[發明專利]利用三種單倍型檢測水稻產量性狀的方法

有效

• 申請號: 202110360014.4
• 申請日: 2021-04-02
• 公開（公告）號: CN113073143B
• 公開（公告）日: 2022-08-23
• 發明（設計）人: 周文彬;魏少博;李霞
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院作物科學研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;A01H1/04
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 魏少偉

本發明公開了利用三種單倍型檢測水稻產量性狀的方法。本發明公開的檢測水稻產量性狀的方法通過檢測水稻的三種單倍型Hap.1、Hap.2和Hap.3進行，Hap.1、Hap.2和Hap.3的10個SNP分別為水稻參考基因組版本號Os?Nipponbare?Reference?IRGSP?1.0(IRGSP?1.0)的物理位置1433007，1433155，1433229，1433365，1433528，1433919，1434216，1434258，1434486，1434806的核苷酸，本發明發現單倍型Hap.3具有提高產量的優良性狀，在水稻遺傳育種及品種改良方面具有廣闊的應用前景。

技術領域

本發明涉及生物技術領域中，利用三種單倍型檢測水稻產量性狀的方法。

背景技術

預計到2050年，全世界人口將達到100億，糧食需求將增長50-65％。而隨著遺傳改良以及栽培措施優化的傳統方法已達到生物極限，從上世紀末開始的綠色革命帶來的產量收益面臨著停滯不前的困境，如何提高作物產量仍是世界范圍內亟需解決的難題。水稻是世界上三大糧食作物之一，全球有超過一半的人口以水稻作為主食，因此水稻產量的提升對保障世界糧食安全具有重要的作用。

在農業生產中，農作物的生育期對作物產量起著決定性的作用，其中水稻抽穗期是決定水稻產量和品質的最重要農藝性狀之一。合適的抽穗期對水稻品種適應不同生態區域以及不同種植季節具有關鍵作用，是作物穩產高產的保障。長期以來，選育早熟且高產的水稻品種一直是作物遺傳育種研究的主攻方向之一。抽穗期的主要影響因素包括品種差異、光周期和耕作方式等，不同水稻品種抽穗期的差異直接影響品種的耕種區域與季節適應性以及產量性狀。因此，從不同水稻種質資源中挖掘鑒定與抽穗期及產量相關的候選基因及分子標記對于水稻品種的遺傳改良是非常必要的。水稻的抽穗期和產量均是典型的復雜數量性狀，受多基因控制。一個特定候選基因中通常存在多個SNP位點，且表型性狀不是由單個SNP引起的，而是由多個SNP的特定組合所致，這一類具有統計學關聯性的SNPs的特定組合即是單倍型。對大量水稻種質資源材料中的SNP信息進行單倍型分析，可以為水稻抽穗期和產量的候選基因研究提供更加豐富的信息，同時也可為在自然選擇和人工馴化過程中的定向選擇提供更加可靠的參考。

發明內容

本發明所要解決的技術問題是如何檢測水稻的產量性狀。

為解決上述技術問題，本發明首先提供了一種檢測水稻產量性狀的方法，所述方法包括：檢測待測水稻單倍型，所述水稻單倍型為Hap.1、Hap.2和Hap.3，所述Hap.1在水稻參考基因組版本號Os-Nipponbare-Reference-IRGSP-1.0(IRGSP-1.0)(更新日期2013.2.6，網址https://rapdb.dna.affrc.go.jp/)的物理位置1433007，1433155，1433229，1433365，1433528，1433919，1434216，1434258，1434486，1434806的核苷酸依次為A、A、G、C、A、G、G、C、T和G；

所述Hap.2在水稻參考基因組版本號Os-Nipponbare-Reference-IRGSP-1.0(IRGSP-1.0)(更新日期2013.2.6，網址https://rapdb.dna.affrc.go.jp/)的物理位置1433007，1433155，1433229，1433365，1433528，1433919，1434216，1434258，1434486，1434806的核苷酸依次為A、G、G、C、T、G、G、C、T和G；

所述Hap.3在水稻參考基因組版本號Os-Nipponbare-Reference-IRGSP-1.0(IRGSP-1.0)(更新日期2013.2.6，網址https://rapdb.dna.affrc.go.jp/)的物理位置1433007，1433155，1433229，1433365，1433528，1433919，1434216，1434258，1434486，1434806的核苷酸依次為G、G、A、G、T、A、A、T、G和T；