[發明專利]一種用于中藥核心藥物識別的社區發現方法有效
| 申請號: | 202110354293.3 | 申請日: | 2021-04-01 |
| 公開(公告)號: | CN113053540B | 公開(公告)日: | 2023-03-03 |
| 發明(設計)人: | 張云;劉勇國;李巧勤;楊尚明;朱嘉靜 | 申請(專利權)人: | 電子科技大學 |
| 主分類號: | G16H70/40 | 分類號: | G16H70/40 |
| 代理公司: | 成都虹盛匯泉專利代理有限公司 51268 | 代理人: | 王偉 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 中藥 核心 藥物 識別 社區 發現 方法 | ||
本發明公開一種用于中藥核心藥物識別的社區發現方法,應用于中藥方劑核心藥物研究領域,針對現有技術識別中藥核心藥物準確率不高的問題;本發明通過設計藥物節點傳播能力、吸引能力、發射能力和接收能力,細粒度地衡量藥物節點重要性;并首次提出標簽融合思想,融合不同ID但相似的功效標簽,減少冗余標簽和迭代時間,快速地獲得高質量的藥物社區結果,以識別準確的核心藥物。
技術領域
本發明屬于中藥方劑核心藥物研究領域,特別涉及一種中藥方劑核心藥物識別技術。
背景技術
中藥方劑講究“君臣佐使”配伍原則,即中藥方劑一般由君藥、臣藥、佐藥、使藥四個部分組成:1)君藥是對主證或主病起主要治療作用的藥物,它體現了方劑的主攻方向,其藥力居方中之首,是組方中不可缺少的藥物;2)臣藥是輔助君藥加強治療主證或主病的藥物;3)佐藥一為佐助藥,用于治療次要兼證,二為佐制藥,用以消除或減緩君藥、臣藥的毒性;4)使藥:一是引經藥,引方中諸藥直達病所的藥物,二是調和藥,即調和諸藥的作用,使其共同發揮治病的效果。綜上,一個方劑的君藥和臣藥是核心藥物,即在方劑中經常一起搭配的治療某種疾病的重要藥物組合。但是目前大量的方劑并沒有記錄方劑的君臣佐使信息,因此,設計有效的核心藥物發現方法,有利于中醫“君臣佐使”的配伍理論的研究。
目前關于中藥方劑核心藥物發現的研究主要有以下三個方向:
1)基于關聯規則的方法:通過關聯規則挖掘藥物在方劑中共同出現的規律,將共現概率高的藥物組合識別為方劑的核心藥物。
2)基于社區發現的方法:通過建立藥物網絡,采用社區發現的手段,研究網絡的內在結構,發現藥物社區,針對每個藥物社區,識別藥物節點重要性,將重要性高的藥物識別為核心藥物。
3)實驗方法:通過分析方劑藥物的主要化學成分,選擇具有主要化學成分的藥物為該方劑的核心藥物。
上述方法為中藥核心藥物的研究奠定了基礎,但存在如下缺點:
1)基于關聯規則的方法依賴于藥物出現的頻次,較難發現出現次數少但療效好的核心藥物;
2)基于社區發現的方法受限于構建藥物網絡的方劑數據較少,不能在較小的藥物網絡中發現針對特定疾病的全部核心藥物。目前流行的社區發現算法主要是基于標簽傳播的算法,其主要問題是,第一,考慮節點重要性因素單一,不能準確地體現節點的重要程度;第二,只關注節點,沒有關注標簽,特別是標簽的相似性沒有關注;
3)實驗方法成本高,操作過程復雜。
發明內容
為解決上述技術問題,本發明提供一種用于中藥核心藥物識別的社區發現方法,通過考慮節點本身和鄰居節點,設計了節點傳播能力、吸引能力、發射能力和接收能力的多能力模型,更細粒度地衡量節點的重要性;同時算法考慮標簽的相似性,對相似度高的標簽進行融合,減少冗余標簽,減少算法迭代次數,提高發現藥物社區和重要藥物節點的準確度和穩定性,提高核心藥物識別的準確度。
本發明采用的技術方案為:一種用于中藥核心藥物識別的社區發現方法,包括:
首先,將藥物作為節點,兩個藥物共同出現在同一方劑中作為邊,將藥物功效作為標簽;
然后,計算節點之間的最短距離;計算節點相似性;計算標簽的相似性;計算每個節點的傳播能力、吸引能力、發射能力、接收能力;并將藥物節點按傳播能力的大小從小到大進行排序;
其次,進行標簽發射、標簽融合與標簽接收的處理;
最后,根據標簽分布,將具有相同標簽的節點劃分為同一藥物社區,識別為可以對同類證候有效的藥物;在每個藥物社區中,將傳播能力Top-3的節點識別為該類證候的核心藥物。
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