[發明專利]用于檢測玉米籽粒鎘含量的SNP標記物、檢測方法和試劑盒

在審

• 申請號: 202110351064.6
• 申請日: 2021-03-31
• 公開（公告）號: CN113528692A
• 公開（公告）日: 2021-10-22
• 發明（設計）人: 張湘博;高帥;李旭輝;齊永文
• 申請（專利權）人: 廣東省科學院生物工程研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 廣州廣典知識產權代理事務所(普通合伙) 44365
• 代理人: 萬志香;庹玖玲

本發明公開了一種檢測玉米籽粒鎘含量的SNP標記物及其應用。發明人發現在玉米2號染色體，163347343bp位置的基因型，約82.76％的SNP基因型CC的玉米品種籽粒鎘含量均低于0.01ug/g，約85.19％的SNP基因型GG的玉米品種籽粒鎘含量均高于0.01ug/g，該位置的基因型可以作為玉米籽粒鎘含量的SNP標記物。利用此發現，將該SNP標記物應用于玉米籽粒鎘含量的檢測，有利于培育低鎘玉米。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，具體涉及用于檢測玉米籽粒鎘含量的SNP標記物、檢測方法和試劑盒。

背景技術

玉米是重要的糧食作物、飼料作物、輕工業原料作物，是世界人口所需要的重要糧食與工業原料之一，也是世界上分布最廣泛的糧食作物之一，其種植面積僅次于小麥和水稻二位居第三位，在我國更是已發展成為種植面積最大的糧食作物，同時也成為了研究進化生物學、分子生物學和遺傳學的模式植物。因此，重視和保障玉米作物生產的質量和產量，對糧食安全和經濟發展具有舉足輕重的意義。

玉米有多種用途，其籽粒可供人、家禽食用，葉片、莖稈可加工成飼料供奶牛等食用。玉米籽粒富含淀粉、油分等營養物質，可加工成玉米淀粉和玉米油，供人類食用。由此可見，玉米經直接、間接(食物鏈效應)被人類食用。因此，保障玉米健康種植變得尤為重要。

重金屬及其化合物造成的環境污染對中國農業經濟的發展已經造成了巨大損失。該類污染主要由采礦等相關工業加工企業產生的廢氣、廢水排放進入地下水與河流，繼而通過農田灌溉等所致，并由此對糧食等造成污染，進而對人類健康的危害也日趨加劇。鎘是毒性最強和農田受污染最普遍的重金屬之一，進入土壤的鎘極易被植物吸收累積。據報道，人體內約70％的鎘來自于農作物。人體如果攝入過量鎘，會嚴重威脅到健康。人類食用富含鎘的玉米粒或者食用富含鎘的青貯玉米喂養的牛(食物鏈效應)，造成人體內鎘積累。因此，挖掘玉米鎘調控關鍵基因，解析其作用機制，培育低鎘玉米變得尤為重要。

植物對鎘的耐性是一個復雜的性狀，受到一系列基因的調控。部分鎘積累調控基因在擬南芥、水稻中已經被克隆，但是植物中對鎘耐受的分子機制仍不清晰，而且玉米中控制籽粒鎘積累性狀的關鍵基因還未被克隆。由于玉米鎘積累性狀不能被育種家在實際的品種選育過程中直接觀察，因此低鎘玉米品種的選育需要鑒別、利用優異的基因資源及相對應的分子輔助手段。目前能有效鑒別玉米鎘積累性狀的分子輔助手段仍處于起步階段。

發明內容

本發明的目的之一在于提供一種檢測玉米籽粒鎘含量的SNP標記物。

一種檢測玉米籽粒鎘含量的SNP標記物，其為玉米2號染色體，163347343bp的位置。

在其中一些實施例中，163347343bp的位置基因型為CC。

在其中一些實施例中，163347343bp的位置基因型為GG。

本發明的另一目的是提供一種玉米籽粒鎘含量的檢測方法。

一種玉米籽粒鎘含量的檢測方法，其包括對玉米2號染色體，163347343bp位置的基因型進行檢測。

在其中一些實施例中，163347343bp的位置基因型為CC時鎘含量偏低。

在其中一些實施例中，163347343bp的位置基因型為GG時鎘含量偏低。

在其中一些實施例中，所述檢測方法是直接測序、特異性探針雜交法、特異性引物延伸法或PCR法等方法中任一種。

本發明的另一個目的是提供一種檢測玉米籽粒鎘含量的試劑盒。

實現該目的技術方案如下。

一種檢測玉米籽粒鎘含量的試劑盒，包括檢測對玉米2號染色體，163347343bp位置的基因型的試劑。