[發明專利]小麥抗赤霉病dsMQTL分析方法在審
| 申請號： | 202110350135.0 | 申請日： | 2021-03-31 |
| 公開（公告）號： | CN113113086A | 公開（公告）日： | 2021-07-13 |
| 發明（設計）人： | 李韜;花辰;溫卓;孫政璽;李磊 | 申請（專利權）人： | 揚州大學 |
| 主分類號： | G16B40/00 | 分類號： | G16B40/00 |
| 代理公司： | 南京縱橫知識產權代理有限公司 32224 | 代理人： | 王玉 |
| 地址： | 225009 *** | 國省代碼： | 江蘇;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 小麥 赤霉病 dsmqtl 分析 方法 | ||
1.小麥抗赤霉病dsMQTL分析方法，其特征在于，包括：
小麥赤霉病QTL數據收集，
以QTL區間大小平均值+標準差為篩選標準，去除區間過大的QTL，對QTL進行初步篩選；
將篩選后的數據導入dsMQTL軟件中，獲得dsMQTL。
2.根據權利要求1所述的小麥抗赤霉病dsMQTL分析方法，其特征在于，收集的小麥赤霉病QTL數據包括染色體、品種名稱、接種方法、接種環境、實驗次數、實驗地點數量、實驗群體大小、置信區間、物理位置、峰值標記及位置、LOD值和表型解釋率。
3.根據權利要求1所述的小麥抗赤霉病dsMQTL分析方法，其特征在于，初步篩選的方法為：計算所有QTL物理區間長度平均值+標準差，以此為標準，將QTL區間平均值+標準差的QTL剔除。
4.根據權利要求1所述的小麥抗赤霉病dsMQTL分析方法，其特征在于，以測序圖譜為QTL映射載體獲得結果dsMQTL。
5.根據權利要求1所述的小麥抗赤霉病dsMQTL分析方法，其特征在于，所述dsMQTL軟件基于python環境。
6.根據權利要求1所述的小麥抗赤霉病dsMQTL分析方法，其特征在于，所述dsMQTL軟件中使用最小二乘法進行區間擬合，軟件中包含1-dsMQTL，2-dsMQTL，3-dsMQTL，4-dsMQTL這4個模型，分別假設染色體上有1、2、3、4個dsMQTL的情況。
7.根據權利要求6所述的小麥抗赤霉病dsMQTL分析方法，其特征在于，在對4個模型分別進行擬合檢驗后，選擇最符合QTL可靠性積累曲線的模型，在滿足以下兩個標準的前提下生成后續的dsMQTL：(1)QTL置信度的累積曲線聚類成峰，模型可以擬合；(2)一個dsMQTL至少有3個部分重疊的原始QTL。
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