[發明專利]一種利用FGFR4基因SNPs分子標記檢測奶牛產奶性狀的方法及應用

有效

• 申請號: 202110446586.4
• 申請日: 2021-04-25
• 公開（公告）號: CN113151499B
• 公開（公告）日: 2022-07-05
• 發明（設計）人: 孫東曉;劉亞楠;韓博;路永強;麻柱;劉林;唐韶青;楊宇澤;林珊;呂小青
• 申請（專利權）人: 中國農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 何葉喧

本發明公開了一種利用FGFR4基因SNPs分子標記檢測奶牛產奶性狀的方法及應用，所述產奶性狀具體涉及乳脂量和乳蛋白量。g.38574544TA和/或g.38582134CT和/或g.38585427CT分子標記在第一泌乳期與乳脂量和乳蛋白量達到顯著或極顯著水平的關聯(P＝0.0385～0.0068)；在第二泌乳期與產奶量、乳脂量和乳蛋白量達到顯著或極顯著水平的關聯(P＝0.0449～0.0006)。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，涉及一種利用FGFR4基因SNPs分子標記檢測奶牛產奶性狀的方法及應用，所述產奶性狀具體涉及乳脂量和乳蛋白量。

背景技術

成纖維細胞生長因子受體4(fibroblast growth factor receptor 4，FGFR4)位于牛7號染色體上，由18個外顯子構成，基因全長10851bp，其mRNA全長3439bp，共編碼800個氨基酸(牛全基因組序列ARS-UCD1.2)，參與了磷脂酰肌醇3激酶和蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase-Serine/threonine Kinase，PI3K-Akt)信號通路和腺苷酸激活蛋白激酶(Adenosine 5‘-monophosphate(AMP)-activated protein kinase，AMPK)信號通路等。由FGFR4基因編碼的蛋白隸屬于成纖維細胞生長因子受體(fibroblastgrowth factor receptor,FGFR)家族，是一類跨膜酪氨酸激酶蛋白，屬于免疫球蛋白超家族。

目前已發現的成纖維細胞生長因子(fibroblast growth factor,FGF)家族至少有19個成員(FGF1-19)，它們在發育、血管生成、創傷愈合中有重要作用。而它們的功能是通過與成纖維細胞生長因子受體結合后，經過信號傳遞系統，激活相應的基因而實現的。FGFR是一條具有酪氨酸激酶活性的多肽鏈，包括五種密切相關的成員,它們的氨基酸組成和序列相對保守,功能相近，參與介導細胞的生長、分化、遷移、存活和一些病理過程,如血管生成、創傷愈合等。五種FGFR因其對各種配體的親和力和組織分布不同而不同，除FGFR5外均具有三個胞外類免疫球蛋白結構域(分別為IgⅠ、IgⅡ、IgⅢ)，一個跨膜域和一個胞內酪氨酸激酶部分。由于FGFR5缺少胞內酪氨酸激酶部分，因此無受體活性。除了FGFR4外，FGFR1、FGFR2和FGFR3都有兩種IgⅢ剪切異構體，分別稱為IgⅢb和IgⅢc。

研究表明，在肝臟上，FGF15/FGFR4與蛋白酪氨酸磷酸酶(SH2-containingprotein tyrosine phos-phatase，SHP)信號通路整合可調控膽汁酸的合成，而FGFR4基因對肝臟膽固醇和膽汁酸的合成則起到負調控作用。有研究表明，IgⅢb亞型主要由上皮細胞表達，而IgⅢc亞型主要由間充質干細胞表達。FGFR在肝素硫酸鹽蛋白多糖(Heparansulfate proteoglycan，HSPG)的作用下，能與其配體成纖維細胞生長因子(Fibroblastgrowth factors，FGFs)結合，激活位于胞內的酪氨酸激酶從而實現信號轉導，在多種組織中發揮生物學作用，參與胚胎發育、血管生成和腫瘤發生等過程。

DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈，在DNA聚合酶的參與下，根據堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發現，DNA在高溫時也可以發生變性解鏈，當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此，通過溫度變化控制DNA的變性和復性，加入設計引物，DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。聚合酶鏈式反應(PCR)技術是一種特異性DNA體外擴增技術。目前，該技術已經成為最常用、也最重要的分子生物學技術之一。PCR產物經過瓊脂糖凝膠電泳后測序即可進行基因多態的鑒定工作，檢測方法簡單易行。

發明內容

本發明的目的是提供一種利用FGFR4基因SNPs分子標記檢測奶牛產奶性狀的方法及應用。