[發明專利]一種藥物與靶點間的相關性確定方法、裝置及電子設備

在審

• 申請號: 202110367301.8
• 申請日: 2021-04-06
• 公開（公告）號: CN112908429A
• 公開（公告）日: 2021-06-04
• 發明（設計）人: 李雙利;周景博;黃亮;熊昊一;王凡;徐童;熊輝;竇德景
• 申請（專利權）人: 北京百度網訊科技有限公司
• 主分類號: G16C20/50
• 分類號: G16C20/50
• 代理公司: 北京銀龍知識產權代理有限公司 11243
• 代理人: 許靜;黃燦

本申請公開了一種藥物與靶點間的相關性確定方法、裝置及電子設備，涉及計算機技術中的大數據、深度學習等技術領域。具體實現方案為：建立候選藥物與靶點的空間分子圖，空間分子圖包括原子節點集以及邊集合，原子節點集包括候選藥物中的原子以及靶點中的原子，邊集合包括至少一條原子連邊；將原子節點集的第一原子特征以及空間分子圖輸入第一圖注意力模型進行預測，得到原子節點集的第二原子特征；基于原子節點集的第二原子特征，確定候選藥物與靶點之間的相關性參數值。無需通過高斯量篩選實驗進行預測，可減少計算量，提高藥物與靶點間的相關性確定的效率。

技術領域

本申請涉及計算機技術中的大數據、深度學習等技術領域，尤其涉及一種藥物與靶點間的相關性確定方法、裝置及電子設備。

背景技術

對于新藥研發而言，預測新藥與靶點進行結合的親和性(可以理解為相關性)是其中一個重要的階段。在藥物研發階段，可通過對多個候選新藥與靶點間的親和性反應進行測定排序，從而篩選出真正有價值的新藥。

目前，在進行預測過程中，常用的方法是通過高斯量篩選實驗進行預測。

發明內容

本申請提供一種藥物與靶點間的相關性確定方法、裝置及電子設備。

第一方面，本申請一個實施例提供一種藥物與靶點間的相關性確定方法，所述方法包括：

建立候選藥物與靶點的空間分子圖，所述空間分子圖包括原子節點集以及邊集合，所述原子節點集包括所述候選藥物中的原子以及所述靶點中的原子，所述邊集合包括至少一條原子連邊；

將所述原子節點集的第一原子特征以及所述空間分子圖輸入第一圖注意力模型進行預測，得到所述原子節點集的第二原子特征；

基于所述原子節點集的第二原子特征，確定所述候選藥物與所述靶點之間的相關性參數值。

在本申請實施例的藥物與靶點間的相關性確定方法中，首先建立候選藥物與靶點的空間分子圖，然后將原子節點集的第一原子特征以及空間分子圖輸入第一圖注意力模型進行預測，即利用的是第一圖注意力模型進行預測得到原子節點集的第二原子特征，再基于原子節點集的第二原子特征，確定候選藥物與靶點之間的相關性參數值即可，無需通過高斯量篩選實驗進行預測，可減少計算量，提高藥物與靶點間的相關性確定的效率。

第二方面，本申請一個實施例提供一種藥物與靶點間的相關性確定裝置，所述裝置包括：

建立模塊，用于建立候選藥物與靶點的空間分子圖，所述空間分子圖包括原子節點集以及邊集合，所述原子節點集包括所述候選藥物中的原子以及所述靶點中的原子，所述邊集合包括至少一條原子連邊；

預測模塊，用于將所述原子節點集的第一原子特征以及所述空間分子圖輸入第一圖注意力模型進行預測，得到所述原子節點集的第二原子特征；

第一確定模塊，用于基于所述原子節點集的第二原子特征，確定所述候選藥物與所述靶點之間的相關性參數值。

第三方面，本申請一個實施例還提供一種電子設備，包括：

至少一個處理器；以及

與所述至少一個處理器通信連接的存儲器；其中，

所述存儲器存儲有可被所述至少一個處理器執行的指令，所述指令被所述至少一個處理器執行，以使所述至少一個處理器能夠執行本申請各實施例提供的藥物與靶點間的相關性確定方法。

第四方面，本申請一個實施例還提供一種存儲有計算機指令的非瞬時計算機可讀存儲介質，所述計算機指令用于使所述計算機執行本申請各實施例提供的藥物與靶點間的相關性確定方法。

第五方面，本申請一個實施例提供一種計算機程序產品，包括計算機程序，所述計算機程序在被處理器執行時實現本申請各實施例提供的藥物與靶點間的相關性確定方法。