[發明專利]一種用于檢測奶牛產奶性狀的COL6A1基因SNPs標記及其應用

有效

• 申請號: 202110446582.6
• 申請日: 2021-04-25
• 公開（公告）號: CN113151497B
• 公開（公告）日: 2022-08-02
• 發明（設計）人: 楊宇澤;路永強;唐韶青;孫東曉;林珊;韓博;劉林;麻柱;呂小青;常卓;趙春穎;劉亞楠
• 申請（專利權）人: 北京市畜牧總站
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 白艷

本發明公開了一種用于檢測奶牛產奶性狀的COL6A1基因SNPs標記及其應用。本發明提供了檢測如下14個SNP位點基因型的物質在鑒定或輔助鑒定奶牛產奶性狀中的應用：1:g.145667090CT、1:g.145668599CG、1:g.145669859TC、1:g.145673966TC、1:g.145676602GA、1:g.145676653TC、1:g.145677680CT、1:g.145677709AG、1:g.145677953AG等；各個位點與305天產奶量、乳脂量、乳脂率、乳蛋白量或乳蛋白率相關，可用于奶牛選育。

技術領域

本發明涉及一種分子標記及其應用；特別涉及一種用于檢測奶牛產奶性狀的COL6A1基因SNPs標記及其應用，屬于生物技術領域。

背景技術

VI型膠原α1鏈(collagen type VI alpha 1chain,COL6A1)是一個蛋白質超家族。VI型膠原蛋白是細胞外基質蛋白，是微纖維的主要結構成分，由α1(VI)、α2(VI)和α3(VI)鏈的異源三聚體作為其共同的結構元件。VI型膠原蛋白具有相當重要的意義，在維持各種組織的完整性中發揮作用，是連接細胞與其周圍環境的錨定網絡(Everts等人，1998年；Kuo等人，1997年)。

研究表明，膠原蛋白VI是乳腺細胞外基質的重要組成成分(Siu等人，2008年)。VI型膠原的多域結構不僅使其適合與細胞外環境成分(如II型膠原、核心蛋白聚糖、纖維調節蛋白、透明質酸和纖維連接蛋白)的相互作用，而且可以通過整合素與細胞表面特異性結合(Loeser等人1997)。根據其可能與細胞的相互作用，VI型膠原在各組織中均有表達(Chang和Poole等人，1996；Chang等人，1997；Hagiwara等人，1993；Hambach等人，1998；Poole等人，1992)。COL6A1基因的缺失會影響乳腺癌細胞間充質表型和干性。同時，COL6A1參與Fzd7-Wnt5b信號傳導，誘導乳腺瘤的發生和轉移(Ping等人，2020)。

牛的COL6A1基因位于第1號染色體上，全長19247bp(ARS-UCD1.2)，包含35個外顯子和34個內含子，其mRNA全長3084bp，共編碼1027個氨基酸。

聚合酶鏈式反應(PCR)技術是一種特異性DNA體外擴增技術。以少量的DNA為模板，經過變性-退火-延伸的多次循環，以接近指數擴增的形式產生大量的目標DNA分子，目前，該技術已經成為最常用、也最重要的分子生物學技術之一。PCR產物經過瓊脂糖凝膠電泳后測序即可進行基因多態的鑒定工作，檢測方法簡單易行。

發明內容

本發明一個目的是提供用于檢測如下14個SNP位點中至少一種SNP位點的基因型的物質的如下用途。

本發明提供了用于檢測如下14個SNP位點中至少一種SNP位點的基因型的物質在鑒定或輔助鑒定奶牛產奶性狀中的應用；

所述14個SNP位點為SNP位點1:g.145667090CT、SNP位點1:g.145668599CG、SNP位點1:g.145669859TC、SNP位點1:g.145673966TC、SNP位點1:g.145676602GA、SNP位點1:g.145676653TC、SNP位點1:g.145677680CT、SNP位點1:g.145677709AG、SNP位點1:g.145677953AG、SNP位點1:g.145682517GA、SNP位點1:g.145682638AG、SNP位點1:g.145684727GA、SNP位點1:g.145686763TC和SNP位點1:g.145686889CT。

如下14個SNP位點中至少一種SNP位點作為檢測靶標在鑒定或輔助鑒定奶牛產奶性狀中的應用也是本發明保護的范圍；