[發明專利]肉雞腹脂率性狀相關的分子標記APOA5 c.459及其應用

有效

• 申請號: 202110312829.5
• 申請日: 2021-03-24
• 公開（公告）號: CN112831574B
• 公開（公告）日: 2022-07-26
• 發明（設計）人: 羅慶斌;張細權;聶慶華;張德祥;羅文;李恒豐;李紅梅;葉茂;詹惠娜
• 申請（專利權）人: 華南農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方盛凡知識產權代理事務所(普通合伙) 11562
• 代理人: 王穎

本發明公開了肉雞腹脂率相關的分子標記APOA5c.459及其應用，涉及家禽遺傳育種技術領域。本發明提供了一種與肉雞腹脂率相關的SNPAPOA5c.459GA，其序列如SEQ ID NO:1所示。本發明還提供了檢測所述SNP的特異性引物組和具體的檢測方法，能夠高效靈敏快捷的檢測所述SNP序列，以篩選鑒定低腹脂率肉雞品種。本發明的實施能夠有效篩選低腹脂率肉雞，為肉雞的遺傳育種提供了新的技術方案，適合在肉雞養殖產業上大規模推廣應用。

技術領域

本發明涉及家禽遺傳育種技術領域，具體而言，涉及肉雞腹脂率性狀相關的分子標記APOA5 c.459及其應用。

背景技術

雞肉獨特風味的來源主要是肌內脂肪和皮下脂肪。一方面，肉品質指標中嫩度、多汁性源于肌內脂肪對肌肉纖維的溶解；另一方面，雞肌內脂肪、皮下脂肪的脂質降解過程中，含量豐富的磷脂產生的香味，是組成雞肉風味的重要部分，同時，肌肉中的不飽和脂肪酸在加熱時發生氧化反應，氧化產物進一步分解為烯醛等揮發性物質，是雞肉香味的重要組成成分。而我國多種著名的地方品種雞，如北京油雞、清遠麻雞、彭縣黃雞等具有的獨特風味均來源于因一定程度的皮下脂肪和肌內脂肪沉積。但受限于雞體內脂肪沉積規律，想達到一定程度的肌內脂肪的沉積往往難以避免大量的腹脂沉積，從而導致飼料報酬的下降，影響肉雞生產的效益，如何解決肉雞的過度脂肪沉積是肉雞遺傳育種中育種工作者相當重視的一個問題，也是提高黃羽肉雞生產率的一個重要途徑。

分子標記輔助選擇(MAS)是一種常用的分子育種技術。MAS可以直接根據遺傳物質的多態性進行相應的分析，如單核苷酸多態性(SNP)。分子標記輔助選擇技術在其他家畜的育種中已有相當長的歷史，與傳統育種方法相比，MAS具有存在范圍廣、遺傳穩定、直觀準確等優點，目前并未大規模的應用于雞的育種中。其原因一方面是對于雞的經濟性狀的分子標記研究和挖掘較少，可應用于實際育種中選擇重要經濟性狀的分子標記不足；另一方面是分子標記的檢測往往成本較高，在世代間隔短，育種群體大的雞育種中應用分子標記輔助選擇技術的成本較常規育種方法更高。但隨著更多低成本檢測技術的發展以及分子標記的開發，分子標記輔助選擇技術在雞的育種中的應用成本顯著降低，因此，進一步挖掘分子水平上與雞重要經濟性狀相關的候選基因，通過對其多態性的研究并建立相關分子遺傳標記，可以有效推動優質雞的育種工作。

發明內容

本發明的目的在于克服現有技術的缺陷，提供肉雞腹脂率相關的分子標記APOA5c.459及其應用。根據APOA5基因的已知序列，利用直接測序，尋找與黃羽肉雞腹脂率關聯的SNP位點，并通過飛行時間質譜分析對SNP分型結果與群體性狀進行關聯分析，從而獲得與黃羽肉雞腹脂率關聯的分子標記，為雞的標記輔助選擇提供新的分子標記資源。

為實現上述目的，提供了如下方案：

第一方面，提供了一種與肉雞腹脂率相關的分子標記APOA5 c.459GA，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述序列的第95位堿基處是G或A(即堿基G與堿基A發生替換)。

第二方面，提供了檢測分子標記APOA5 c.459GA的引物組，所述引物組的核苷酸序列如SEQ ID NO.2-3所示。

第三方面，提供了所述分子標記或檢測所述分子標記的試劑在篩選低腹脂率肉雞中的應用。

在一些實施方案中，檢測所述分子標記的試劑中包括檢測所述分子標記的特異性引物組。

在一些實施方案中，檢測所述分子標記的特異性引物組為本發明所述的引物組。

第四方面，提供了一種利用分子標記APOA5 c.459GA篩選低腹脂率肉雞的方法，包括以下步驟：

(a)提取待檢測雞的DNA；

(b)目的片段的獲得及測序：利用能夠擴增所述分子標記序列的引物組對通過PCR擴增待檢測雞的DNA，將獲得的產物進行測序，分析序列堿基；