[發明專利]一種功能肽推薦方法、裝置和計算設備

有效

• 申請號: 202110080336.3
• 申請日: 2021-01-21
• 公開（公告）號: CN112786141B
• 公開（公告）日: 2023-07-14
• 發明（設計）人: 王天元;翟珂;陳壯志;賴力鵬;溫書豪;馬健
• 申請（專利權）人: 北京晶泰科技有限公司
• 主分類號: G16H20/10
• 分類號: G16H20/10;G16B40/30;G06N3/088
• 代理公司: 北京思睿峰知識產權代理有限公司 11396
• 代理人: 謝建云;趙愛軍

本發明公開了一種功能肽推薦方法，適于在計算設備中執行。該方法包括：根據預先訓練的功能肽生成模型生成多個候選肽段；采用預先訓練的功能肽預測模型對所述多個候選肽段進行處理，得到各候選肽段的性能分數；以及根據各候選肽段的性能分數確定至少一個目標肽段進行推薦。本發明還一并公開了對應的功能肽推薦裝置和適于執行該方法的計算設備。

技術領域

本發明涉及藥物虛擬篩選領域，尤其涉及一種功能肽推薦方法、裝置和計算設備。

背景技術

目前，癌癥已經成為人類健康和生命安全的最大威脅。由于傳統抗癌藥物的低選擇性、不同程度的副作用及癌細胞通過自身變異以及環境、藥物誘發其變異導致癌細胞產生抗藥性，在很大程度上加劇了人類對新型抗癌藥物需求的緊迫性。研究結果表明，很多陽離子抗菌肽(Antimicrobial?peptides，AMPs)不僅具有高效的殺菌作用，還具有抗癌及抗病毒活性。具有抗癌活性的陽離子肽被稱作抗癌肽(Anticancer?peptides，ACPs)?？拱╇囊愿叨缺Ｊ氐募毎樽饔冒悬c，通過破壞細胞膜的完整性殺滅癌細胞，針對癌細胞表現出高效、廣譜的活性及特異性。

抗腫瘤多肽大多是帶正電的兩親性分子，并且有著明顯的親疏水界面，它們與細胞的作用首先是通過自身的正電性與帶負電的腫瘤細胞膜發生靜電吸引，進而相互接觸；一旦接觸到細胞，多肽的疏水面就會與細胞膜所結合，將多肽自身插入并融合到細胞膜內部去；最終，多肽破壞細胞膜的完整性導致細胞死亡，或者進入細胞內部通過其它方式引發細胞死亡。

抗癌肽的諸多特點一直在吸引著科學家們對它的開發利用，盡管可以通過傳統的實驗方法來判斷某條蛋白質是否具有抗癌肽的活性，但因其過程繁瑣且耗時長而受到諸多限制，因此需要提供一種更低成本且省時的抗癌肽推薦方法。

發明內容

為此，本發明提供了一種功能肽推薦方法、裝置和計算設備，以力圖解決或至少緩解上面存在的一個問題。

本發明提供了一種功能肽推薦方法，適于在計算設備中執行，該方法包括：根據預先訓練的功能肽生成模型生成多個候選肽段；采用預先訓練的功能肽預測模型對所述多個候選肽段進行處理，得到各候選肽段的性能分數；根據各候選肽段的性能分數確定至少一個目標肽段進行推薦。

可選地，在根據本發明的功能肽推薦方法中，根據各候選肽段的性能分數確定至少一個目標肽段進行推薦包括：根據預設的功能肽的至少一個理化性質的區間值，生成各候選肽段的至少一個理化性質標簽；根據各候選肽段的性能分數和至少一個理化性質標簽確定至少一個目標肽段進行推薦。

可選地，在根據本發明的功能肽推薦方法中，根據各候選肽段的性能分數和至少一個理化性質標簽確定至少一個目標肽段進行推薦的步驟包括：根據各候選肽段的至少一個理化性質標簽對多個候選肽段進行過濾，得到過濾后的肽段；根據過濾后的肽段的性能分數確定至少一個目標肽段進行推薦。

可選地，在根據本發明的功能肽推薦方法中，根據各候選肽段的性能分數和至少一個理化性質標簽確定至少一個目標肽段進行推薦的步驟包括：根據各候選肽段的性能分數和至少一個理化性質標簽生成各候選肽段的評分等級，并根據該評分等級確定至少一個目標肽段進行推薦。

可選地，在根據本發明的功能肽推薦方法中，預設的功能肽的至少一個理化性質的區間值通過對多個已知活性肽進行統計得到。

可選地，在根據本發明的功能肽推薦方法中，還包括功能肽生成模型的訓練步驟：采用已知的多個多肽數據對初始的功能肽生成模型進行無監督訓練，得到預訓練模型，多條多肽數據包括功能肽和非功能肽；采用已知的多個功能肽數據對預訓練模型進行遷移學習，得到預先訓練的功能肽生成模型。