[發(fā)明專利]一種基因組模型指導(dǎo)正丙醇補(bǔ)料提高紅霉素產(chǎn)量的方法

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202110446327.1
• 申請(qǐng)日: 2021-04-25
• 公開（公告）號(hào): CN113174418A
• 公開（公告）日: 2021-07-27
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 黃明志;陸舉;柯翔;儲(chǔ)炬
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 華東理工大學(xué);華東理工大學(xué)青島創(chuàng)新研究院
• 主分類號(hào): C12P19/62
• 分類號(hào): C12P19/62;C12N1/20;C12R1/01
• 代理公司: 上海翼勝專利商標(biāo)事務(wù)所(普通合伙) 31218
• 代理人: 翟羽

1.一種提高紅霉素產(chǎn)量的方法，其特征在于，所述方法是在紅色糖多孢菌基因工程菌的發(fā)酵過程中，在發(fā)酵起始后第50～70小時(shí)流加硫酸銨和正丙醇。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，流加正丙醇的速率通過構(gòu)建紅色糖多孢菌全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)模型并對(duì)模型進(jìn)行分析而得到，所述紅色糖多孢菌基因工程菌為sucC基因敲除的紅色糖多孢菌。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，流加正丙醇的速率為0.025～0.075g/L·h。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其特征在于，流加正丙醇的速率為0.05g/L·h。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，流加硫酸銨的速率為0.01～0.03g/L·h。

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，在所述發(fā)酵過程中，控制發(fā)酵體系中pH值為6.7～7.3。

7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述發(fā)酵過程中使用的培養(yǎng)基組分包括：

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，在所述發(fā)酵過程中，調(diào)節(jié)溶氧水平大于30％，調(diào)節(jié)攪拌轉(zhuǎn)速為150～350rpm，調(diào)節(jié)通氣量為0.7～1.3vvm。

9.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于，所述紅色糖多孢菌全基因組代謝網(wǎng)絡(luò)模型的構(gòu)建方法包括紅色糖多孢菌全基因組注釋及檢查、代謝網(wǎng)絡(luò)模型草圖的構(gòu)建，代謝網(wǎng)絡(luò)模型草圖的人工精煉、代謝網(wǎng)絡(luò)模型轉(zhuǎn)化為數(shù)學(xué)模型；

其中，所述人工精煉包括(a)-(d)中的至少一種：

(a)檢查模型中反應(yīng)和代謝物的物質(zhì)和電荷平衡；

(b)確定反應(yīng)方向及輔因子、刪除重復(fù)反應(yīng)、加入自發(fā)反應(yīng)和交換反應(yīng)；

(c)基于轉(zhuǎn)錄組及代謝組學(xué)數(shù)據(jù)，填補(bǔ)代謝途徑中缺失的反應(yīng)途徑；

(d)模型的驗(yàn)證與校正。

10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法，其特征在于，所述代謝網(wǎng)絡(luò)模型轉(zhuǎn)化為數(shù)學(xué)模型包括在MATLAB上使用COBRA工具箱將所述代謝網(wǎng)絡(luò)模型轉(zhuǎn)化為數(shù)學(xué)模型。