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[發明專利]一種生物信息數據在線過濾系統在審

專利信息
申請號: 202110305047.9 申請日: 2021-03-23
公開(公告)號: CN113079138A 公開(公告)日: 2021-07-06
發明(設計)人: 顏頤欣;賈忠明;杜雪飛 申請(專利權)人: 哈爾濱理工大學
主分類號: H04L29/06 分類號: H04L29/06;G06F21/62
代理公司: 暫無信息 代理人: 暫無信息
地址: 150080 黑龍*** 國省代碼: 黑龍江;23
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 生物 信息 數據 在線 過濾 系統
【權利要求書】:

1.一種生物信息數據在線過濾系統,其特征在于:包括數據接口機器控制器,用于實時接收網絡數據,解包后供過濾模塊使用;主控制器,與所述數據接口控制器連接,內部使用FPGA實現了數據過濾模塊,用于根據配置信息對數據接口輸入的數據進行過濾,對過濾結果生成記錄的日志文件并存儲;所述的主控制器為Xilinx公司生產的ZYNQ-7010芯片;本地服務器,運行在搭載了Linux操作系統的主控制器內部的APU中,用于接收用戶提供給過濾模塊的配置信息,也可對過濾模塊的運行或停止進行操作;虛擬終端,用戶與本地服務器使用虛擬終端進行交互,用于實時查看過濾模塊記錄日志。

2.根據權利要求1所述的一種生物信息數據在線過濾系統,其特征在于:使用了ZYNQ-7010、DDR、以太網適配器、網絡數據接口與Linux操作系統。

3.DDR芯片容量為512MB連接在ZYNQ的PS端(APU),以太網適配器與網絡數據接口連接在ZYNQ的PL端(FPGA),在PS端嵌入Linux操作系統對配置PL端的數據過濾模塊提供配置信息。

4.根據權利要求1所述的一種生物信息數據在線過濾系統,其特征在于:所述的主處理器芯片采用Xilinx公司生產的XC7Z010CLG400-1;所述的DDR芯片選擇了Micron公司生產的型號絲印為4QL77-09PZM的DDR;所述的以太網控制器選用了WIZnet公司生產的W5500芯片;所述的網絡數據接口選用了型號為HR911105A的RJ45接口;所述的ZYNQ芯片中PS與PL通過芯片內部的AXI總線進行數據交換。

5.根據權利要求1所述的一種生物信息數據在線過濾系統,其特征在于:所述的本地服務器包括第一查詢單元、存儲單元、更新單元、第二查詢單元以及刪除單元;所述第一查詢單元用于查詢所述本地服務器中的原始配置文件是否存在變化,并當所述本地服務器中的原始文件存在變化時,跳至所述更新單元,當所述本地服務器中的原始文件未變化時,跳至所述存儲單元;所述更新單元用于停止數據過濾模塊工作后覆蓋本地服務器中的原始配置文件,并再次啟動數據過濾模塊;所述第二查詢單元用于查詢所述本地服務器存儲的數據過濾模塊運行日志;所述刪除單元用于刪除所述本地服務器中對數據過濾功能模塊的配置文件并停止數據過濾模塊的運行。

6.根據權利要求1所述的一種生物信息數據在線過濾系統,其特征在于:所述的虛擬終端可使用B/S或C/S架構,供用戶使用瀏覽器或字符終端登錄使用,對過濾模塊進行配置;其中,所述的過濾模塊采用加入了PMT的Bloom Filter,可對數據進行高效的分組過濾。

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