[發明專利]一種絲狀微生物的染色方法及其用途在審
| 申請號: | 202110273564.2 | 申請日: | 2017-12-29 |
| 公開(公告)號: | CN113155578A | 公開(公告)日: | 2021-07-23 |
| 發明(設計)人: | 明磊強;張大海;楊宗霖;史雅琦 | 申請(專利權)人: | 喬治洛德方法研究和開發液化空氣有限公司 |
| 主分類號: | G01N1/30 | 分類號: | G01N1/30;G01N21/64;G06K9/00 |
| 代理公司: | 北京市中咨律師事務所 11247 | 代理人: | 張莉;林柏楠 |
| 地址: | 法國*** | 國省代碼: | 暫無信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 絲狀 微生物 染色 方法 及其 用途 | ||
1.一種圖像處理方法,包括如下步驟:
(2)高斯濾波處理;
(3)Canny邊緣檢測;
(4)均值濾波處理,優選為圓形均值濾波處理;
(5)主成分分析,去掉非線性結構的邊緣,
所述圖像處理方法任選包括(1)目標照片的輸入;和/或(6)輸出只包含菌絲的圖像,并且統計亮點的個數。
2.如權利要求1所述的方法,其特征在于:
步驟(2)中對輸入圖像進行一次平滑,并把黑白圖片二值化;
步驟(3)中得到圖片的梯度,尋找梯度的極大值點并把這些極大值點連起來;
步驟(4)中將照片中的孤立點、菌體與菌絲分離開,去掉孤立點的點和菌體的點,
優選如下去掉孤立點的點和菌體的點:
(i)采用均值濾波,用每個點周圍的平均亮度代替該點原來的亮度;
(ii)設定一個上閾值和一個下閾值,亮度小于下閾值的認為是孤立點的信號,亮度大于上閾值的認為是菌體的信號;
(iii)去掉圖像中孤立的點和菌體的點;
進一步優選其中上閾值為大約0.20,下閾值為大約0.064;
步驟(5)中如下去掉非線性結構的邊緣:
(i)尋找一個像素點周邊的8個像素點范圍內所有的亮點,優選尋找所述像素點周邊的16個像素點范圍內所有的亮點;
(ii)確定亮點在圖像中的位置,對這些亮點的坐標做PCA(主成分分析),通過PCA兩個特征值的比值,獲知所述點鄰域的線性結構強度;
(iii)設定閾值為0-1,去掉線性結構不夠強的點,優選設定閾值為0.2-0.5;
步驟(6)中通過統計所有剩余亮點的個數,完成菌絲長度的統計。
3.一種電子設備,包括顯示器、一個或多個處理器及存儲器,其特征在于所述存儲器存儲有程序,并且被配置成由所述一個或多個處理器執行權利要要求1或2中的步驟,
其中所述存儲器包括以下程序模塊:
(b)用于高斯濾波處理的程序模塊;
(c)用于含Canny邊緣檢測的程序模塊;
(d)用于通過均值濾波處理的程序模塊,優選用于通過圓形均值濾波處理的程序模塊;
(e)用于通過主成分分析,去掉非線性結構的邊緣的程序模塊,
任選包括(a)用于目標照片輸入的程序模塊;和(f)用于通過輸出只包含菌絲的圖像,并且統計亮點的個數數據的程序模塊。
4.一種計算機可讀存儲介質,包括與權利要求3所述的電子設備結合使用的程序,其特征在于所述程序可被處理器執行以完成權利要求1或2中的步驟。
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