[發明專利]一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測引物、探針、試劑盒及檢測方法在審
| 申請號: | 202110397591.0 | 申請日: | 2021-04-14 |
| 公開(公告)號: | CN113046485A | 公開(公告)日: | 2021-06-29 |
| 發明(設計)人: | 龔甜;李健雄;肖芳 | 申請(專利權)人: | 江西省疾病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 南昌華成聯合知識產權代理事務所(普通合伙) 36126 | 代理人: | 黃晶 |
| 地址: | 330029 *** | 國省代碼: | 江西;36 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 病毒 實時 熒光 pcr 檢測 引物 探針 試劑盒 方法 | ||
1.一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測引物和檢測探針,其特征在于,可同時實現人腺病毒B3型、B7型、B55型和E4型四個型別的檢測,所述檢測引物和檢測探針的核苷酸序列如下:
F1:5'-cttacaattcactcgctc-3';
R1:5'-ggcttttcttctccttca-3';
F2:5'-ggcacagcttacaattca-3';
R2:5'-tctcccgttgtaactatc-3';
F3:5'-tacggcttacaactctct-3';
R3:5'-ctcctcaccattttttacac-3';
F4:5'-gggaaaactcattgcaaac-3';
R4:5'-ggaaatggtgttgttgga-3';
P1:5'-cagtaactaccaccacaaacaca-3';
P2:5'-tgattgtgtgcgtctgaggt-3';
P3:5'-cgcgcctaacacatctca-3';
P4:5'-aaaactgagaggggcaatgg-3';
其中,F1~F4、R1~R4為檢測引物,F1和R1、F2和R2、F3和R3、F4和R4構成四對引物對,P1~P4為檢測探針。
2.根據權利要求1所述的一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測引物和檢測探針,其特征在于,所述檢測探針中序列5' 端標記的熒光基團為FAM、HEX、VIC、CY5、JOE或ROX。
3.根據權利要求2所述的一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測引物和檢測探針,其特征在于,所述檢測探針中序列3' 端標記的淬滅基團為TAMRA、MGB或BHQ,其中BHQ包括BHQ1、BHQ2和BHQ3三種淬滅基團。
4.根據權利要求3所述的一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測引物和檢測探針,其特征在于,所述檢測探針P1、P2、P3和P4的5' 端標記的熒光基團各不相同。
5.一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測試劑盒,其特征在于,所述檢測試劑盒中包括權利要求1~4任一權利要求所述的檢測引物和檢測探針。
6.一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測方法,其特征在于,包括如下步驟:
S1:從樣品中提取病毒DNA;
S2:以提取的病毒DNA為模板,用權利要求1~4任一權利要求所述的檢測引物和檢測探針進行熒光PCR擴增;熒光PCR擴增反應條件為:95℃條件下擴增反應30sec、95℃條件下擴增反應5sec與60℃條件下擴增反應30sec;其中,95℃條件下擴增反應5sec與60℃條件下擴增反應30sec進行40個循環;
S3:根據擴增曲線來判斷樣品中的病毒類型。
7.根據權利要求6所述的一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測方法,其特征在于,所述樣品來自于病人的結膜拭子,包括但不限于鼻咽拭子和眼結膜拭子。
8.根據權利要求6所述的一種人腺病毒四重實時熒光PCR檢測方法,其特征在于,步驟S2中的熒光PCR擴增反應體系為:
Premix Ex Taq反應:12.5μL;
25μM 檢測引物F1:0.5μL;
25μM 檢測引物R1:0.5μL;
25μM 檢測引物F2: 0.5μL;
25μM 檢測引物R2:0.5μL;
25μM 檢測引物F3:0.5μL;
25μM 檢測引物R3:0.5μL;
25μM 檢測引物F4:0.5μL;
25μM 檢測引物R4:0.5μL;
25μM 檢測探針P1:0.5μL;
25μM 檢測探針P2:0.5μL;
25μM 檢測探針P3:0.5μL;
25μM 檢測探針P4:0.5μL;
ddH2O:1.5μL;
DNA模板:5μL;
總體積:25μL。
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