[發明專利]基于胸部CT圖像的EGFR基因突變檢測方法和系統

有效

• 申請號: 202110268251.8
• 申請日: 2021-03-11
• 公開（公告）號: CN113017674B
• 公開（公告）日: 2021-12-31
• 發明（設計）人: 楊曉燕;劉敏
• 申請（專利權）人: 中日友好醫院（中日友好臨床醫學研究所）
• 主分類號: A61B6/03
• 分類號: A61B6/03;G06T7/00;G06T7/11
• 代理公司: 北京預立生科知識產權代理有限公司 11736
• 代理人: 李紅偉;孟祥斌

1.一種基于胸部CT圖像的EGFR基因突變檢測方法，其特征在于，包括：

接收待處理的胸部CT圖像；

從所述胸部CT圖像上提取多個目標影像組學特征的特征變量，其中，每個所述目標影像組學特征，在第一顯著性水平上不具有胸部平掃CT和胸部增強CT的顯著性差異，在第二顯著性水平上具有EGFR突變陽性和EGFR突變陰性的顯著性差異；

根據回歸模型和所述特征變量，得到與所述待處理的胸部CT圖像對應的評分值；和

根據所述評分值，確定所述待處理的胸部CT圖像所屬的肺癌患者EGFR基因突變檢測結果，所述檢測結果反映了所述EGFR基因突變的概率。

2.根據權利要求1所述的基于胸部CT圖像的EGFR基因突變檢測方法，其特征在于，所述從所述胸部CT圖像上提取多個目標影像組學特征的特征變量，包括：對所述待處理的胸部CT圖像進行腫瘤區域分割，得到待處理的胸部CT圖像的腫瘤區域；和

從待處理的胸部CT圖像的腫瘤區域內提取多個目標影像組學特征的特征變量。

3.根據權利要求1所述的基于胸部CT圖像的EGFR基因突變檢測方法，其特征在于，所述目標影像組學特征通過以下方法獲得：

從目標樣本胸部CT圖像集合中的每個樣本胸部CT圖像上分別提取多個影像組學特征的特征變量，所述目標樣本胸部CT圖像集合中的部分樣本胸部CT圖像對應EGFR基因突變陽性，部分樣本胸部CT圖像樣本對應EGFR基因突變陰性；所述目標樣本胸部CT圖像集合中的部分樣本胸部CT圖像為平掃CT圖像，部分樣本胸部CT圖像為增強CT圖像；

對所有影像組學特征，通過進行兩次曼-惠特尼U檢驗篩選出候選影像組學特征，所述候選影像組學特征在第一顯著性水平上不具有胸部平掃CT和胸部增強CT的顯著性差異，在第二顯著性水平上具有EGFR突變陽性和EGFR突變陰性的顯著性差異；和

對所有候選影像組學特征進行特征降維，得到多個目標影像組學特征。

4.根據權利要求3所述的基于胸部CT圖像的EGFR基因突變檢測方法，其特征在于，所述從目標樣本胸部CT圖像集合中的每個樣本胸部CT圖像上分別提取多個影像組學特征的特征變量；包括：

對目標樣本胸部CT圖像集合中的每個樣本胸部CT圖像進行腫瘤分割，得到每個樣本胸部CT圖像的腫瘤區域；和

從每個樣本胸部CT圖像的腫瘤區域內分別提取多個影像組學特征的特征變量。

5.根據權利要求3所述的基于胸部CT圖像的EGFR基因突變檢測方法，其特征在于，所述對所有候選影像組學特征進行特征降維，得到多個目標影像組學特征，包括：

針對所有候選影像組學特征，計算其中的每一對影像組學特征的皮爾森相關系數r；

對于|r|大于預設值的每一對影像組學特征，保留其中在EGFR突變陽性和EGFR突變陰性上差異顯著性較大的影像組學特征，保留的影像組學特征和|r|小于等于預設值的每一對影像組學特征組成低相關性影像組學特征集合；和

在所述低相關性影像組學特征集合中，采用Boruta算法進行篩選，得到多個目標影像組學特征。

6.根據權利要求1所述的基于胸部CT圖像的EGFR基因突變檢測方法，其特征在于，所述根據所述評分值，確定所述待處理的胸部CT圖像所屬的肺癌患者EGFR基因突變檢測結果，所述檢測結果反映了所述EGFR基因突變的概率，包括：

將所述評分值與預設的評分截斷值進行比較，根據比較結果確定所述待處理的胸部CT圖像所屬的肺癌患者EGFR基因突變概率高或EGFR基因突變概率低。