[發明專利]玉米籽粒鎘含量相關的SNP標記物及其應用

在審

• 申請號: 202110351060.8
• 申請日: 2021-03-31
• 公開（公告）號: CN113528691A
• 公開（公告）日: 2021-10-22
• 發明（設計）人: 張湘博;高帥;李旭輝;齊永文
• 申請（專利權）人: 廣東省科學院生物工程研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 廣州廣典知識產權代理事務所(普通合伙) 44365
• 代理人: 萬志香;庹玖玲

本發明公開了一種檢測玉米籽粒鎘含量的SNP標記物及其應用。發明人發現在玉米5號染色體，133762822bp位置的基因型，約63.75％的基因型AA的玉米品種籽粒鎘含量均低于0.01ug/g，約80％的SNP基因型GG的玉米品種籽粒鎘含量均高于0.01ug/g，該位置的基因型可以作為玉米籽粒鎘含量的SNP標記物。利用此發現，將該SNP標記物應用于玉米籽粒鎘含量的檢測，有利于培育低鎘玉米。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，具體涉及玉米籽粒鎘含量相關的SNP標記物及其應用。

背景技術

玉米是重要的糧食作物、飼料作物和能源作物，2007年我國玉米種植面積達到4.42億畝，超過水稻的4.3億畝，成為我國種植面積最大的糧食作物。因此，玉米在保障我國糧食安全中有著十分重要的戰略意義。玉米有多種用途，其籽粒可供人、家禽食用，葉片、莖稈可加工成飼料供奶牛等食用。玉米籽粒富含淀粉、油分等營養物質，可加工成玉米淀粉和玉米油，供人類食用。由此可見，玉米經直接、間接(食物鏈效應)被人類食用。因此，保障玉米健康種植變得尤為重要。

隨著我國工業的高速發展，工廠廢液嚴重污染我國農田，造成農田污染嚴重。據報道，我國土壤重金屬污染嚴重，尤其是鎘污染。鎘脅迫影響玉米正常生長，造成玉米生長緩慢、葉片變黃、產量下降等，對人類健康帶來巨大威脅。人類食用富含鎘的玉米粒或者食用富含鎘的青貯玉米喂養的牛(食物鏈效應)，造成人體內鎘積累。據報道，人體內約70％的鎘來自于農作物。人體如果攝入過量鎘，會嚴重威脅到健康。例如鎘攝入嚴重者患有前列腺癌、肺癌、腎小管損壞、肺氣腫和骨折等疾病。因此，挖掘玉米鎘調控關鍵基因，解析其作用機制，培育低鎘玉米變得尤為重要。

發明內容

本發明的目的之一在于提供一種玉米籽粒鎘含量相關的SNP標記物，其可用于玉米籽粒鎘含量檢測。

一種玉米籽粒鎘含量相關的SNP標記物，其為玉米5號染色體，133762822bp的位置。

在其中一些實施例中，133762822bp的位置基因型為AA。

在其中一些實施例中，133762822bp的位置基因型為GG。

本發明的另一目的是提供一種玉米籽粒鎘含量的檢測方法。

一種玉米籽粒鎘含量的檢測方法，其包括對玉米5號染色體，133762822bp位置的基因型進行檢測。

在其中一些實施例中，133762822bp的位置基因型為AA時鎘含量偏低。

在其中一些實施例中，133762822bp的位置基因型為GG時鎘含量偏低。

在其中一些實施例中，所述檢測方法是直接測序、特異性探針雜交法、特異性引物延伸法或PCR法等方法中任一種。

本發明的另一個目的是提供一種檢測玉米籽粒鎘含量的試劑盒。

實現該目的技術方案如下。

一種檢測玉米籽粒鎘含量的試劑盒，包括檢測對玉米5號染色體，133762822bp位置的基因型的試劑。

本發明的發明人發現，在玉米5號染色體，133762822bp位置的基因型，其與玉米品種籽粒鎘含量高度相關，經過研究發現，其中約63.75％的SNP基因型AA的玉米品種籽粒鎘含量均低于0.01ug/g，約80.00％的SNP基因型GG的玉米品種籽粒鎘含量均高于0.01ug/g，該位置的基因型可以作為玉米籽粒鎘含量的SNP標記物。利用此發現，將該SNP標記物應用于玉米籽粒鎘含量的檢測，有利于培育低鎘玉米。

具體實施方式

本發明下列實施例未注明具體條件的實驗方法，通常按照常規條件，或按照制造廠商所建議的條件。實施例中所用到的各種常用化學試劑，均為市售產品。