[發(fā)明專利]與花生抗黃曲霉菌侵染主效QTL位點qPSIIB10連鎖的SNP分子標(biāo)記及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202110381706.7
• 申請日: 2021-04-09
• 公開（公告）號: CN112980993B
• 公開（公告）日: 2022-04-08
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 廖伯壽;羅懷勇;雷永;黃莉;劉念;晏立英;康彥平;姜慧芳;蔣藝飛
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002
• 代理人: 孫怡

本發(fā)明涉及分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與花生抗黃曲霉菌侵染主效QTL位點qPSIIB10連鎖的SNP分子標(biāo)記及其應(yīng)用。本發(fā)明的與花生抗黃曲霉菌侵染主效QTL位點連鎖的SNP分子標(biāo)記包括：qPSIIB10?L或qPSIIB10?R。其中，SNP分子標(biāo)記qPSIIB10?L含有如SEQ ID NO.1所示序列第235位的多態(tài)性為C/T和第338位的多態(tài)性為G/A的核苷酸序列；SNP分子標(biāo)記qPSIIB10?R含有如SEQ ID NO.2所示序列的第297位的多態(tài)性為G/A的核苷酸序列。本發(fā)明可以輔助選擇花生種仁抗黃曲霉菌侵染的材料，有利于促進(jìn)花生抗黃曲霉新品種的選育和應(yīng)用。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及分子標(biāo)記技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與花生抗黃曲霉菌侵染主效QTL 位點qPSIIB10連鎖的SNP分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

花生(Arachis hypogea L.)是重要的油料作物之一。花生種子含有豐富的食用油脂、蛋白質(zhì)、氨基酸和維生素，可以加工為食用油、堅果、花生醬等食品。然而，在花生生產(chǎn)和收獲后，花生都有可能受到黃曲霉菌(Aspergillus flavus)的侵染，產(chǎn)生黃曲霉毒素，嚴(yán)重破壞花生的品質(zhì)。因此，如何減少黃曲霉菌對花生種子的侵染、控制黃曲霉毒素的危害，是花生產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重大需求。

選育和利用抗病品種是防治作物病害最為經(jīng)濟(jì)有效的措施之一。研究發(fā)現(xiàn)，部分花生種質(zhì)莢殼和種仁對黃曲霉菌侵染存在抗性，部分種質(zhì)的種仁對黃曲霉菌產(chǎn)毒具有抗性。整合這三類抗性是花生遺傳改良研究的重要方向之一。

花生對黃曲霉菌的抗性表型為多基因控制的數(shù)量抗性。數(shù)量性狀易受環(huán)境條件的影響，因此對表型直接進(jìn)行選擇的效果不好。通過構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜，對分子標(biāo)記基因型和表型進(jìn)行QTL分析，可以將復(fù)雜的數(shù)量性狀分解成多個QTL，利用與QTL連鎖的分子標(biāo)記可以進(jìn)行分子標(biāo)記輔助選擇，提高育種效率。

目前對花生種仁抗黃曲霉菌侵染的QTL定位研究還較少，檢測到的主效 QTL數(shù)目更少，難以在花生育種中應(yīng)用。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明針對現(xiàn)有技術(shù)的不足，目的在于提供一個抗黃曲霉菌侵染主效QTL 位點qPSIIB10的SNP標(biāo)記、SNP標(biāo)記引物對、SNP標(biāo)記檢測方法及其應(yīng)用。

具體地，本發(fā)明提供如下技術(shù)方案：

第一方面，本發(fā)明提供與花生抗黃曲霉菌侵染主效QTL位點qPSIIB10連鎖的 SNP分子標(biāo)記，其包括qPSIIB10-L或qPSIIB10-R；

其中，SNP分子標(biāo)記qPSIIB10-L含有如SEQ ID NO.1所示序列第235位的多態(tài)性為C/T和第338位的多態(tài)性為G/A的核苷酸序列；SNP分子標(biāo)記qPSIIB10-R含有如SEQ ID NO.2所示序列的第297位的多態(tài)性為G/A的核苷酸序列。

所述SNP分子標(biāo)記qPSIIB10-L對應(yīng)的兩個SNP位點及其側(cè)翼序列如SEQ ID NO.1所示；所述SNP分子標(biāo)記qPSIIB10-R對應(yīng)的一個SNP位點及其側(cè)翼序列如 SEQ ID NO.2所示。

所述SNP分子標(biāo)記qPSIIB10-L中，具有第235位多態(tài)性位點的基因型為T 且第338位多態(tài)性位點的基因型為A，對應(yīng)于含有抗黃曲霉菌侵染主效QTL位點qPSIIB10，具有第235位多態(tài)性位點的基因型為C且第338位多態(tài)性位點的基因型為G，對應(yīng)于不含有qPSIIB10；所述SNP分子標(biāo)記qPSIIB10-R中，具有第297位多態(tài)性位點的基因型為A，對應(yīng)于含有qPSIIB10，基因型為G，對應(yīng)于不含qPSIIB10。

第二方面，本發(fā)明提供與花生抗黃曲霉菌侵染主效QTL位點qPSIIB10連鎖的SNP分子標(biāo)記組合，其包括qPSIIB10-L和qPSIIB10-R；其中，SNP分子標(biāo)記qPSIIB10-L和qPSIIB10-R如上所述。

第三方面，本發(fā)明提供用于擴(kuò)增上述SNP分子標(biāo)記或SNP分子標(biāo)記組合的引物。