[發(fā)明專(zhuān)利]一種與甜瓜網(wǎng)紋性狀共分離的CAPS分子標(biāo)記及應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202110087190.5
• 申請(qǐng)日: 2021-01-22
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN112662803B
• 公開(kāi)（公告）日: 2023-07-25
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 胡建斌;梁曉雪;李瓊;高路銀;李文龍
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 鄭州德勤知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 41128
• 代理人: 王莉

本發(fā)明提供了一種與甜瓜網(wǎng)紋性狀共分離的CAPS分子標(biāo)記，核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示。SEQ?ID?NO.1所示序列的第54位為SNP位點(diǎn)，且SNP位點(diǎn)為T(mén)/A。所述SNP位點(diǎn)上有甜瓜網(wǎng)紋的堿基為A、無(wú)甜瓜網(wǎng)紋的堿基為T(mén)。本發(fā)明還提供了一種利用上述CAPS分子標(biāo)記鑒定甜瓜網(wǎng)紋有無(wú)的方法。所以，利用上述CAPS分子標(biāo)記能夠鑒定網(wǎng)紋甜瓜，將網(wǎng)紋甜瓜和非網(wǎng)紋甜瓜區(qū)分開(kāi)，可以實(shí)現(xiàn)在苗期判斷網(wǎng)紋甜瓜品種，輔助快速篩選所需要的個(gè)體，加快網(wǎng)紋甜瓜的選育過(guò)程。本發(fā)明還提供一種上述CAPS分子標(biāo)記的檢測(cè)引物。本發(fā)明還提供一種上述CAPS分子標(biāo)記及對(duì)應(yīng)的檢測(cè)引物或其檢測(cè)試劑的應(yīng)用。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于生物分子標(biāo)記領(lǐng)域，具體涉及一種與甜瓜網(wǎng)紋性狀共分離的CAPS分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

甜瓜(Cucumis?melo?L.)是主要的葫蘆科蔬菜作物之一，栽培面積廣泛，具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。中國(guó)是甜瓜生產(chǎn)大國(guó)，甜瓜在果蔬生產(chǎn)中占有重要地位。

近年來(lái)，分子輔助選擇育種技術(shù)得到了廣泛的開(kāi)發(fā)及應(yīng)用，能夠在分子水平上快速篩選所需要的個(gè)體，極大的縮短了育種時(shí)間，對(duì)育種工作有著極大的推動(dòng)。能否找到與性狀緊密連鎖的標(biāo)記，能否在不同材料中使用，是分子標(biāo)記輔助選擇育種成功與否的標(biāo)志。

網(wǎng)紋甜瓜(Cucumis?melo?L.var.reticulatus?Naud.)主要是指葫蘆科(Cucurbitaceae)甜瓜屬甜瓜種厚皮甜瓜亞種中粗皮甜瓜變種與卡沙巴變種的雜交種，經(jīng)選育而成的品種。網(wǎng)紋甜瓜作為厚皮甜瓜中的精品，不僅因?yàn)槠渚哂休^高的糖度和品質(zhì)、獨(dú)特的口感和風(fēng)味，網(wǎng)紋甜瓜還擁有優(yōu)美的網(wǎng)狀裂紋。網(wǎng)狀裂紋不僅增強(qiáng)了網(wǎng)紋甜瓜的觀賞性，也大大提高了網(wǎng)紋甜瓜的商品價(jià)值。目前關(guān)于甜瓜網(wǎng)紋的研究仍主要集中在網(wǎng)紋形成發(fā)育分析，有關(guān)甜瓜網(wǎng)紋調(diào)控基因的精細(xì)定位、克隆及其遺傳結(jié)構(gòu)研究還未見(jiàn)報(bào)道，也未能找到與甜瓜網(wǎng)紋性狀共分離的分子標(biāo)記。

發(fā)明內(nèi)容

有鑒于此，本發(fā)明有必要提供一種與甜瓜網(wǎng)紋性狀共分離的CAPS分子標(biāo)記及其應(yīng)用，用于在苗期判斷甜瓜網(wǎng)紋是否存在，加快網(wǎng)紋甜瓜的選育過(guò)程。

具體地，本發(fā)明提供一種與甜瓜網(wǎng)紋性狀共分離的CAPS分子標(biāo)記，命名為分子標(biāo)記NDCAPS，其核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示。

基于上述，SNP位點(diǎn)位于如SEQ?ID?NO.1所示序列的第54位，且所述SNP位點(diǎn)為T(mén)/A。

基于上述，所述SNP位點(diǎn)上，有甜瓜網(wǎng)紋的堿基為A，無(wú)甜瓜網(wǎng)紋的堿基為T(mén)。

本發(fā)明還提供一種上述CAPS分子標(biāo)記或其檢測(cè)試劑在鑒定甜瓜網(wǎng)紋有無(wú)中的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供一種上述CAPS分子標(biāo)記或其檢測(cè)試劑在篩選甜瓜網(wǎng)紋品種中的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供一種與甜瓜網(wǎng)紋性狀共分離的CAPS分子標(biāo)記的檢測(cè)引物，包括一對(duì)檢測(cè)引物對(duì)，正向引物的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.2所示，反向引物的核苷酸序列如SEQ?IDNO.3所示。

本發(fā)明還提供一種包含上述檢測(cè)引物的試劑盒。

本發(fā)明還提供一種上述檢測(cè)引物或試劑盒在鑒定甜瓜網(wǎng)紋有無(wú)中的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供一種上述檢測(cè)引物或試劑盒在篩選甜瓜網(wǎng)紋品種中的應(yīng)用。

本發(fā)明還提供一種鑒定甜瓜網(wǎng)紋有無(wú)的方法，包括：利用上述的CAPS分子標(biāo)記對(duì)待測(cè)苗期甜瓜網(wǎng)紋品種進(jìn)行分型，根據(jù)分型結(jié)果判斷待測(cè)苗期甜瓜網(wǎng)紋品種是否有網(wǎng)紋。