[發明專利]小分子激酶抑制劑篩選分子庫構建方法及系統

有效

• 申請號: 202110315008.7
• 申請日: 2021-03-24
• 公開（公告）號: CN112992289B
• 公開（公告）日: 2023-06-23
• 發明（設計）人: 馬松齡;馬文志;賴力鵬;溫書豪;馬健
• 申請（專利權）人: 北京晶泰科技有限公司
• 主分類號: G16C20/50
• 分類號: G16C20/50
• 代理公司: 深圳市科吉華烽知識產權事務所(普通合伙) 44248
• 代理人: 胡玉

1.一種小分子激酶抑制劑篩選分子庫構建方法，其特征在于，包括：

側鏈庫的構建：將分子與單環或雙環的骨架進行匹配，匹配后將對應部分作為母核，切開與該母核相連的碳-雜原子非環單鍵，對切割后的片段進行分揀，分為母核與側鏈，根據設定條件篩選側鏈，將符合條件的側鏈加入側鏈庫；

利用側鏈庫建立待篩分子庫：根據參照分子的側鏈設置過濾條件進行過濾，從側鏈庫中取出符合條件的側鏈，將取出的側鏈進行分子生成，將生成的側鏈拼接到參照分子的母核上，建立待篩分子庫。

2.根據權利要求1所述的小分子激酶抑制劑篩選分子庫構建方法，其特征在于，所述側鏈庫的構建步驟中，切開與該母核相連的碳-雜原子非環單鍵時，若切開后形成的少于5個原子則不切割該鍵；對切割后的片段進行分揀時，符合母核條件的片段分為母核，其余為側鏈；所述母核與側鏈的條件包括：氫鍵形成能力、含有環的數量限制、分子量、是否包含特定子結構。

3.根據權利要求2所述的小分子激酶抑制劑篩選分子庫構建方法，其特征在于，所述母核條件包括：其子結構能與分別根據11個氫鍵供體受體設置的匹配結構的任何一個匹配或母核能與Hinge區形成氫鍵、包含0-5個環、少于5個氫供體、分子量小于500、沒有橋環、沒有磷雜環、沒有1,2,3–三唑、沒有四唑、沒有10元環以上的大環；側鏈若符合以下條件，則加入側鏈庫：至少含有1個環、分子量小于700、沒有磷雜環。

4.根據權利要求1所述的小分子激酶抑制劑篩選分子庫構建方法，其特征在于，所述利用側鏈庫建立待篩分子庫步驟中，根據參照分子的側鏈的化學屬性分布范圍設置過濾條件，或根據參照分子側鏈設置匹配結構對分子中的子結構進行匹配設置過濾條件，從側鏈庫中取出符合條件的側鏈，將取出的側鏈通過遷移學習進行分子生成。

5.根據權利要求1所述的小分子激酶抑制劑篩選分子庫構建方法，其特征在于，所述利用側鏈庫建立待篩分子庫包括：搜索與參照分子同靶點的分子，參照參照分子的活性設置高活性閾值，將分子中的活性高于設定的高活性閾值的高活性分子挑出，進行側鏈切割，針對不同的側鏈位點，分別查看不同的側鏈位點的側鏈的化學屬性分布范圍，根據不同的側鏈位點的側鏈的化學屬性分布范圍設置不同過濾條件，或根據高活性分子不同位點的側鏈設定的以與側鏈庫中側鏈的子結構進行匹配的匹配結構設置過濾條件，根據過濾條件過濾，從側鏈庫中取出符合條件的側鏈，將取出的側鏈進行分子生成，將生成的側鏈拼接到參照分子的母核上，建立待篩分子庫。

6.根據權利要求5所述的小分子激酶抑制劑篩選分子庫構建方法，其特征在于，所述利用側鏈庫建立待篩分子庫包括：搜索與參照分子同靶點的分子，參照參照分子的活性設置高活性閾值，將分子中的活性高于設定的高活性閾值的高活性分子挑出，進行側鏈切割，形成R1-Rn位點，針對不同的側鏈位點，分別查看不同的側鏈位點的側鏈的化學屬性分布范圍，根據不同的側鏈位點的側鏈的化學屬性分布范圍設置不同過濾條件，或根據高活性分子不同位點的側鏈設定的以與側鏈庫中側鏈的子結構進行匹配的匹配結構設置過濾條件，根據過濾條件過濾，從側鏈庫中取出分別符合R1-Rn化學屬性分布的側鏈，將取出的側鏈通過遷移學習進行分子生成，將分別根據R1-Rn生成的側鏈分別對應拼接到參照分子的母核對應的R1-Rn位點上，建立待篩分子庫。

7.根據權利要求4至6任意一項所述的小分子激酶抑制劑篩選分子庫構建方法，其特征在于，所述化學屬性包括：氫鍵供體數量，氫鍵受體數量，分子量，LogP值，TPSA值，可旋轉鍵數量，環的個數，芳香環的個數任意一個或多個；所述過濾條件包括：環的數量、芳環數量、可旋轉鍵數量、分子量、氫鍵供體數量、氫鍵受體數量、LogP值、TPSA值、與母環連接的原子類型、側鏈連接到母環上的第一個原子是否一定要在環中中的任意一種或多種。