染色體小片段異常單倍型的引物組合物、產(chǎn)品及方法，可用于分析親本來源的染色體小片段異常，根據(jù)男方、女方及子代或男方、女方、攜帶異常片段一方的父母，根據(jù)家系關(guān)系及單體型分析原理確定染色體異常片段的風(fēng)險(xiǎn)染色體，進(jìn)而通過分析胚胎單體型判讀胚胎的染色體小片段異常的遺傳情況，本發(fā)明擴(kuò)大了胚胎植入前單基因遺傳學(xué)檢測(cè)可應(yīng)用的范圍，經(jīng)過實(shí)驗(yàn)證明效果可靠。

一方面，本發(fā)明提供一種檢測(cè)染色體小片段異常單倍型的引物組合物，所述引物組合物包括特異擴(kuò)增Xq22.2染色體小片段異常區(qū)域及特異擴(kuò)增Xq22.2上下游2M內(nèi)的SNP位點(diǎn)的引物。

如上所述的方面和任一可能的實(shí)現(xiàn)方式，進(jìn)一步提供一種實(shí)現(xiàn)方式，所述特異擴(kuò)增Xq22.2染色體小片段為人類特異擴(kuò)增Xq22.2染色體小片段異常。