[發明專利]一種牛FRAS1基因插入/缺失突變的檢測方法及其應用有效
| 申請號: | 202110302857.9 | 申請日: | 2021-03-22 |
| 公開(公告)號: | CN112795667B | 公開(公告)日: | 2023-05-26 |
| 發明(設計)人: | 藍賢勇;李潔;宋恩亮;趙海諭;姜富貴;潘傳英;趙佳寧;費攀鋒;王勇勝;陳宏 | 申請(專利權)人: | 西北農林科技大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 西安通大專利代理有限責任公司 61200 | 代理人: | 范巍 |
| 地址: | 712100 陜*** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 種牛 fras1 基因 插入 缺失 突變 檢測 方法 及其 應用 | ||
1.牛FRAS1基因NC_037333.1:g.340433-340447位15-bp?CTAAACAAAAACAAC缺失突變位點在牛分子標記輔助選擇育種中的應用,其特征在于:所述牛FRAS1基因NC_037333.1:g.340433-340447位15-bp?CTAAACAAAAACAAC缺失突變位點與牛的繁殖性狀顯著相關,其中,具有缺失/缺失基因型DD的個體在繁殖性狀上較優;所述繁殖性狀選自卵巢長、黃體個數中的一種或兩種;所述牛為中國荷斯坦牛。
2.一種牛FRAS1基因插入/缺失多態性的檢測方法在牛分子標記輔助選擇育種中的應用,其特征在于:所述牛FRAS1基因插入/缺失多態性的檢測方法包括以下步驟:
以待測牛基因組DNA為模板,利用PCR擴增包含FRAS1基因外顯子區插入/缺失多態性位點的片段,將擴增產物進行電泳,根據電泳結果鑒定該插入/缺失多態性位點的基因型;所述插入/缺失多態性位點選自牛FRAS1基因NC_037333.1:g.340433-340447位15-bpCTAAACAAAAACAAC缺失突變位點;所述牛FRAS1基因NC_037333.1:g.340433-340447位15-bpCTAAACAAAAACAAC缺失突變位點與牛的繁殖性狀顯著相關,其中,具有缺失/缺失基因型DD的個體在繁殖性狀上較優;
所述繁殖性狀選自卵巢長、黃體個數中的一種或兩種;
所述牛為中國荷斯坦牛。
3.根據權利要求2所述的應用,其特征在于:所述PCR的擴增引物對為:
上游引物:5’-ACAGAATTCTCTCCAGAGCAATGAA-3’
下游引物:5’-CTGTCTTGGAAGAAACAGTGGC-3’。
4.根據權利要求2所述的應用,其特征在于:所述PCR采用的反應程序為:95℃預變性5min;94℃變性30s,68℃退火30s,72℃延伸20s,18個循環,每循環后退火溫度減1℃;94℃變性30s,50℃退火30s,72℃延伸20s,25個循環;72℃延伸10min;所述電泳采用質量濃度為2.5%的瓊脂糖凝膠。
5.根據權利要求2所述的應用,其特征在于:根據電泳結果,所述插入/缺失多態性位點有三個基因型,其中插入/插入基因型II表現為252bp一條帶紋,插入/缺失基因型ID表現為252bp和237bp兩條帶紋,缺失/缺失基因型DD表現為237bp一條帶紋。
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