[發明專利]一種水稻抗紋枯病基因SBR11及其分子標記和應用

有效

• 申請號: 202110241489.1
• 申請日: 2021-03-04
• 公開（公告）號: CN112831503B
• 公開（公告）日: 2022-11-18
• 發明（設計）人: 王雨;左示敏;薛薌;陳宗祥;馮志明;胡珂鳴;潘學彪
• 申請（專利權）人: 揚州大學
• 主分類號: C12N15/29
• 分類號: C12N15/29;C07K14/415;C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 南京縱橫知識產權代理有限公司 32224
• 代理人: 王玉

本發明公開了一種水稻抗紋枯病基因SBR11及其分子標記和應用，屬于作物分子生物學技術領域。本發明通過遺傳轉化證實了SBR11基因正調控水稻對紋枯病的抗性，通過等位基因功能和單倍型分析，證實了該基因編碼區190，926位點SNP導致基因功能變異，進而本發明也開發了兩個分子標記用于檢測這兩個位點基因型，所述分子標記包括SNP位點190和SNP位點926，利用該分子標記可以檢測SBR11等位基因并進行選擇，為水稻抗病分子設計育種提供更多的資源，加快育種進程。

技術領域

本發明屬于作物分子生物學技術領域，涉及一種水稻抗紋枯病基因SBR11及其分子標記和應用。

背景技術

水稻(Oryza sativa L.)是我國最重要的糧食作物。由強腐生性真菌立枯絲核菌(Rhizoctonia solani Kühn)引起的水稻紋枯病是我國水稻三大病害之一。紋枯病由于其發生面積廣、防治難度大，造成的產量損失位于水稻各病害之首。長期以來，對紋枯病的防治主要依賴于化學藥劑，但效果一直不佳。推廣和培育抗病品種是控制病害最經濟有效的措施。水稻對紋枯病的抗性屬于數量性狀抗性，受多基因或QTL(Quantitative traitlocus)控制，克隆抗紋枯病相關基因具有重要的理論價值和實際意義。

發明內容

本發明所要解決的技術問題是克服現有技術的缺陷，提供一種稻抗紋枯病基因SBR11及其分子標記和應用，本發明通過遺傳轉化證實了SBR11基因正調控水稻對紋枯病的抗性。通過等位基因功能和單倍型分析，證實了該基因編碼區190，926位點SNP導致基因功能變異，進而本發明也開發了兩個分子標記用于檢測這兩個位點基因型。

本發明的技術方案為：

本發明的目的之一為提供一種水稻抗紋枯病基因SBR11，其為以下任一：

(1)所述SBR11的全長序列如SEQ ID NO.1所示；或

(2)SEQ ID NO.1所示核苷酸序列經取代、缺失和/或增加一個或幾個核苷酸編碼相同功能蛋白的基因；或

(3)所述SBR11的全長序列為SEQ ID NO.1所示序列的第190位堿基由T變為A；或

(4)所述SBR11的全長序列為SEQ ID NO.1所示序列的第926位堿基由G變為A；或

(5)所述SBR11的全長序列為SEQ ID NO.1所示序列的第1492位堿基由A變為G。

本發明的目的之二為提供上述的水稻抗紋枯病基因SBR11編碼的蛋白質，所述蛋白質的氨基酸序列具有：

(1)如SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列；或

(2)SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列經取代、缺失和/或增加一個或多個氨基酸且具有同等活性的由2)衍生的蛋白質。

本發明的目的之三為提供含有上述水稻抗紋枯病基因SBR11的生物材料，所述生物材料為載體、轉基因細胞系、工程菌、宿主細胞或表達盒。

本發明的目的之四為提供上述的水稻抗紋枯病基因SBR11、蛋白質或生物材料在水稻抗紋枯病育種中的應用。

本發明的目的之五為提供用于檢測水稻抗紋枯病基因SBR11的分子標記，所述分子標記包括SNP位點190和SNP位點926，所述SNP位點190位于SBR11編碼區第190位堿基，該堿基SNP變異，其多態性為T/A；所述SNP位點926位于SBR11編碼區第926位堿基，該堿SNP變異，其多態性為G/A。