[發(fā)明專利]用于構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)的接頭和測(cè)序文庫(kù)的構(gòu)建方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202110147807.8 | 申請(qǐng)日: | 2018-12-06 |
| 公開(公告)號(hào): | CN112852802A | 公開(公告)日: | 2021-05-28 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 許明炎;張曉妮 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 深圳海普洛斯醫(yī)療器械有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12N15/11 | 分類號(hào): | C12N15/11;C12Q1/6806;C40B50/06;C40B40/06 |
| 代理公司: | 深圳舍穆專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 44398 | 代理人: | 黃賢炬 |
| 地址: | 518000 廣東省深圳市龍華區(qū)觀湖*** | 國(guó)省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 構(gòu)建 序文 接頭 方法 | ||
1.一種用于構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)的接頭,其特征在于:通過第一核苷酸單鏈與第二核苷酸單鏈部分結(jié)合而形成,所述第一核苷酸單鏈包括第一通用引物序列、第一測(cè)序引物序列和位于所述第一通用引物序列與所述第一測(cè)序引物序列之間的單分子標(biāo)簽,所述第二核苷酸單鏈包括第二通用引物序列、與所述第一測(cè)序引物序列部分互補(bǔ)的第二測(cè)序引物序列和位于所述第二通用引物序列與所述第二測(cè)序引物序列之間的樣本標(biāo)簽,所述第一通用引物序列為AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC,所述第一測(cè)序引物為ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT,所述第二通用引物序列為ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG,所述第二測(cè)序引物為GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC。
2.如權(quán)利要求1所述的接頭,其特征在于:
所述單分子標(biāo)簽為用于標(biāo)記不同DNA片段的隨機(jī)的堿基序列。
3.如權(quán)利要求1所述的接頭,其特征在于:
所述樣本標(biāo)簽為用于區(qū)別不同樣本的固定的堿基序列。
4.如權(quán)利要求1或2所述的接頭,其特征在于:
所述單分子標(biāo)簽的長(zhǎng)度為4bp至20bp。
5.如權(quán)利要求1或3所述的接頭,其特征在于:
所述樣本標(biāo)簽的長(zhǎng)度為4bp至20bp。
6.如權(quán)利要求1所述的接頭,其特征在于:
所述第一核苷酸單鏈與所述第二核苷酸單鏈通過退火而部分結(jié)合,所述第二核苷酸單鏈的5’端經(jīng)磷酸基團(tuán)修飾。
7.如權(quán)利要求1所述的接頭,其特征在于:
所述接頭為Y字型接頭,所述第一測(cè)序引物與所述第二測(cè)序引物部分結(jié)合。
8.如權(quán)利要求1或7所述的接頭,其特征在于:
所述單分子標(biāo)簽和所述樣本標(biāo)簽分別位于所述接頭未結(jié)合部分,所述第一通用引物序列和所述第二通用引物序列位于所述接頭未結(jié)合部分末端。
9.一種測(cè)序文庫(kù)的構(gòu)建方法,其特征在于,
包括:
(a)提取DNA;
(b)將DNA進(jìn)行片段化處理;
(c)對(duì)所獲得的DNA片段進(jìn)行末端修復(fù)和加A尾;
(d)在步驟(c)所獲得的DNA片段兩端連接含有權(quán)利要求1-8中任一項(xiàng)所述的接頭;
(e)以步驟(d)獲得的DNA接頭連接產(chǎn)物為模板,以兩端接頭的通用引物為正反向引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增并得到PCR產(chǎn)物;以及
(f)進(jìn)行PCR產(chǎn)物純化。
10.如權(quán)利要求9所述的測(cè)序文庫(kù)的構(gòu)建方法,其特征在于:
在所述步驟(f)中,利用磁珠法對(duì)所述PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化。
該專利技術(shù)資料僅供研究查看技術(shù)是否侵權(quán)等信息,商用須獲得專利權(quán)人授權(quán)。該專利全部權(quán)利屬于深圳海普洛斯醫(yī)療器械有限公司,未經(jīng)深圳海普洛斯醫(yī)療器械有限公司許可,擅自商用是侵權(quán)行為。如果您想購(gòu)買此專利、獲得商業(yè)授權(quán)和技術(shù)合作,請(qǐng)聯(lián)系【客服】
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