[發(fā)明專利]疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202110403251.4
• 申請(qǐng)日: 2021-04-15
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN113095573A
• 公開(kāi)（公告）日: 2021-07-09
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 施偉;孔莘雅;付佳雪;章小斌;張思奇;厲凱彬;韓得滿
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 臺(tái)州學(xué)院
• 主分類號(hào): G06Q10/04
• 分類號(hào): G06Q10/04;G16B15/20
• 代理公司: 北京東方盛凡知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11562
• 代理人: 張雪

1.一種疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，包括以下步驟：

(1)獲取目標(biāo)蛋白三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，通過(guò)分子模擬構(gòu)建蛋白三維結(jié)構(gòu)；

(2)分析目標(biāo)配基在目標(biāo)蛋白表面的識(shí)別位點(diǎn)，確定最優(yōu)識(shí)別位點(diǎn)間距，作為最優(yōu)配基間距；

(3)依據(jù)目標(biāo)層析介質(zhì)的結(jié)構(gòu)特性，根據(jù)所述最優(yōu)配基間距預(yù)測(cè)最優(yōu)配基密度。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，在步驟(2)中，采用分子對(duì)接的方法，分析目標(biāo)配基在目標(biāo)蛋白表面的識(shí)別位點(diǎn)。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，在步驟(2)中，分析目標(biāo)配基在目標(biāo)蛋白表面的識(shí)別位點(diǎn)的主要指標(biāo)為作用間距和作用力。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，分析目標(biāo)配基在目標(biāo)蛋白表面的識(shí)別位點(diǎn)的主要指標(biāo)包括：

(1)目標(biāo)配基位于目標(biāo)蛋白表面；

(2)目標(biāo)配基與目標(biāo)蛋白相互作用力大；

(3)目標(biāo)配基識(shí)別位點(diǎn)間距小；

(4)目標(biāo)配基識(shí)別位點(diǎn)之間不存在明顯蛋白突出結(jié)構(gòu)。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，在步驟(3)中，所述目標(biāo)層析介質(zhì)的結(jié)構(gòu)特性為孔道結(jié)構(gòu)參數(shù)。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，根據(jù)所述孔道結(jié)構(gòu)參數(shù)確定目標(biāo)層析介質(zhì)的比表面積，并根據(jù)所述最優(yōu)配基間距預(yù)測(cè)最優(yōu)配基密度。

7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，所述目標(biāo)蛋白為牛血紅蛋白或木瓜蛋白酶。

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，所述目標(biāo)層析介質(zhì)為具有多孔結(jié)構(gòu)和表面羥基的親水性介質(zhì)。

9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，所述目標(biāo)層析介質(zhì)為瓊脂糖凝膠或纖維素微球。

10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的疏水性電荷誘導(dǎo)層析最優(yōu)配基密度預(yù)測(cè)方法，其特征在于，所述目標(biāo)配基為色胺和/或5-氨基苯并咪唑。