[發(fā)明專利]一種具有可解釋性的醫(yī)學(xué)圖像深度學(xué)習(xí)方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110075543.X | 申請日: | 2021-01-20 |
| 公開(公告)號: | CN112862089B | 公開(公告)日: | 2023-05-23 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 王好謙;孫中治;楊芳 | 申請(專利權(quán))人: | 清華大學(xué)深圳國際研究生院 |
| 主分類號: | G06N3/08 | 分類號: | G06N3/08;G06N3/0464;G06T7/00;G16H50/20 |
| 代理公司: | 深圳新創(chuàng)友知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44223 | 代理人: | 王震宇 |
| 地址: | 518055 廣東省深圳市*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 具有 解釋性 醫(yī)學(xué) 圖像 深度 學(xué)習(xí)方法 | ||
1.一種具有可解釋性的醫(yī)學(xué)圖像深度學(xué)習(xí)方法,其特征在于,包括如下步驟:
1)對獲取的原始醫(yī)學(xué)圖像進行圖像增強,增加圖像數(shù)量,作為輸入圖像輸入到網(wǎng)絡(luò)之中;
2)對所述輸入圖像利用VGG-16網(wǎng)絡(luò)提取圖像特征,得到符合中間臨床特征的醫(yī)學(xué)預(yù)測圖;對于輸入的圖像,采用VGG-16網(wǎng)絡(luò)的下采樣層,生成對應(yīng)五層卷積即五種尺寸的特征提取圖,將第一層卷積得到的特征圖舍去,取其中后四層作為上采樣利用的特征提取層,其中第二層作為邊界分割的特征提取層,后三層作為整體圖像結(jié)構(gòu)的特征提取層;
3)將獲得的預(yù)測圖與標(biāo)準(zhǔn)中間臨床特征相對比,計算二者的交叉熵?fù)p失Lossx,y,調(diào)整VGG-16網(wǎng)絡(luò)參數(shù),使計算的交叉熵?fù)p失小于設(shè)定的閾值,從而完成網(wǎng)絡(luò)的學(xué)習(xí),使VGG-16網(wǎng)絡(luò)得到的預(yù)測圖符合關(guān)于比對結(jié)果的要求。
2.如權(quán)利要求1所述的醫(yī)學(xué)圖像深度學(xué)習(xí)方法,其特征在于,步驟1)中,所述進行圖像增強并增加圖像數(shù)量包括反轉(zhuǎn)、旋轉(zhuǎn)和隨機通道偏移三種方法;將輸入圖像統(tǒng)一剪裁為256*256大小,同時將每8張二維圖像設(shè)置為一組,并編號為0-7,同時將8張圖片作為一組輸入網(wǎng)絡(luò)之中,避免學(xué)習(xí)梯度的反復(fù)跳動并加快網(wǎng)絡(luò)特征學(xué)習(xí)收斂的速率。
3.如權(quán)利要求1所述的醫(yī)學(xué)圖像深度學(xué)習(xí)方法,其特征在于,步驟2)中,將輸入圖片的256尺寸,分別采樣為128、56、28、14、7。
4.如權(quán)利要求1至3任一項所述的醫(yī)學(xué)圖像深度學(xué)習(xí)方法,其特征在于,步驟2)具體包括以下步驟:
2.1)對于得到的特征圖,首先利用位置敏感特征提取結(jié)構(gòu)對感興趣目標(biāo)區(qū)域標(biāo)出目標(biāo)檢測框,并將目標(biāo)檢測框設(shè)定為各通道中檢測框最大的尺寸;
2.2)使用卷積結(jié)構(gòu)提取整體圖像特征和邊界特征;
2.3)對提取的整體圖像特征和邊界特征進行歸一化,而后將二者特征值相結(jié)合;
2.4)將通過不同尺寸的特征圖經(jīng)過上采樣得到的預(yù)測圖按照人為確定的比例concat在一起。
5.如權(quán)利要求4所述的醫(yī)學(xué)圖像深度學(xué)習(xí)方法,其特征在于,所述比例對應(yīng)于第二層至第五層分別為0.1、0.05、0.25、0.6。
6.如權(quán)利要求4所述的醫(yī)學(xué)圖像深度學(xué)習(xí)方法,其特征在于,步驟2.2)中,每一層采用如下處理:
對于整體圖像特征的提取,其loss函數(shù)取Dice?Loss,其公式定義如下:
其中|X∩Y|是X和Y之間的交集,|X|和|Y|分別表示X和Y的元素的個數(shù),其中,分子的系數(shù)為2;i代表選取的第i層特征圖;
對邊界特征的提取采用對距離特征學(xué)習(xí)的方式,即對內(nèi)部點到邊界的距離進行學(xué)習(xí),而后運用Hausdorff?loss函數(shù)進行優(yōu)化,其公式如下:
HausdorffLoss(i)=dH(X,Y)=max{dXY,dYX}
其中dH(*)指的是括號中兩集合之間的特征點差距大小,X,Y即為比較的兩集合,dXY與dYX分別指X中特征點到集合Y的最小距離與Y中特征點到X中的最小距離。
7.如權(quán)利要求6所述的醫(yī)學(xué)圖像深度學(xué)習(xí)方法,其特征在于,步驟2.3)中,將邊界距離特征以及整體像素特征分別進行歸一化,而后按照二者在總面積上所占的概率進行結(jié)合,其公式如下:
Loss(i)=αDiceloss(i)+(1-α)HausdorffLoss(i)
其中,α代表非邊界像素在總體像素中所占的比例;
總體Loss函數(shù)也為二者按權(quán)重相加之和:
其中,y-,y+分別代表在邊界和不在邊界的像素集合;P(ypre,j=0)以及P(ypre,j=1)代表表示預(yù)測像素類別在groudtruth像素j處的概率。
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