[發明專利]一種基于AmoebaNet的MRI前列腺癌檢測方法有效
| 申請號: | 202110301547.5 | 申請日: | 2021-03-22 |
| 公開(公告)號: | CN113052812B | 公開(公告)日: | 2022-06-24 |
| 發明(設計)人: | 潘曉光;張娜;王小華;李娟;陳智嬌 | 申請(專利權)人: | 山西三友和智慧信息技術股份有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T5/00;G06T3/40;G06T3/00;G06V10/764;G06V10/774;G06V10/82;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 太原榮信德知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 14119 | 代理人: | 楊凱;連慧敏 |
| 地址: | 030006 山西省*** | 國省代碼: | 山西;14 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 amoebanet mri 前列腺癌 檢測 方法 | ||
1.一種基于AmoebaNet的MRI前列腺癌檢測方法,其特征在于:包括下列步驟:
S100、數據集構建:讀取PROSTATEx數據集的圖片數據與其對應標簽,將其以矩陣形式保存;
S200、數據預處理:對數據進行增強與縮放處理;
S300、數據集劃分:以K折交叉驗證方法將數據集重組為多個訓練集與測試集組合;
S400、模型構建:以AmoebaNet為基礎構建模型,建立多尺度非線性的深度學習網絡,同時加入1*1卷積對數據維度進行提升,并使用全連接對特征進行最終分類;
所述S400模型構建中,基于AmoebaNet-A進行模型構建,首先對數據進行2次1*1卷積,將數據提升到8通道,之后使用AmoebaNet模塊對特征進行提取,每個AmoebaNet-A模塊由5個計算模塊構成,其中第一個計算模塊由一個3*3大小的平均池化層與一個3*3的最大池化層構成,計算完成后,將二者得到的特征進行ADD處理,得到feature map1,該計算模塊的輸入為上一層網絡的輸入;第二個計算模塊進行一次3*3的平均池化,池化的輸入為本層網絡的輸入,計算完畢后將池化結果與上一層的輸入進行ADD,得到feature map2;第三個計算模塊進行一次5*5的卷積與一次3*3的卷積,5*5卷積的輸入為feature map1,3*3卷積的輸入為本層的輸入,之后將二者的結果進行ADD,得到feature map3;第四個計算模塊進行一次3*3的卷積運算,其輸入為feature map1,將計算得到的結果與本層網絡的輸入進行ADD,得到feature map4;第五個計算模塊進行一次3*3的平均池化了一次3*3的卷積運算,池化的輸入為feature map3,卷積運算的輸入為上一層的輸入,完成計算后將二者的計算結果進行ADD,得到feature map5;待全部計算完成后,將feature map2、feature map4、featuremap5進行concate,得到本層網絡提取的特征,經過5個AmoebaNet模塊的特征提取后,使用全連接層完成最后的分類任務;
S500、模型訓練:采用指定參數對網絡進行訓練,使用K折交叉驗證所得的多個組合對模型進行訓練;
S600、模型評價:采用準確率、召回率與F1-Score對模型識別效果進行評價。
2.根據權利要求1所述的一種基于AmoebaNet的MRI前列腺癌檢測方法,其特征在于:所述S100數據集構建中,使用PROSTATEx競賽數據集,共包含前列腺癌病灶特征的圖像84張,良性病例的圖像280張,讀取所有圖片數據,將其以矩陣方式保存為npy格式,將其標簽也同樣以矩陣方式保存為npy格式,數據矩陣格式為(n,x,y),其中n為數據編號,x與y為數據的二維像素矩陣,標簽矩陣的格式為(n,l),其中n為標簽編號,l為數據標簽,1代表前列腺癌癥圖片,0代表正常圖片,標簽與數據一一對應。
3.根據權利要求1所述的一種基于AmoebaNet的MRI前列腺癌檢測方法,其特征在于:所述S200數據預處理中,采用鏡像變換與對比度變換兩種方式對數據進行增強,鏡像對換方式為將數據基于中心軸,將其兩端對應像素點進行對調,達到鏡像變換的目的,對比度的變換方式為,首先對灰度數據進行歸一化處理,歸一化方式為其中x′i為歸一化后得到的結果,xi為待處理像素點,X為該條數據全部數值的集合,再對歸一化之后的數據分別乘以0.8、0.9、1.1、1.2的系數,計算完成后再次對數據進行歸一化,之后再對數據乘以255,還原圖像,將數據增強后的數據與原始數據混合并隨機打亂,將全部數據縮放到400*400大小。
4.根據權利要求1所述的一種基于AmoebaNet的MRI前列腺癌檢測方法,其特征在于:所述S300數據集劃分中,采用K折交叉驗證方式進行數據集的劃分,將數據集劃分為訓練集、驗證集與測試集,取K=5,集將全部數據平均分為5個數據集,將其編號為數據集a/b/c/d/e,在進行模型訓練時,選取4個數據集作為訓練集進行模型參數訓練,1個數據集作為測試集對模型識別效果進行評估。
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