[發(fā)明專利]一種用于預(yù)測肝癌患者切除術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險的生物標(biāo)志物組合、試劑盒

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202110100430.0
• 申請日: 2021-01-25
• 公開（公告）號: CN112831562A
• 公開（公告）日: 2021-05-25
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 鄭慧琳;錢曉雯;張蕾;萬健;范容麗;王麥秋
• 申請（專利權(quán)）人: 浙江科技學(xué)院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11;G16B25/00;G16B40/20
• 代理公司: 杭州天勤知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 33224
• 代理人: 沈金龍

本發(fā)明公開了一種用于預(yù)測肝癌患者切除術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險的生物標(biāo)志物組合、試劑盒。所述生物標(biāo)志物組合包括12種基因，分別為：CD79A、TMEM200C、AL138828.1、HHIP、CDH3、ELN、GULP1、PI15、SLC25A48、SELP、IGHM和SFRP1。本發(fā)明構(gòu)建并驗(yàn)證了由12個基因組成的預(yù)測肝癌患者切除術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險的模型。另外，通過分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)獲得的結(jié)果為肝癌復(fù)發(fā)的生物標(biāo)記物提供了新的研究方向，并為肝癌患者的個體化治療提供了新的可能性。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)檢測技術(shù)領(lǐng)域，特別是涉及一種用于預(yù)測肝癌患者切除術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險的生物標(biāo)志物組合、試劑盒。

背景技術(shù)

肝癌是全球最常見的惡性腫瘤之一，其發(fā)病率與病死率分別排名第六位與第四位。據(jù)統(tǒng)計(jì)，我國每年肝癌的發(fā)病人數(shù)以及肝癌致死的人數(shù)均超過全球發(fā)病及死亡人數(shù)的50％。肝癌常見的治療方法為手術(shù)切除，然而肝癌患者的術(shù)后復(fù)發(fā)率極高，術(shù)后5年內(nèi)的復(fù)發(fā)率高達(dá)60％-70％。肝癌的高復(fù)發(fā)性是肝癌患者術(shù)后預(yù)后差的主要原因。因此，預(yù)測肝癌患者切除術(shù)后的復(fù)發(fā)風(fēng)險，對復(fù)發(fā)風(fēng)險高的肝癌患者進(jìn)行及早鑒定，對其采取重點(diǎn)檢測并實(shí)施早期干預(yù)，可延長肝癌患者術(shù)后的預(yù)后。

高通量測序技術(shù)發(fā)展使得測序的費(fèi)用和時間大大縮短，極大提高了分子層面數(shù)據(jù)的可獲取性與可利用性。對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，尋找與肝癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的分子生物標(biāo)志物，并建立相應(yīng)的預(yù)測模型，可為臨床診斷與治療提供幫助，具有一定的應(yīng)用價值。

公開號為CN102298053A的發(fā)明申請公開了一種檢測肝細(xì)胞肝癌患者接受切除術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險的多抗體試劑盒，所述試劑盒具有8個可分別單獨(dú)用于免疫組化檢測的第一抗體，所述的8個第一抗體所檢測的蛋白分子分別為：CD80，B7-DC，HLA-DR，F(xiàn)asL，Bcl-2，CK19，Ki-67和Cyclin D1。

公開號為CN110189824A的發(fā)明申請公開了一種原發(fā)性肝癌根治切除術(shù)的預(yù)后情況分組方法、裝置和系統(tǒng)，基于細(xì)胞角蛋白19(CK19)和磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3(GPC3)的聯(lián)合檢測、腫瘤個數(shù)和脈管瘤栓為指標(biāo)的對擬行或已行腫瘤根治性切除術(shù)的原發(fā)性肝癌患者的術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險進(jìn)行評估的方法。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明中，發(fā)明人從TCGA公共數(shù)據(jù)庫中肝癌病人的RNA-Seq的基因表達(dá)數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù)出發(fā)，從轉(zhuǎn)錄組中獲得一種12-基因表達(dá)模型，該模型可預(yù)測肝癌患者的復(fù)發(fā)風(fēng)險，有助于臨床對肝癌患者的治療指導(dǎo)。

一種用于預(yù)測肝癌患者切除術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險的生物標(biāo)志物組合，所述生物標(biāo)志物組合包括12種基因，分別為：CD79A、TMEM200C、AL138828.1、HHIP、CDH3、ELN、GULP1、PI15、SLC25A48、SELP、IGHM和SFRP1。

其中，切除術(shù)使用的手術(shù)切除方式為R0切除。

一種用于預(yù)測肝癌患者切除術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險的試劑盒，包括：用于分別檢測個體中CD79A、TMEM200C、AL138828.1、HHIP、CDH3、ELN、GULP1、PI15、SLC25A48、SELP、IGHM和SFRP1共12種基因表達(dá)水平的檢測試劑。

檢測試劑包括用RT-PCR、基因表達(dá)系列分析、表達(dá)序列標(biāo)簽、基因芯片或者轉(zhuǎn)錄組測序方法檢測各基因表達(dá)水平的試劑。也就是說，只要是能夠用于檢測基因表達(dá)水平的方法都可以使用。

優(yōu)選的，使用RT-PCR檢測基因表達(dá)水平，所述的試劑盒，包括：

(1)用于提取樣本中總mRNA的mRNA提取試劑；

(2)用于將mRNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA的逆轉(zhuǎn)錄試劑；

(3)分別用于定量擴(kuò)增各基因的引物對。