[發明專利]一對用于黃瓜微型化性狀鑒定的SNP標記的引物、試劑盒、應用和方法

在審

• 申請號: 202110263761.6
• 申請日: 2021-03-11
• 公開（公告）號: CN112921109A
• 公開（公告）日: 2021-06-08
• 發明（設計）人: 婁群峰;宋蒙飛;付文苑;陳勁楓
• 申請（專利權）人: 南京農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京化育知識產權代理有限公司 11833
• 代理人: 涂琪順

本發明提供了一對用于黃瓜微型化性狀鑒定的SNP標記的引物、試劑盒、應用和方法，屬于分子生物學技術領域。本發明提供的用于黃瓜微型化性狀鑒定的SNP標記的引物，包括正向引物F和反向引物R；所述正向引物F的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示；所述反向引物R的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示。本發明提供的用于黃瓜微型化性狀鑒定的SNP標記的引物可快速對黃瓜微型化性狀進行鑒定，能夠有效解決表型鑒定結果可靠性低、費時、成本高、難度大等問題。

技術領域

本發明屬于分子生物學技術領域，具體涉及一對用于黃瓜微型化性狀鑒定的SNP標記的引物、試劑盒、應用和方法。

背景技術

黃瓜屬葫蘆科甜瓜屬一年生蔓生草本植物，是世界上十大蔬菜作物之一。盡管黃瓜的地理分布十分廣泛，但其遺傳基礎狹窄，導致現有可用于各種表型基因研究的材料較為缺乏，阻礙了黃瓜功能基因組學和遺傳研究工作的快速發展。株型是指植物體的形態特征及空間排列方式，決定著植株的受光姿態，直接影響作物的光合效率。株型也是決定作物栽培方式的主要因子。因此，理想株型的選育對作物高效生產具有重要的理論和實踐意義。目前生產中栽培的黃瓜多為蔓生品種，主蔓長度在2～3米左右。但因其生長密集，葉片堆疊程度大，常常會影響光合作用，降低光合產量，而且也易造成病害的產生和傳播，最終影響栽培黃瓜的經濟效益。目前生產上常常投入較多的人力進行綁蔓、打枝、疏葉摘心等工作，增加了生產成本。因此，株高適宜，葉片分布合理，可滿足不同栽培條件的黃瓜理想株型的選育是黃瓜高產育種的一個重要方向，對黃瓜高效生產具有重要的理論和實踐意義。而利用常規育種方法的表型鑒定來選育具有微株型表型的黃瓜品種具有耗時長，成本高、難度大等缺點。因此，迫切需要一種簡單有效的黃瓜微型化性狀鑒定方法。

發明內容

為了解決上述問題，本發明提供了一對用于黃瓜微型化性狀鑒定的SNP標記的引物、試劑盒、應用和方法。本發明提供的用于黃瓜微型化性狀鑒定的SNP標記的引物可快速對黃瓜微型化性狀進行鑒定。

為了實現上述目的，本發明提供如下技術方案：

本發明提供了一對用于黃瓜微型化性狀鑒定的SNP標記的引物，包括正向引物F和反向引物R；

所述正向引物F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；

所述反向引物R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

優選的，SNP位點的物理位置為黃瓜‘Chinese Long’基因組v2版本參考序列黃瓜7號染色體17507331核苷酸位點。

本發明提供了一種用于黃瓜微型化性狀鑒定的試劑盒，所述試劑盒包括上述技術方案中所述的引物。

本發明提供了上述技術方案中所述的引物或上述技術方案中所述的試劑盒在篩選黃瓜微型化性狀的輔助育種中的應用。

本發明提供了上述技術方案中所述的引物或上述技術方案中所述的試劑盒在黃瓜微型化性狀鑒定中的應用。

本發明提供了一種基于上述技術方案中所述的引物或上述技術方案中所述試劑盒的鑒定黃瓜微型化性狀的方法，包括如下步驟：以待檢黃瓜基因組DNA為模板，利用上述技術方案中所述的引物或上述技術方案中所述試劑盒進行PCR擴增，得到擴增產物，對待測黃瓜進行基因分型；根據基因分型的結果進行黃瓜微型化性狀的判定。

優選的，所述基因分型的方法包括：當SNP位點的基因型為TT時，鑒定為微型化黃瓜；當SNP位點的基因型為CC時，鑒定為正常株型黃瓜；當SNP位點的基因型為TC時，鑒定為中間株型黃瓜。

有益效果：