[發(fā)明專利]基于關鍵指標提高準確性的單細胞測序方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110378925.X | 申請日： | 2021-04-08 |
| 公開（公告）號： | CN113151425B | 公開（公告）日： | 2023-01-06 |
| 發(fā)明（設計）人： | 王晶;張永卓;傅博強;高運華 | 申請（專利權）人： | 中國計量科學研究院 |
| 主分類號： | C12Q1/6869 | 分類號： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京商專永信知識產權代理事務所(普通合伙) 11400 | 代理人： | 歐陽石文 |
| 地址： | 100029 *** | 國省代碼： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 基于 關鍵 指標 提高 準確性 單細胞 方法 | ||
【權利要求書】：
1.一種基于關鍵指標提高準確性的單細胞測序方法，其中測序平臺是10XGenomics，或BD Rhapsody平臺，其特征在于，單細胞測序的樣本滿足下述標準：細胞活性80％，細胞濃度700-1200cells/uL，細胞直徑5-40um；
單細胞測序上機樣本滿足下述要求：cDNA產量大于150ng；片段長度范圍200bp～9000bp；主峰值在1000-2000之間；cDNA濃度1～60ng/ul；
測序文庫達到下述要求：片段大小位于400-500bp；文庫峰位于250bp-1500bp之間；Qubit濃度＝4ng/ul；
所述單細胞測序是指采用Illumina Hiseq PE150或NovaSeq PE150測序策略，每個細胞測50,000-100,000條reads，或每個細胞測15-30M數(shù)據(jù)量；
所述單細胞是細胞系A549或NIH3T3。
2.如權利要求1所述的基于關鍵指標提高準確性的單細胞測序方法，其特征在于，其是采用AOPI熒光染色法檢測樣本的細胞數(shù)量和活細胞數(shù)量。
3.如權利要求1所述的基于關鍵指標提高準確性的單細胞測序方法，其特征在于，采用Smart-seq2法擴增制備單個細胞樣本，用于單細胞測序。
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